%31تخفیف

مطالعه تأثیرات ضد ویروسی گروهی از آنابناها و لپتولینگبیا های جدا شده از نواحی جنوب ایران

تعداد 145 صفحه در فایل word

کارشناسی ارشد (M.Sc)

مطالعه تأثیرات ضد ویروسی گروهی از آنابناها و لپتولینگبیا های جدا شده از نواحی جنوب ایران

چکیده

سیانوباکتری ها دارای توزیعی جهانی هستند. آنها دارای قابلیت های با ارزشی برای کاربرد به عنوان دارو، یا در زمینه کشاورزی و یا بازیابی آب های هرز می باشند. به علاوه آنها طیف وسیعی از متاولیت های ثانویه را تولید می کنند که برای رشدشان مورد نیاز نیستند ولی دارای فعالیت های بیولوژیک قوی می باشند مثل فعالیت های ضد ویروسی ، ضد باکتریایی و ضد قارچی، ضد مالاریایی، ضد توموری و ضد التهابی که برای استفاده های درمانی مفید می باشند. در پژوهش حاضر نیز فعالیت ضد ویروسی سیانوباکتری های جمع آوری شده از مناطق آلوده به نفت جنوب ایران، مورد بررسی قرار گرفته است.

روش کار: در این پژوهش عصاره آبی و متانولی سیانوباکتری های Leptolyngbya  ISC 40 , Anabaena ISC 90   Anabaena ISC 88, Anabaena ISC 55   و  Leptolyngbya ISC 25تهیه شد. تاثیرات سایتوتوکسیک آن ها بر روی رده های سلولی Hela, LCL وL 929  به وسیله تست MTT  مورد ارزیابی قرار گرفت. برای بررسی تاثیرات ضد ویروسی، ابتدا عصاره ها به سلول های  LCL  و HeLa  که به ترتیب دارای ویروس هایEBV  و HPV  می باشند اثر داده شد. سپس استخراج DNA و تست PCR برای ناحیه ژنی مسئول کد کردن پوشش ویروس انجام شد.

 نتایج نشان داد که عصاره ها دارای تاثیرات سایتوتوکسیک بر رویLCL  و HeLa بودند. به علاوه عصاره های مورد مطالعه، LOAD  ویروس را به طور معنی دار کاهش دادند.

کلمات کلیدی: سیانوباکتری، ویروس، سایتوتوکسیسیتی.

 

 

