مطالعه تنوع ژنتیکی درون و بین جمعیت‌های مختلف کور                Capparis spinosa L. با استفاده از نشانگرهای RAPDs

مقدمه 1
1. بررسی منابع 5
1‌.1‌ تاکسونومی گونه Capparis spinosa L. 6
1.1.1 رده‌بندی تاکسونومیکی گونه Capparis spinosa L. 6
1‌.1‌.2‌ مترادف‌های Capparis spinosa L. و نامهای گیاهی پذیرفته شده برای آن 6
1‌.2‌ ویژگیهای مورفولوژیکی 7
1.2.1 ویژگیهای مورفولوژیکی جنس Capparis 7
1‌.2‌.2‌ ویژگیهای گیاه‌شناسی و مورفولوژیکی گونه Capparis spinosa L. 8
1‌.3‌ منشا و پراکنش در ایران 10
1‌.4‌ اهمیت اکولوژیکی Capparis spinosa L.: 12
1‌.5‌ ترکیبات موجود در قسمت‌های مختلف کور 12
1‌.6‌ اهمیت غذایی Capparis spinosa L. 13
1‌.7‌ اهمیت پزشکی و دارویی Capparis spinosa L. 15
1‌.8‌ اهمیت اقتصادی Capparis spinosa L. 16
1‌.9‌ تنوع ژنتیکی در گیاهان، اهمیت و عوامل موثر بر آن 18
1‌.10‌ سیستم‌های تولیدمثلی و تاثیر آن‌ها بر تنوع ژنتیکی جمعیت‌ها 19
1‌.11‌ نشانگرهای مولکولی برای مطالعه‌‌ی تنوع ژنتیکی 21
1.11.1 تکنیک RAPDs و کاربردهای آن 24
1‌.11‌.2‌ مزایا ومحدودیت‌های RAPDs 25
1‌.11‌.3‌ استفاده از تکنیک RAPDs در مطالعه‌ی تنوع ژنتیکی 27
1‌.12‌ روش‌های تجزیه و تحلیل آماری در مطالعات تنوع ژنتیکی 29
1‌.12‌.1‌ فاصله ژنتیکی و معیارهای ارزیابی آن 29
1‌.12‌.2‌ آنالیز خوشهای 30
1‌.13‌ هدف پژوهش 31
2. مواد و روش‌ها 33
2‌.1‌ تهیه نمونه‌های گیاهی 34
2‌.2‌ استخراج DNA ژنوم هستهای 37
2‌.3‌ تعيين كميت و كيفيت ‌‌DNA استخراج شده 39
2‌.4‌ واکنش RAPD-PCR 40
5.2 تهیه ژل آگارز و الکتروفورز محصولات PCR 42
2‌.5‌.1‌ آماده سازی محصولات PCR برای بارگذاری 43
2‌.5‌.2‌ آشکارسازی نوارهای الکتروفورز 43
2‌.6‌ امتیازدهی نوارها 44
2‌.7‌ تجزیه و تحلیل داده‌ها 45
2‌.7‌.1‌ محاسبه‌ی تنوع ژنتیکی درون جمعیت‌ها 45
2.7.2 محاسبه‌ی فاصله ژنتیکی بین جمعیت‌ها 45
2‌.7‌.3‌ تجزیه واریانس ملکولی AMOVA 46
3. نتایج و بحث 48
3‌.1‌ چندشکلی آغازگرهای RAPD در جمعیت‌های مورد مطالعه 49
3‌.2‌ برآورد تنوع ژنتیکی درون جمعیت‌های مورد مطالعه 53
3‌.3‌ برآورد فاصله ژنتیکی بین جمعیت‌ها 54
3‌.3‌.1‌ فاصله ژنتیکی براساس ضریب نی 54
3‌.3‌.2‌ فاصله ژنتیکی براساس آنالوگ FST 56
3‌.4‌ نحوه انتخاب روش مناسب برای تجزیه خوشه‌ای 57
3‌.5‌ تجزیه واریانس ملکولی AMOVA 61
3‌.6‌ بحث و نتیجه‌گیری کلی 62
3‌.7‌ پیشنهادات 68
4. منابع 70