%53تخفیف

غربالگری نمونه¬های خاک از نظر اکتینومیست ¬های تولید کننده¬ی آنتی ¬بیوتیک در استان ایلام

تعداد 60صفحه در فایل word

 

چکیده

زمینه و هدف: مقاومت سریع باکتری­های بیماری زا به آنتی بیوتیک ها، بخصوص مقاومت باکتری ها نسبت به چندین آنتی بیوتیک باعث شده که این مواد از حیطه درمان خارج شوند، که جهت فائق آمدن به این مقاومت نیاز به آنتی بیوتیک­های جدید است. اکتینومیست­ها همواره به عنوان یک منبع اصلی تولید کننده آنتی بیوتیک­های جدید و متابولیت­های ثانویه متنوع، در داروسازی مورد توجه بوده اند. هدف از این تحقیق جداسازی اکتینومیست­های تولید کننده آنتی بیوتیک از خاک­های استان ایلام و بررسی خاصیت ضد میکروبی آن­ها می باشد.

مواد و روش ها: 20 نمونه خاک از عمق 6 تا 02 سانتی متری زمین از مناطق مختلف استان ایلام جمع آوری شدند. نمونه­ها رقیق شدند و برای جداسازی اکتینومیست­ها در محیط کشت استارچ کازئین آگار (SCA) کشت داده شدند. سپس توسط روش­های مورفولوژی، بیوشیمیایی و میکروسکوپی، شناسایی شدند. غربالگری اولیه جهت یافتن جدایه­های فعال با روش Cross streak انجام شد. متابولیت­های تولید شده، استخراج شدند و بررسی فعالیت آن­ها علیه باکتری­های بیماری­زای استافیلوکوکوس اورئوس، کلبسیلا پنومونیه، اشریشیا کلای، پسودوموناس آئروژینوزا با استفاده از روش انتشار در دیسک انجام شد. برای ایزوله­ای که بهترین اثر ضد باکتریایی را داشت PCR با استفاده از پرایمر SrDNA16  انجام شد.

یافته ها: از بین 20 نمونه خاک، تعداد 56 ایزوله اکتینومیست جداسازی و شناسایی شدند. در غربالگری اولیه 4 ایزوله فعالیت ضد باکتریایی  نشان دادند که از این تعداد 1 ایزوله  در غربالگری ثانویه فعال بود. نتایج مرحله دوم غربالگری نشان داد که ایزوله فعال به دست آمده بر علیه باکتری­های استافیلوکوکوس اورئوس، اشریشیاکلای و کلبسیلا پنومونیه با ناحیه بازدارندگی بیش­تر از 10 میلی متر فعالیت قوی داشته است.

نتیجه: نتایج این تحقیق نشان می­دهد خاک­های مناطق مختلف ایلام غنی از اکتینومیست­های فعال تولید کننده ترکیبات ضد باکتریایی جدید است، که نیازمند شناسایی و خالص سازی آن می باشد.

 واژگان کلیدی: اکتینومیست­ها، خاک، فعالیت ضد میکروبی

 

فهرست مطالب

عنوان                                                                                       صفحه

 