فهرست مطالب

صفحه

عنوان                                                                                                                                 

چکیده 1

مقدمه : تاریخچه سیانوباکتری ها 3

فصل اول: کلیات

1-1- سلول سیانوباکتری.. 5

1-1-1- حرکت در سیانوباکتری.. 6

1-1-2- غشا سلولی سیانوباکتری.. 7

1-1-3- تیلاکوئیدها در سیانوباکتری.. 7

1-1-4- فیکوبیلی زوم ها در سیانوباکتری.. 8

1-1-5- میان یاخته مرکزی سیانوباکتری.. 8

1-1-6- سیانوفیسین در سیانوباکتری.. 9

1-1-7- تکثیر در سیانوباکتری ها 10

1-1-8- ترکیبات موثر موجود در سیانوباکتری ها 11

1-1-9- مورفولوژی در سیانوباکتری ها 13

1-1-10- تقسیمات شاخه سیانوباکتری ها 14

1-1-10-1- رده سیانوفیسه. 15

1-1-10-1-1- راسته Chroococcales. 15

1-1-10-1-2- راسته Pleurocapsales. 15

1-1-10-1-3- راسته Oscillatoriales. 15

1-1-10-1-4- راسته Nostocales. 16

1-1-10-1-5- راسته Stigonematales. 16

1-1-10-2- رده پروکلروفیسه. 16

1-2- ویروس های تومورزا و عوامل سرطان زا 17

1-2-1- خصوصیات کلی کارسینوژنز ویروسی.. 18

1-2-1-1- کارسینوژنز چند مرحله ای.. 18

1-2-2- فعالیت انواع ویروس های تومورزا 20

1-2-3- واکنش متقابل ویروس های تومورزا با سلول میزبان. 21

1-2-4- ویروس های تومورزای RNA دار (رترو ویروس ها) 25

1-2-4-1- قدرت تومورزایی رترو ویروس ها 26

1-2-4-2- رترو ویروس های انسانی.. 26

1-2-5- آنکوژن های سلولی.. 28

1-2-6- تقسیم بندی آنکوژن ها 28

1-2-6-1- مکانیسم فعال شدن آنکوژن. 29

1-2-6-2- نقش آنکوژن ها در سرطان. 32

1-2-7- ژن های سرکوب گر تومور 32

1-2-8- ویروس های تومورزای DNA دار 33

1-2-9- آدنو ویروس ها 39

1-2-10- هرپس ویروس ها 39

1-2-11- پاکس ویروس ها 42

1-2-12- ویروس هپاتیت B. 43

1-3- پاپیلوما ویروس های انسانی (HPV) 45

1-3-1- تکثیر پاپیلوما ویروس.. 46

1-3-2- مکانیسم بیماری زایی و آسیب شناسی.. 46

1-3-3- یافته های بالینی و اپیدمیولوژی.. 48

1-3-4- پیشگیری و کنترل. 50

1-4- اپشتین بار ویروس(EBV) 50

1-4-1- خصوصیات ویروس.. 50

1-4-2- آسیب شناسی و آسیب زایی.. 54

1-4-3- یافته های بالینی.. 56

1-4-4- ایمنی.. 58

1-4-5- تشخیص آزمایشگاهی.. 58

1-4-6- همه گیر شناسی.. 60

1-4-7- پیشگیری، درمان و کنترل. 61

1-5- پیشگیری و درمان عفونت های ویروسی.. 62

1-5-1- شیمی درمانی ضد ویروسی.. 62

1-5-3- واکسن های ویروسی.. 71

1-6- نانو ذرات.. 77

1-6-1- کاربردهای نانوذرات در پزشکی.. 78

1-6-2- انو اع نانو ذرات.. 78

1-6-3- تاثیر سایز و شکل روی فعالیت آنتی میکروبی نانوذرات.. 79

1-6-4- مکانیسم های ضد میکروبی نانو. 79

1-6-5- فاکتورهای مهم در ایجاد سایتوتوکسیسیتی ناشی از نانو ذرات.. 80

1-6-6- مکانیسم ایجاد سمیت در سلول ها 80

1-7- هدف از این مطالعه : 80

فصل دوم: مواد و روش کار

2-1- دستگاه ها، وسایل و مواد مورد استفاده 82

2-2-1- بخش فیزیولوژی.. 86

2-2-1-1- تهیه سویه های سیانوباکتری.. 86

2-2-1-2- کشت سویه ها و تکثیر آنها 87

2-2-1-3- تهیه عصاره آبی سیانوباکتری.. 89

2-2-1-4- تهیه عصاره متانولی سیانوباکتری.. 90

2-2-2- بخش مولکولی.. 90

2-2-2-1- معرفی و کشت رده های سلولی انسان. 90

2-2-2-2- تهیه محیط کشت 1640 RPMI 91

2-2-2-3- کونژوگه کردن نانوذرات بوسیله ترکیبات استخراج شده 92

