فصل اول: بررسی منابع |
|
1-1-مقدمه |
1 |
1-2- تنظیم در سطح ترجمه |
2 |
1-2-2- مکانیسمهای تنظیم گر در سطح ترجمه |
3 |
1-3- ترجمه |
4 |
1-4- ترجمه و پیشرفت متاستاز |
5 |
1-4-1- تشکیل تومور و پیشروی متاستاز |
6 |
1-5- ترجمه وبدخیمی |
7 |
1-5-1- گریز از پیری و مرگ سلولی |
7 |
1-5-2- خودمختاری از محرک های رشد |
8 |
1-5-3- خود مختاری از سیگنالهای بقاء |
8 |
1-5-4- خودمختاری اتصالی به سلولهای همسایه و ماتریکس |
9 |
1-6- شروع ترجمه |
10 |
1-6-1- مکانیسم ترجمهای وابسته به کلاهک |
11 |
1-6-1-1- مراحل آغاز ترجمه وابسته به کلاهک |
12 |
1-6-1-2- فاکتورهای آغازگر یوکاریوتی |
14 |
1-6-1-3- تنظیم آغاز ترجمه وابسته به کلاهک |
17 |
1-6-1-4-eIF4E و ترجمهی وابسته به کلاهک |
18 |
1-6-2- مکانیسم ترجمهای غیروابسته به کلاهک |
19 |
1-7- تحریکات هورمونی و ترجمه |
20 |
1-7-1- اختلاف در میزان نیازمندی mRNA به فعالیت هلیکازیeIF4A |
21 |
1-7-2- حضور توالی اختصاصی الیگوپیریمیدینی در5’UTR |
23 |
1-8- سیگنالینگ و ترجمه |
23 |
1-8-1- مسیر GSK3 |
25 |
1-8-2- مسیر PI3K/Akt |
26 |
1-8-2-1- معرفی فاکتور PI3K |
26 |
1-8-2-2- مکانیسم عمل PI3K/Akt |
27 |
1-8-2-3- معرفی فاکتور Akt |
27 |
1-8-2-4- مهار کنندهی مسیر PI3K/Akt |
28 |
1-8-3- مسیرTOR Kinase |
29 |
1-8-3-1- معرفی فاکتورmTOR |
30 |
1-8-3-2- مکانیسم عمل FRAP/mTOR |
31 |
1-8-4- مسیر پیامدهی وابسته به کیناز MAP |
32 |
1-8-4-1- مسیر پیامدهی ras |
32 |
1-8-4-2- مسیر پیام دهی p38 MAP کیناز |
33 |
1-8-5- مدل RNA regulon |
34 |
1-9- اطلاعات ژنومی EIF4E |
35 |
1-9-1- تعریف ژنeIF4E |
35 |
1-9-2- سودوژنeIF4E |
36 |
1-9-3- رونویسی ژنeIF4E |
36 |
1-9-4- بیان ژن eIF4E |
37 |
1-10- معرفی فاکتور پروتئینیeIF4E |
38 |
1-10-1- مکان eIF4E |
38 |
1-10-2- تجزیه eIF4E |
39 |
1-10-3- همولوژی eIF4E |
39 |
1-10-4- مطالعات ساختاری eIF4E |
39 |
1-10-5- خانواده eIF4E |
41 |
1-10-6- عوامل میانکنش دهنده با eIF4E |
43 |
1-10-7- عملکرد فاکتور پروتئینی eIF4E |
46 |
1-11- تنظیم عملکردی فاکتور آغازگر یوکاریوتی eIF4E |
47 |
1-11-1- فسفریلاسیون |
47 |
1-11-2- پروتئینهای تنظیمی |
48 |
1-11-2-1- میانکنش eIF4E/eIF4G |
48 |
1-11-2-2- پروتئین های هستهای |
50 |
1-12- تنظیم مکانی eIF4E |
54 |
1-13- فرآیندهای تنظیم شده توسط eIF4E |
55 |
1-13-1- eIF4E و تنظیم رشد و تکثیر سلولی |
55 |
1-13-2- eIF4E و چرخهی سلولی |
55 |
1-13-3- eIF4E و ترانسفرماسیون |
56 |
– eIF4E و انکوژن Ras |
57 |
1-13-4- eIF4E و ترجمه پروتئینهای مرتبط با بدخیمی |
57 |
1-13-5-eIF4E وآپوپتوز |
