%41تخفیف

دانلود پروژه:مطالعه  QSARفعالیت ضد سرطانی مشتقات کالکون با استفاده از روش­های BGSA-BRANN

تعداد75 صفحه در فایل word

بخش شيمي

کارشناسي ارشد شيمي تجزيه

 

مطالعه  QSARفعالیت ضد سرطانی مشتقات کالکون با استفاده از روش­های BGSA-BRANN

ده:

لوسمی، گروهی از سرطان­ها است که معمولأ در مغز استخوان شروع می­شود و منجر به تعداد بالایی از سلول­های سفید خون غیر طبیعی می­شود. لوسمی، مانند سایر سرطان­ها ناشی از جهش در DNAمی­باشد. یک روش جدید درمان این بیماری، استفاده از داروهای ضد سرطان است. هدف اصلی QSAR ایجاد یک مدل ریاضی بین خصوصیت بیولوژیکی اندازه گیری شده ترکیبات و خصوصیات شیمیایی و ساختاری آنها و سپس استفاده از آن مدل برای پیش بینی ویژگی مورد نظر در ترکیبات جدید می­باشد. مهم ترین کاربرد QSAR در فرایند طراحی دارو است که هزینه و زمان کشف دارو را کاهش می­دهد. انتخاب ویژگی، فرایندی جهت انتخاب مفید ترین و مناسب ترین توصیف کننده­ها جهت مدل سازی می­باشد. هدف استفاده از الگوریتم انتخاب ویژگی، انتخاب مجموعه ای از توصیف کننده­هاست که بهترین مدل را جهت پیش بینی متغیر وابسته ارائه دهند. از میان روش­های انتخاب ویژگی، روش­های جستجوی ابتکاری بیشتر مورد توجه هستند، زیرا در مدت زمان معقول جواب نزدیک به بهینه را پیدا می­کنند.در این پروژه، از الگوریتم جستجوی گرانشی دودویی به عنوان الگوریتم انتخاب ویژگی در بررسی رابطه کمی بین ساختار مشتقات کالکون با فعالیت ضد سرطانی آنها استفاده شده است. در الگوریتم پیشنهادی، عوامل جستجوگر مجموعه ای از اجرام هستند که با یکدیگر بر اساس قوانین حرکت و گرانشی نیوتن، برهم کنش دارند. پس از بهینه کردن پارامتر­های الگوریتم، عوامل جستجوگر حول بهینه فرامحلی جمع شده و الگوریتم همگرا گردید. مدل به دست آمده شامل 8 توصیف کننده می­باشد که عبارتند از سه توصیف کننده توپولوژیکی(JBI5,MATS6m, MATS8e) و پنج توصیف کننده هندسیDISPe, Mor03m, R6m,H4u,RDF010e)).این توصیف کننده­ها با توانایی برازش خیلی خوب ( ) توسط آزمون­های معتبر، اعتبار سنجی شد. نتایج حذف یکتایی ( )، حذف شش تایی ( )، حذف دوازده تایی( ) و ارزیابی متقاطع برونی ( ) نشان دهنده مناسب و معتبر بودن مدل BGSA-BRANN می­باشد.

کلید واژه­ها: الگوریتم جستجوی گرانشی دودویی،QSAR،انتخاب ویژگی، کالکون

فهرست مطالب

عنوان                                        صفحه

فصل اول

مقدمه ای بر روش رابطه ی کمی ساختار- فعالیت (QSAR) 1

1-1 لوسمی و داروی ضد سرطان……………….. 2

1-2 کمومتریکس…………………………… 3

1-3 رابطه کمی ساختار- فعالیت……………… 5

1-4 روش و اهداف…………………………. 5

فصل دوم

مراحل روش QSAR و مقدمه ای بر الگوریتم­های انتخاب ویژگی    8

2-1 مراحل روش QSAR………………………. 9

2-1-1 انتخاب سری داده­ها ………………. 10

2-1-2 تقسیم بندی سری داده­ها …………… 10

2-1-3 محاسبه توصیف کننده­ها ……………. 10

2-1-4 ارزیابی و تجزیه تحلیل آماری توصیف کننده­ها 12

2-1-5 انتخاب توصیف کننده­های مناسب………. 12

2-1-6 مدلسازی………………………… 13

2-1-6-1 مدلسازی خطی…………………. 13

2-1-6-2 مدلسازی غیر خطی……………… 13

2-1-6-2-1 نرون مصنوعی………………. 14

2-1-6-3 یادگیری و یادآوری در شبکه­های عصبی مصنوعی    18

2-1-6-4 روش یادگیری پس انتشار………… 18

2-1-7 آنالیز آماری مدل­ها ……………… 21

2-1-8 اعتبار سنجی مدل­ها و انتخاب مدل مناسب. 22

2-1-8-1 روش ارزیابی متقاطع برونی……… 22

2-1-8-2 روش ارزیابی متقاطع درونی……… 22

2-1-8-3 روش تصادفی کردن Y……………. 23

2-2 انتخاب ویژگی ………………………. 24

2-2-1 مبانی عملکرد الگوریتم­های انتخاب ویژگی 24

2-3 روش­های انتخاب ویژگی ………………… 25

2-4 الگوریتم­های جستجوی ابتکاری…………… 26

2-4-1 ارزیابی کارایی الگوریتم­های جستجوی ابتکاری  26

2-5 مبانی برخی از الگوریتم­های جستجوی ابتکاری. 27

2-5-1 الگوریتم ژنتیک………………….. 27

2-5-2 الگوریتم بهینه سازی جمعیت مورچگان…. 27

2-5-3 الگوریتم بهینه سازی جمعیت ذرات……. 28

2-5-4 الگوریتم کلونی زنبور عسل…………. 28

2-5-5 الگوریتم جستجوی گرانشی…………… 28

2-6 مبانی الگوریتم­های جستجوی ابتکاری دودویی.. 29

2-6-1 الگوریتم جستجوی گرانشی دودویی…….. 29

فصل سوم

مدلسازی خاصیت ضد سرطانی مشتقات کالکون با استفاده از روش­های BGSA-BRANN………………………………….. 35

3-1 انتخاب سری داده­ها ………………….. 36

3-2 ارزیابی و تجزیه تحلیل آماری توصیف کننده­ها 41

3-3 مدل سازی خطی به روش MLR…………….. 41

3-4 مدل سازی با روش Stepwise MLR-ANN………… 44

3-5 مدل سازی به روش BGSA-BRANN…………… 44

3-5-1 ارزیابی اعتبار مدل ها …………… 45

3-6 الگوریتم بهینه سازی گرانشی دودویی به عنوان الگوریتم انتخاب ویژگی………………………………….. 46

3-6-1 اعتبار سنجی و مقایسه نتایج……….. 52

3-6-2 تشریح توصیف کننده­های مدل…………. 56

3-7 طراحی نامزدهای دارویی جدید…………… 59

3-8 نتیجه گیری…………………………. 62

مراجع………………………………….. 63

قبلا حساب کاربری ایجاد کرده اید؟
گذرواژه خود را فراموش کرده اید؟
Loading...
enemad-logo