%46تخفیف
مقایسه رگرسیون های لاسو و ریج در شناسایی چندشکلی های تک نوکلئوتیدی مرتبط با صفات کمی
بخش علوم دامی
کارشناسي ارشد رشته مهندسي علوم دامیژنتیک و اصلاح نژاد
مقایسه رگرسیون های لاسو و ریج در شناسایی چندشکلی های تک نوکلئوتیدی مرتبط با صفات کمی
چکیده:
مطالعاتارتباطیکلژنوم(GWAS)،بابهرهگیریازنشانگرهایتکنوکلئوتیدی (SNP) متراکم مسیرنوینیرابرایکشفژنهای مرتبطباصفاتکمی و دارای مکانیسم توارثی پیچیده،فرا رویمحققانقراردادهاند. حجمبالایSNP ها(پیشبینها) ازیکسووهمبستگیآنهاباهمازسوییدیگر، فراینداستخراج وآنالیزاینگنجینه یفوقالعادهحجیم را باچالشمواجه ساختهاست. درمطالعاتGWAS،علیرغمتراکمبالایSNP ها معمولا فقطتعدادیازآنهارویصفتموردنظر اثرقابلتوجهیدارند. روشهایانقباضی، کهاخیراتوجهزیادیرابهخودجلبکردهاند،مشکل بزرگتر بودن بردار پارامترها نسبت به بردار مشاهدات (p>>n) وهمبستگیبینمتغرهای پیش بینی کننده را با اعمالجریمهرویمدل،تخفیفداده وضرایبرگرسیونیرابااعمالمحدودیترویدامنهتغییراتآنهابرآوردمیکنند. هدفازاینمطالعهارزیابیومقایسهیدوروش رگرسیون همراهباجریمهی ریج ولاسودرشناساییچندشکلیهایمرتبطبا صفاتکمی بود. ایندو مدلرگرسیونی،رویدادههایGWAS مربوطبهصفاتکمیموش ( تعداد 42428پیشبینی کنندهیا SNP روی تعداد 288 فرد) بااستفادهازنرمافزارمحاسباتیR اجراوعملکرددومدلمقایسهشد. دراینمطالعه،ضرایب مدل برآوردومعیاراعتبارسنجیبرایهردومدلدرهشتصفتمتابولیکیمحاسبهومقایسهشد. مقایسهیاعتبارسنجیدومدل برایهرهشتصفت،نشانگربرازشبهتر رگرسیون ریجنسبتبهرگرسیون لاسوبود.
واژه های کلیدی: مطالعات ارتباطی کل ژنوم، جریمه، روش های انقباضی، رگرسیون ریج، لاسو، اعتبارسنجی متقابل