2-2-2-4- کشت در داخل پلیت 96 خانه. 92

2-2-2-4-1- تاثیر بر سلولها 93

2-2-2-4-2- بررسی سایتوتوکسیسیتی به وسیله سنجش M.T.T.. 93

2-2-2-4-3- اساس تست   MTT.. 94

2-2-2-4-4- طرز تهیه محلول MTT.. 94

2-2-2-4-5- انجام تست MTT.. 95

2-2-2-5- استخراج DNA ژنومی.. 96

2-2-2-6- واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) 98

2-2-2-6-1- طراحی پرایمر. 99

2-2-2-6-2- آماده سازی پرایمرها 101

2-2-2-6-3- دی اکسی نوکلئوزید تری فسفات (dNTP) 101

2-2-2-6-4- مارکر DNA.. 101

2-2-2-6-5- شناسایی پرایمر. 101

2-2-2-6-6- روش کار PCR.. 102

2-2-2-7- الکتروفورز بر روی ژل آگارز جهت بررسی محصولات PCR.. 104

2-2-2-7-1- روش کار 105

2-2-2-8- تست کلون زایی.. 106

فصل سوم: نتایج

3-1- نتایج حاصل از کشت سیانوباکتری.. 109

3-1-1- عکس ماکروسکوپی نمونه ها: 109

3-1-2- عکس میکروسکوپی نمونه ها: 111

3-2- نتایج حاصل از کشت سلول های انسانی.. 113

3-3- نتایج حاصل از بررسی تست سایتوتوکسیسیتی.. 115

3-3-1- نتایج حاصل از تست سایتوتوکسیسیتی عصاره آبی نمونه ها بر روی رده سلولی HeLa: 115

3-3-2- نتایج حاصل از تست سایتوتوکسیسیتی عصاره آبی نمونه ها بر روی رده سلولی LCL: 117

3-3-3- نتایج حاصل از تست سایتوتوکسیسیتی عصاره آبی نمونه ها بر روی رده سلولی L929: 118

3-3-4- نتایج حاصل از تست سایتوتوکسیسیتی عصاره متانولی نمونه ها بر روی رده سلولی HeLa: 119

3-3-5- نتایج حاصل از تست سایتوتوکسیسیتی عصاره متانولی نمونه ها بر روی رده سلولی LCL: 122

3-4- نتایج حاصل از تعیین میزان لود ویروس HPV با عصاره متانولی نمونه های Anabaena 90,55. 125

3-5- نتایج حاصل از تعیین میزان لود ویروس EBV با عصاره متانولی نمونه های Anabaena 90,55. 127

3-6- نتایج حاصل از تعیین میزان لود ویروس  EBVو HPV با عصاره متانولی نمونه های Anabaena 88 و 40,25 Lepto Lyngbya. 128

3-7- نتایج حاصل از تست کلون زایی.. 129

3-7-1- نمودار حاصل از تست کلون زایی.. 129

3-7-2- عکس های میکروسکوپی نمونه ها در توانایی تولید کلنی با لنز 100 ×. 130

فصل چهارم: بحث و نتیجه گیری

پیشنهادات: 139

منابع: 140

 

 

 

 

فهرست نمودارها

عنوان                                                                                                                                            صفحه

نمودار 3-1- تاثیر عصاره آبی نمونه های Anabaena ISC 90,88,55 و Lepto Lyngbya ISC 40,25 بر روی سلول های HeLa در طول موج 492 نانومتر. 116

نمودار 3-3- تاثیر عصاره آبی نمونه های Anabaena ISC 90,88,55 بر روی سلول های HeLa در طول موج 492 نانومتر. 117

نمودار 3-4- تاثیر عصاره آبی نمونه های Anabaena ISC 90,88,55 و Lepto Lyngbya ISC 40,25 بر روی سلول های LCL در طول موج 492 نانومتر. 117

نمودار 3-5- تاثیر عصاره آبی نمونه های Anabaena ISC 90,88,55 و Lepto Lyngbya ISC 40,25 بر روی سلول های LCL در طول موج 492 نانومتر. 118

نمودار 3-6- تاثیر عصاره آبی نمونه های Anabaena ISC 90,88,55 و Lepto Lyngbya ISC 40,25 بر روی سلول های L 929 در طول موج 492 نانومتر. 118

نمودار 3-7- تاثیر عصاره متانولی نمونه های Anabaena ISC 90,55 بر روی سلول های HeLa در طول موج 492 نانومتر و به مدت 24 ساعت. 119

