مطالعه ی فیلوژنتیکی سویه های E.coli مولد عفونت ادراری از بیمارستان بقیـه¬الله با استفاده از روش Quadruplex PCR

تعداد151 صفحه در فایل word

چکیده

اشریشیا کلی یکی از بیش ترین گونه هاي باکتریایی است که از عفونت هاي انسانی جدا شده و یکی از مهمترین دلایل ایجاد کننده عفونت هاي گوارشی و خارج گوارشی در انسان و دام ها می­باشد. این بیماري ها شامل عفونت هاي کلیه، مثانه، ریه و مننژ می باشند که به نوبه خود ممکن است منجر به بروز سپسیس گردند و یکی از مهمترین عوامل تهدید کننده حیات انسان محسوب می­شوند. عفونت هاي دستگاه ادراري یکی از شایع ترین بیماري هاي عفونی است که اشریشیا کلی مهم ترین عامل ایجاد کننده این عفونت هاست. آنالیزهاي فیلوژنتیکی نشان داده است که سویه هاي اشریشیا کلی در پنج گروه فیلوژنتیک تقسیم (A0, A1, B1, B2, D) می شوند. هدف از این پژوهش تعیین گروه هاي فیلوژنتیک اشریشیا کلی هاي جدا شده از عفونت هاي ادراري بود. جهت این بررسی مطالعه بر روي اشریشیا کلی هاي جدا شده از کشت ادرار بیماران مشکوك به عفونت ادراري انجام شد واز آزمون هاي بیوشیمیایی و میکروبی جهت تعیین هویت باکتري هاي جدا شده استفاده شد. طبقه بندي گروه هاي فیلوژنتیک سویه هاي اشریشیا کلی با استفاده از تکنیک  Multiplex PCRدو ژن  chuA وYjaA و یک قطعه از(TspE4C) DNA انجام شد. بعد از الکتروفورز، سویه ها بر اساس حضور یا عدم حضور ژن ها و قطعه DNA در گروه هاي فیلوژنتیک قرار گرفتند.  از 100 سویه اشریشیا کلی شناسایی شده، شایع ترین گروه هاي فیلوژنتیک شناسایی شده گروه D (34/8%) و بعد از آن به ترتیب گروه­های  A1 33/3)%) و B2 )  25%) و B1 (6/8%) و گروه A0 (0%) می­باشد. برطبق یافته­های این تحقیق، سویه­های بیماری­زای خارج روده­ای اشریشیا کلی جدا شده از عفونت­های دستگاه ادراری بیشتر متعلق به گروه D می­باشد و گروه A1  قرابت نزدیکی با آن دارد. نتایج نشان داد که روش مولکولی فیلوژنتیک تایپینگ بر پایه PCR ژن ها و قطعه DNA روشی ساده و سریع در تایپینگ سویه هاي اشریشیا کلی است. همچنین این تکنیک جهت کسب اطلاعات بیشتر راجع به پاتوژنز عفونت­ها، کنترل عفونت هاي بیمارستانی و مطالعات اپیدمیولوژیکی کاربرد دارد.

کلمات کلیدی: اشریشیا کلی، فیلوژنتیک، الکتروفورز، عفونت ادراری، تکنیک پی. سی. آر.