بررسی ارتباط بین پلی مورفیسم SNP309 ژن MDM2 با بیماری لوسمی میلوئیدی حاد(AML)در یک جمعیت ایرانی

فهرست مطالب

عنوان                                                                                                            شماره صفحه

چکیده……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 1

فصل اول : کلیات تحقیق

1-1- مقدمه …………………………………………………………………………………………………………………………………………………….  3

1-2- بدخیمی‌های میلوئیدی…………………………………………………………………………………………………………………………. 4

1-2-1- طبقه بندی FAB…………………………………………………………………………………………………………………………….. 5

1-2-2- طبقه بندی سازمان بهداشت جهانی (WHO) …………………………………………………………………………………. 5

1-3- ژنتیک  AML…………………………………………………………………………………………………………………………………………. 7

1-4- ژن MDM2  (Murine Double Minute 2) ………………………………………………………………………………………. 8

1-4-1- MDM2 و چرخه سلولی کنترل …………………………………………………………………………………………………….. 10

1-4-2- MDM2 و فعالیت لیگازی E3 ………………………………………………………………………………………………………… 10

1-4-3- MDM2 و سرکوب کننده تومور p53 …………………………………………………………………………………………….. 11

1-4-4- دیگر اعضای خانواده MDM2 …………………………………………………………………………………………………………. 12

1-4-5- MDM2 و استروژن …………………………………………………………………………………………………………………………. 13

1-4-6- MDM2  و دیگر عوامل تعاملی ……………………………………………………………………………………………………….. 14

1-5- پلی مورفیسم های  MDM2 ………………………………………………………………………………………………………………. 14

1-5-1-SNP309……………………………………………………………………………………………………………………………………………. 14

1-5-2-C1797G     ……………………………………………………………………………………………………………………………………. 17

1- 7- اهمیت و ضرورت تحقیق ……………………………………………………………………………………………………………………. 18

1-8- اهداف تحقيق  ……………………………………………………………………………………………………………………………………… 18

1-9- اهداف ویژه طرح ………………………………………………………………………………………………………………………………….. 19

1-10- اهدف كاربردي طرح …………………………………………………………………………………………………………………………. 19

1- 11- پیشینه تحقیق …………………………………………………………………………………………………………………………………. 19

فصل دوم : روش اجرای تحقیق

2-1- بيماران ………………………………………………………………………………………………………………………………………………. 26

2-1-1- گروه کنترل …………………………………………………………………………………………………………………………………… 26

2-1-2- معیارهای ورود و خروج بیماران ………………………………………………………………………………………………….. 26

2-1-3- معیارهای ورود و خروج کنترل ……………………………………………………………………………………………………. 27

2-2- نمونه گيري ………………………………………………………………………………………………………………………………………. 27

2-3- استخراج DNA از خون محیطی ……………………………………………………………………………………………………… 27

2-4- تعیین غلظت، درجه خلوص و کیفیت DNA ………………………………………………………………………………….. 28

2-4-1- آنالیز کیفی …………………………………………………………………………………………………………………………………… 28

2-4-2- آنالیز کمی ……………………………………………………………………………………………………………………………………. 29

2-5- تعیین ژنوتیپ …………………………………………………………………………………………………………………………………… 29

2-6- تجزیه و تحلیل آماری ………………………………………………………………………………………………………………………. 31

 

فصل سوم : تجزیه و تحلیل داده ها

3-1- نتایج ………………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 33

 

فصل چهارم : نتیجه گیری و پیشنهادات

4-1- بحث ………………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 43

4-2- محدودیت‌های مطالعه ………………………………………………………………………………………………………………………. 47

4-3- پیشنهادات …………………………………………………………………………………………………………………………………………. 47

4-4- نتیجه گیری ……………………………………………………………………………………………………………………………………….. 48

منابع و مآخذ………………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 49

چکیده انگلیسی……………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 56

 

فهرست جداول

عنوان                                                                                                      شماره صفحه

جدول 1-1- سیستم طبقه بندی فرانسه-انگلیسی-آمریکایی (FAB) AML…………………………………………….. 5

جدول 1-2- طبقه بندی AML نئوپلاسمهای پیش ساز مرتبط (WHO 2008)……………………………………….. 6

جدول 1-3- عوامل تعامل کننده با MDM2 ……………………………………………………………………………………………………14

جدول 1-4- توزیع ژنوتیپی C1797G در جوامع مختلف…………………………………………………………………………. .18

جدول 2-1- مشخصات آغازگرها…………………………………………………………………………………………………………………… 29

جدول 2-2- تركيبات واكنش PCR…………………………………………………………………………………………………………….. 30

جدول 2-3- پارامترهای PCR………………………………………………………………………………………………………………………. 31

جدول 3-1- فراوانی ژنوتیپی MDM2 T309G…………………………………………………………………………………………. 34

جدول 3-2- فراوانی اللي MDM2 T309G………………………………………………………………………………………………… 35

جدول 3-3- توزیع فراوانی شرکت کنندگان بر اساس محدوده سنی……………………………………………………….. 36

جدول 3-4- توزیع فراوانی ژنوتیپی پلی مورفیسم  MDM2 T309G بر اساس سن…………………………….. 37

جدول 3-5- توزیع فراوانی بیماران بر اساس سیستم طبقه بندی FAB…………………………………………………. 38

جدول 3-6- توزیع فراوانی ژنوتیپی MDM2 T309G بر اساس طبقه بندی FAB……………………………….. 39

فهرست اشکال

عنوان                                                                                                     شماره صفحه

شکل 1-1- شمایی ژن MDM2……………………………………………………………………………………………………………………… 8

شکل  1-2- مثالی از پروتئین های ویرایش متناوب MDM2……………………………………………………………………… 9

شکل 1-3- شمای پروتئین MDM2………………………………………………………………………………………………………………. 9

شکل 1-4- چگونگی تعامل بین MDM2، MDM4 و p53……………………………………………………………………….. 13

شکل 1-5- جایگاه SNP309 در اینترون شماره 1 ژن MDM2………………………………………………………………. 15

شکل 1-6- مدل پیشنهادی Bond برای چگونگی تعامل بین SNP309 و فاکتورهای مختلف………………. 16

شکل 1-7- تحلیل ترکیبی ریسک سرطان ریه و SNP309………………………………………………………………………. 17

شکل 3-1. تصویر ژل الکتروفورز ………………………………………………………………………………………………………………….. 33

شکل 3-2- هیستوگرام توزیع فراوانی ژنوتیپی پلی مورفیسم  MDM2 T309G……………………. 40

شکل 3-3- هیستوگرام توزیع فراوانی ژنوتیپ TT پلی مورفیسم MDM2 T309G…………….. 41

شکل 3-4-  هیستوگرام توزیع فراوانی ژنوتیپ TG  پلی مورفیسم MDM2 T309G…………. 41

شکل 3-5- هیستوگرام توزیع فراوانی ژنوتیپ GG  پلی مورفیسم MDM2 T309G………… 42