نمودار 3-8- تاثیر عصاره متانولی نمونه های Anabaena ISC 90,55 بر روی سلول های HeLa در طول موج 492 نانومتر و به مدت 48 ساعت. 119

نمودار 3-9- تاثیر عصاره متانولی نمونه های Anabaena ISC 90,55 بر روی سلول های HeLa در طول موج 492 نانومتر و به مدت 72 ساعت. 120

نمودار 3-10- تاثیر عصاره متانولی نمونه های Anabaena ISC 90,55 بر روی سلول های HeLa در طول موج 492 نانومتر. 120

نمودار 3-11- تاثیر عصاره متانولی نمونه های Anabaena ISC 90,55 بر روی سلول های HeLa در طول موج 492 نانومتر. 121

نمودار 3-12- تاثیر عصاره متانولی به همراه نانو ذرات نمونه های Anabaena ISC 90,55 بر روی سلول های HeLa در طول موج 492 نانومتر. 121

نمودار 3-13- تاثیر عصاره متانولی نمونه های  Anabaena ISC 88و Lepto Lyngbya ISC 40,25 بر روی سلول های HeLa در طول موج 492 نانومتر. 122

نمودار 3-14- تاثیر عصاره متانولی نمونه های  Anabaena ISC 90,55بر روی سلول های LCL در طول موج 492 نانومتر و به مدت 24 ساعت. 122

نمودار 3-15- تاثیر عصاره متانولی نمونه های Anabaena ISC 90,55 بر روی سلول های LCL در طول موج 492 نانومتر و به مدت 48 ساعت. 123

نمودار 3-16- تاثیر عصاره متانولی نمونه های Anabaena ISC 90,55 بر روی سلول های LCL در طول موج 492 نانومتر و به مدت 72 ساعت. 123

نمودار 3-17- تاثیر عصاره متانولی نمونه های Anabaena ISC 90,55 بر روی سلول های LCL در طول موج 492 نانومتر. 124

نمودار 3-18- تاثیر عصاره متانولی نمونه های  Anabaena ISC 88و Lepto Lyngbya ISC 40,25 بر روی سلول های LCL در طول موج 492 نانومتر. 124

نمودار 3-19-  نمونه Lepto Lyngbya 25، در صد کمتری دارد و توانایی کمتری در تولید کلنی دارد. 129

 

 

 

 

 

فهرست اشکال

عنوان                                                                                                                                            صفحه

شکل 1-1- انواع سلول ها در ساختمان یک سیانوباکتری.. 11

شکل 1-2- نقشه ژنوم پاپیلوما ویروس انسانی (HPV-16) 46

شکل 1-3- ویروس اپشتین بار 53

شکل 3-1- آنابنا 90- شکل سمت چپ، محیط کشت جامد و شکل سمت راست، محیط کشت مایع سیانوباکتری است. 109

شکل 3-2- آنابنا 55- شکل سمت چپ، محیط کشت جامد و شکل سمت راست، محیط کشت مایع سیانوباکتری است. 109

شکل 3-3- آنابنا 88- شکل سمت چپ، محیط کشت جامد و شکل سمت راست، محیط کشت مایع سیانوباکتری است. 110

شکل 3-4- لپتولینگبیا 40- شکل سمت چپ، محیط کشت جامد و شکل سمت راست، محیط کشت مایع سیانوباکتری است. 110

شکل 3-5- لپتولینگبیا 25- شکل سمت چپ، محیط کشت جامد و شکل سمت راست، محیط کشت مایع سیانوباکتری است. 110

شکل 3-6- عکس میکروسکوپی آنابنا 90  درشتنمایی 4000 برابر . 111

شکل 3-7- عکس میکروسکوپی آنابنا 55 درشتنمایی 4000 برابر . 111

شکل 3-8- عکس میکروسکوپی آنابنا 88 درشتنمایی 4000 برابر . 112

شکل 3-9- عکس میکروسکوپی لپتولینگبیا 40 درشتنمایی 4000 برابر . 112

شکل 3-10- عکس میکروسکوپی لپتولینگبیا 25 درشتنمایی 4000 برابر . 113

شکل 3-11- سلول های LCL که گرد و معلق اند.( با درشتنمایی 160 برابر ) 114

شکل 3-12- سلول های HeLa که به کف فلاسک چسبیده اند .( با درشتنمایی 160 برابر ) 114