60 |
1-13-6- eIF4E و جنین زایی |
61 |
1-14- سرطان |
61 |
1-14-1- ترجمه و سرطان |
62 |
1-14-1-1- شواهد آزمایشگاهی مبنی بر ارتباط بین eIF4E و رشدتوموری و متاستاز |
63 |
1-14-1-2- مکانیسم افزایش eIF4E در سرطان |
65 |
1-14-1-3- eIF4E در نقش انکوژن |
66 |
1-14-1-4- eIF4E بعنوان یک مارکر توموری در تشخیص و پیش آگهی سرطان |
66 |
1-14-2- eIF4E و سرطان تیروئید |
67 |
1-14-2-1- فعالیت مسیر پیام دهیPI3K در تومورهای تیروئیدی |
69 |
1-14-2-2- کاربرد eIF4E به عنوان تومور مارکر در سرطان تیروئید |
70 |
1–15- eIF4E و درمان سرطان |
70 |
1-15-1- تخریب مسیرهای پیامدهی |
71 |
1-15-2- نرمال سازی عملکرد eIF4E |
72 |
– اختلال در میانکنش پروتئین– پروتئین و پروتئین-mRNA |
72 |
– کاربرد الیگونوکلئوتیدهای آنتیسنس ASO |
72 |
1-16- آشکارسازی تومورهای تیروئید با استفاده از eIF4E |
73 |
1-16-1- غدهی تیروئید و بیماریهای مربوط به تیروئید |
73 |
1-16-2- بیماریهای غیرتوموری تیروئید |
74 |
1-16-3- سرطان تیروئید |
74 |
1-16-3-1- تومورهای خوشخیم تیروئید |
76 |
1-16-3-2- تومورهای بدخیم تیروئید |
76 |
1-16-4- فاکتورهای ریسک |
80 |
1-16-5- درجهبندی تومورهای تیروئید |
81 |
1-16-6- مشکلات تشخیصی سرطان تیروئیدی |
83 |
1-17- تومور مارکرها و نقش آنها |
84 |
1-17-1- مارکرهای مولکولی در سرطان تیروئید |
85 |
فصل دوم: مواد و روشها |
|
2-1- نمونه گیری از انسان |
87 |
2-2- بررسی بیان ژن eIF4E در سطح RNAیی |
87 |
2-2-1- استخراج RNAی کل از بافت |
87 |
2-2-2- بررسی کمی و کیفی RNAاستخراج شده |
91 |
2-2-2-1- UVاسپکتروفتومتری |
91 |
2-2-2-2- الکتروفورز ژل آگارز |
92 |
2-2-2-2-1- محلولEDTA (8=PH و M5/0) |
94 |
2-2-2-2-2- بافر الکتروفورز (X10)TBE |
94 |
2-2-2-2-3- محول اتیدیوم بروماید (mg/ml10( |
95 |
2-2-2-2-4- بافر سنگین کننده مخصوص RNA |
95 |
2-2-2-2-5- بافر سنگین کننده (X6-TypeIII) مخصوص DNA |
96 |
2-3- تیمار با آنزیمDNase I |
97 |
2-4- واکنش رونویسی معکوس |
99 |
2-5- واکنش PCR |
101 |
2-5-1- طراحی پرایمر |
101 |
2-5-2- آماده سازی پرایمرهای PCR |
103 |
2-5-3- واکنش PCR |
103 |
2-5-4- عکسبرداری از ژل آگارز |
107 |
2-5-5- بهینه سازی تعداد سیکل PCR |
107 |
2-6- بررسی بیان ژن بصورت نیمه کمی |
108 |
2-7- آنالیز آماری |
108 |
2-8- تعیین توالی محصولات PCR |
108 |
2-8-1- استخراج DNA از ژل آگارز |
108 |
2-8-2- تعیین توالی DNA استخراج شده |
109 |
|
|
|
فصل سوم: نتایج و بحث |
|
3-1- نتایج |
110 |
3-1-1- توصیف نمونه های انسانی |
110 |
3-1-2- تعیین کیفیت و کمیت RNAی استخراج شده |
115 |