شکل 3-13- سلول های L 929 که به کف فلاسک چسبیده و دوکی شکل اند. .( با درشتنمایی 160 برابر ) 115

نمودار 3-2- تاثیر عصاره آبی نمونه های Anabaena ISC 90,88,55 و Lepto Lyngbya ISC 40,25 بر روی سلول های HeLa در طول موج 492 نانومتر. 116

شکل 3-14- نمونه های لود شده در چاهک به ترتیب از چپ به راست عبارتند از: 1- کنترل HeLa، 2- دوز 150 میلی مولار + دوز 150 میلی مولار نانو ذرات نمونه Anabaena 55، 3- دوز 450 نمونه Anabaena 55 ، 4- دوز 450 نمونه Anabaena 90 ، 5- دوز 350 نمونه Anabaena 90 ، 6- دوز 250 نمونه Anabaena 90 ، 7- دوز 150 نمونه Anabaena 90 . 126

شکل 3-15- نمونه های لود شده در چاهک به ترتیب از چپ به راست عبارتند از: 1- HGH کنترل LCL، 2- EBV کنترل LCL، 3- HGH نمونه Anabaena 90 ، 4- EBV نمونه 90 Anabaena، 5- HGH نمونه 55 Anabaena، 6- EBV نمونه 55 Anabaena. 127

شکل 3-16- نمونه های لود شده در چاهک های بالا به ترتیب از چپ به راست عبارتند از: 1- HGH کنترل HeLa، 2- HPV کنترل HeLa، 3- HGH نمونه Anabaena 88 ، 4- HPV نمونه 88 Anabaena، 5- HGH نمونه40  Lepto Lyngbya، 6- HPV نمونه 40 Lepto Lyngbya، 7- HGH نمونه Lepto Lyngbya 25 ، 8- HPV نمونه .Lepto Lyngbya 25. 128

شکل 3-17- کلنی های حاصل از نمونه کنترل. 130

شکل 3-18- کلنی های حاصل از نمونه آنابنا90. 130

شکل 3-19- کلنی های حاصل از نمونه آنابنا 88. 131

شکل 3-20- کلنی های حاصل از نمونه آنابنا 55. 131

شکل 3-21- کلنی های حاصل از نمونه لپتولینگبیا 40. 132

شکل 3-22- کلنی های حاصل از نمونه لپتولینگبیا 25. 132

 

 

فهرست جداول

عنوان                                                                                                                                            صفحه

جدول 2- 1- ترکیب شیمیایی محیط کشت BG-11. 88

جدول 2- 2- ترکیب شیمیایی Trace elements. 88

جدول 2-3- مشخصات رده های سلولی انسان. 91

جدول 2-4- توالی پرایمر های مورد استفاده در این مطالعه. 102

جدول 2- 5- اجزا   PCR Master Mix (2x) 103

جدول 2- 6- حجم واکنش دهنده های PCR.. 103

جدول 2- 7- برنامه حرارتی دستگاه ترموسایکلر در واکنش PCR برای HPV.. 103

جدول 2-8- برنامه حرارتی دستگاه ترموسایکلر در واکنش PCR برای EBV.. 104

نقد و بررسی‌ها

هنوز بررسی‌ای ثبت نشده است.

اولین کسی باشید که دیدگاهی می نویسد “مطالعه تأثیرات ضد ویروسی گروهی از آنابناها و لپتولینگبیا های جدا شده از نواحی جنوب ایران”

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *

قبلا حساب کاربری ایجاد کرده اید؟
گذرواژه خود را فراموش کرده اید؟
Loading...
enemad-logo