3-1-3- تعیین تعداد سیکل مناسب PCR |
117 |
3-1-4- بیان ژن eIF4E در نمونههای توموری، غیرتوموری و حاشیه تومور بافت تیروئید |
118 |
3-1-5- آنالیز آماری بیان ژن eIF4E در گروههای مختلف |
124 |
3-1-6- تعیین توالی محصولات PCR |
132 |
3-2- بحث |
|
3-2-1- اهمیت مطالعه سرطان تیروئید و انتخاب eIF4E |
134 |
3-2-2- تفسیر نتایج حاصل و اهمیت آنها |
138 |
3-3- نتیجه گیری |
147 |
3-4- پیشنهادها |
149 |
فهرست منابع |
149 |
ضمائم |
|
چکیده انگلیسی |
|
فهرست جداول و نمودارها |
|
جدول 3-1- مشخصات و ویژگی های پاتولوژیکی بیمارانی که از آن ها نمونههای توموری بدخیم جمع آوری شده است. |
112 |
جدول 3-2- مشخصات و ویژگی های پاتولوژیکی بیمارانی که از آن ها نمونههای توموری خوش خیم جمع آوری شده است. |
114 |
نمودار 3-1- مقایسهی درصد بیان ژن eIF4E در گروههای توموری (Tumoral) ،غیر توموری و حاشیهی تومور (Margin) |
120 |
نمودار 3-2- مقایسهی درصد بیان eIF4E در گروههای توموری خوشخیم (Benign)، بدخیم (Malignant)، غیر توموری (Non-Tumoral) و حاشیهی تومور (Margin). |
120 |
نمودار 3-3- مقایسهی درصد بیان eIF4E در گروههای توموری خوش خیم، بدخیم مرحلهی اولیه(Low stage)، پیشرفته(Advanced stage) و حاشیه توموری. |
122 |
نمودار 3-4- مقایسهی بیان eIF4E در دو گروه توموری و حاشیهی تومور در نمودار .Box plot |
126 |
نمودار 3-5- مقایسهی بیان eIF4E در دو گروه توموری و غیر توموری در نمودار .Box plot |
126 |
نمودار 3-6- مقایسهی بیان eIF4E در دو گروه بدخیم و خوش خیم توموری در نمودار .Box plot |
127 |
نمودار 3-7- مقایسهی بیان eIF4E در دو گروه بدخیم و غیر توموری توموری در نمودار .Box plot |
127 |
نمودار 3-8- مقایسهی بیان eIF4E در دو گروه خوش خیم و غیر توموری در نمودار Boxplot0 |
128 |
نمودار 3-9- مقایسهی بیان eIF4E در دو گروه بدخیم و حاشیه ی توموری در نمودار Boxplot. |
128 |
نمودار 3-10- مقایسهی بیان eIF4E در دو گروه خوش خیم و حاشیه ی توموری در نمودار Boxplot. |
129 |
نمودار 3-11- مقایسهی بیان eIF4E در دو گروه غیر توموری و حاشیه ی توموری در نمودار Boxplot. |
129 |
نمودار 3-12- مقایسهی بیان eIF4E درسه گروه توموری بدخیم، غیر توموری و حاشیهی تومور در نمودار .Box plot |
130 |
نمودار 3-13- مقایسهی بیان eIF4E درسه گروه توموری بدخیم، غیر توموری و حاشیهی تومور در نمودار .Box plot |
130 |
نمودار 3-14- مقایسهی بیان eIF4E در چهار گروه بدخیم توموری، حاشیهی تومور ، خوش خیم توموری و غیر توموری در نمودار .Box plot |
131 |
نمودار 3-15-مقایسهی بیان eIF4E در دو گروه پیشرفته و اولیه ی توموری در نمودار .Box plot |
131 |
نمودار 3-16- مقایسهی بیان eIF4E درپنج گروه پیشرفته توموری، اولیه توموری ، خوش خیم ،غیر توموری و حاشیهی تومور در نمودار .Box plot |
132 |
|
|
|
فهرست شکل ها |
|
فصل اول: بررسی منابع |
|
شکل1-1- مراحل آغاز ترجمه وابسته به کلاهک |
22 |
شکل 1-2- مفایسه پیچیدگی ساختاری بخش 5’UTR در پروتئینهای انکوژنی و خانه دار |
25 |
شکل1-3- مسیرهای پیامدهی تنظیمگر آغاز ترجمه وابسته به eIF4E |
31 |
شکل 1-4- دمینهای ساختاری کیناز mTOR |
36 |
فصل سوم: نتایج و بحث |
|
شکل 3-1- مقایسه ی کیفیتRNA های استخراجی بر روی ژل آگارز |
116 |
شکل 3-2- تعیین تعداد سیکل مناسب PCR |
117 |
شکل 3-3- الگوی الکتروفورز محصولات PCR ژن eIF4E در نمونههای توموری |
122 |
شکل 3-4- الگوی الکتروفورز محصولات PCR ژن eIF4E در نمونههای غیرتوموری |
123 |
شکل 3-5- الگوی الکتروفورز محصولات PCR ژن eIF4E در نمونههای حاشیهی تومور |
123 |
%31تخفیف
بررسی بیان ژن eIF4E به عنوان یک مارکر مولکولی جدید در تومورهای تیروئید
تعداد 172صفحه در فایل word
كارشناسي ارشد (MSc) دررشته ژنتيك
بررسی بیان ژن eIF4E به عنوان یک مارکر مولکولی جدید در تومورهای تیروئید
– مقدمه
تغییر در بیان ژنهای به ویژه مؤثر در رشد و تقسیم سلولی، سبب ظهور شرائط پاتولوژیکی و گسترش هرچه بیشتر بدخیمیها میشود. بیان ژنهای دخیل در سرطان زایی در سطوح مختلفی از جمله رونویسی، پلیآدنیلاسیون، پردازش، انتقال رونوشتها از هسته به سیتوپلاسم، تجزیهی mRNA و ترجمهی mRNA تنظیم میشود. پروسهی ترجمه جهت سنتز پروتئین از سه مرحله پیچیدهی آغاز، طویل سازی و پایان ترجمه تشکیل شدهاست که توسط چندین فاکتور رونویسی تنظیم میشوند. شواهدی که بیانگر نقش فاکتورهای ترجمهای به ویژه eIF4E در پیشبرد روند سرطان زایی میباشد عبارت است از
-
افزایش بیان این فاکتور در ردههای متنوع سلولهای سرطانی و نمونههای توموری.
-
بیان اکتوپیکی این فاکتور ترجمهای منجر به ترانسفرماسیون سلولی و تومورزایی میشود.
-
کاهش بیان سلولی این فاکتور با استفاده از تکنیک آنتی سنس mRNA، سبب برگرداندن خصوصیات انکوژنی سلولهای سرطانی میشود.
Gracie –
Today, I went to the beachfront with my kids. I found a sea shell and gave it to my 4 year old
daughter and said “You can hear the ocean if you put this to your ear.”
She put the shell to her ear and screamed.
There was a hermit crab inside and it pinched her ear. She never wants
to go back! LoL I know this is completely off topic but I had to tell someone!
my homepage Cumpărați accutane online: ce trebuie să știți despre interacțiunile medicamentoase