فصل اول: مقدمه و کلیات

1-1-مقدمه 2

1-2-اکتینومیست‌ها 2

1-2-1-تاریخچه 3

1-2-2-مورفولوژی. 3

1-2-3-جایگاه 4

1-2-4-اکتینومیست‌های بیماری زا 4

1-2-5-طبقه بندی. 5

1-2-5-1-استرپتومایسس… 6

1-3-آنتی بیوتیک‌ها 6

1-3-1-تاریخچه 6

1-3-2-متابولیت های ثانویه 7

1-3-3-عوامل ضد میکروبی. 8

1-3-3-1-آنتی بیوتیک با طیف اثر محدود 8

1-3-3-2-آنتی بیوتیک با طیف اثر وسیع. 8

1-3-3-3-باکتریواستاتیک… 8

1-3-3-4-باکتریوساید. 8

1-3-4-مکانیسم عمل آنتی‌بیوتیک‌های تولیدی توسط استرپتومایسس‌ها 9

1-3-4-1-آنتی‌بیوتیک‌های موثر بر دیواره سلولی. 9

1-3-4-2-آنتی‌بیوتیک‌های مؤثر بر غشای سلولی. 10

1-3-4-3-آنتی‌بیوتیک‌های موثر بر اسیدهای نوکلئیک… 10

1-3-4-4-آنتی‌بیوتیک‌های ممانعت کننده از سنتز پروتئین. 11

1-3-5-مقاومت آنتی‌بیوتیکی. 14

1-3-5-1-انواع مقاومت آنتی بیوتیکی بر اساس مکانیسم‌های بیوشیمیایی. 15

1-3-6-اساس مقاومت نسبت به آنتی بیوتیک‌ها 16

1-3-7-انواع مقاومت‌های ژنتیکی در برابر آنتی بیوتیک‌ها 17

1-3-7-1-مقاومت کروموزومی. 17

1-3-7-2-مقاومت پلاسمیدی. 18

1-3-7-3-مقاومت ترانسپوزونی. 18

1-3-8-فاکتورهای مؤثر در گسترش و انتشار مقاومت‌های آنتی بیوتیکی. 19

1-3-8-1-انتقال ژنهای مقاومت از یک باکتری به باکتری دیگر. 19

1-3-8-2-جهش در ژن های مقاومت.. 21

1-3-8-3-افزایش فشار محیطی. 21

1-4-اهمیت و ضرورت تحقیق. 21

1-5-اهداف تحقیق. 22

فصل دوم: پیشینه و پژوهشهای انجام شده

2-1-پیشینه 24

2-2-مطالعات در خارج از کشور 24

2-3-مطالعات در ایران. 26

فصل سوم: مواد و روش‌ها

3-1- مواد و وسایل مورد نیاز 28

3-1-2-مواد مصرفی. 29

3-1-3-مواد شیمیای. 30

3-1-4-محیط های باکتریولوژیک… 31

3-1-5-آنتی بیوتیک ها 31

3-1-6-مارکرها 31

3-1-7-سویه‌های استاندارد 31

3-2-نمونه‌گیری و کشت.. 32

3-3-تست‌های فنوتیپی. 33

3-3-1-رنگ آمیزی گرم 33

3-3-2-تست کاتالاز 34

3-3-3-روش تهیه محیط کشت استارچ  کازئین آگار (SCA) 34

3-3-4-محیط کشت فنل رد براث.. 34

3-3-5-تست TSI 35

3-3-6-تست SIM.. 35

3-3-7-تست سیمون سیترات.. 36

3-4-بررسی خاصیت آنتی بیوتیکی باکتری. 36

3-4-1-تهیه محیط کشت MHA.. 36

3-4-2-محلول استاندارد نیم مک فارلند (روش تهیه) 37

3-4-3-آماده سازی سوسپانسیون میکروبی نیم مک فارلند. 37

3-4-4-انجام آزمایش تعیین حساسیت باکتری‌های پاتوژن به روش دیسک دیفیوژن. 37

3-5-آزمایشهای ژنوتیپی. 38

3-5-1-استخراج DNA.. 38

3-5-2-نگهداری DNA استخراج شده 38

3-5-3-ارزیابی کیفیت DNA استخراج شده و تعیین مقدار آن. 38

3-5-4-شناسای ژن ها 40

3-5-4-1-محلولها و بافر. 40

3-5-4-1-1-طرز تهیه بافر X10TEA.. 40

3-5-4-1-1-طرز تهیه بافر X1. 40

3-5-4-1-2-طرز تهیه بافر TE. 40

3-5-4-1-3-طرز تهیه ژل آگارژ 41

3-5-4-1-4- DNA safe stain. 41

3-5-4-1-5-Loading dye. 41

3-5-4-1-6-DNA ladder 42

3-5-4-1-7-MGCL2 42

3-5-4-1-8-آنزیم Taq polymerase. 42

3-5-4-1-9-نوکلئوتیدها (dNTPs) 43

3-5-4-1-10-بافر PCR.. 43

3-5-4-1-11-پرایمرها 43

3-5-5-واکنش PCR.. 44

3-5-5-1-سازو کارواکنش PCR.. 44

3-5-6-الکتروفورز محصول PCR.. 46

فصل چهارم: بحث و نتیجه‌گیری

4-1-نتایج مربوط به جداسازی باکتری ها از خاک… 49

4-2-خصوصیات مورفولوژیکی ایزوله‌های جدا شده از خاک… 50

4-3-تاثیرPH محیط.. 54

4-4-نتایج تست Cross streak. 55

4-5-نتایج روش دیسک دیفیوژن. 56

4-6-شناسایی باکتریهای جدا شده ار خاک… 57

4-7-نتایج PCR.. 59

4-8-بحث.. 60

4-9-نتیجه 62

4-10-پیشنهاد 63

منابع. 64

چكيده انگليسي. 70


فهرست جدول‌ها

عنوان                                                                                       صفحه

جدول (3-1) وسایل مورد  نیاز 28

جدول (3-2) مواد مورد نیاز 29

جدول (3-3) مواد شیمیایی. 30

جدول (3-4) رابطه OD و مقدار اسید نوکلئیک… 39

جدول (3-5) مواد مورد نیاز بافرXTEA10. 40

جدول(3-6) مواد مورد نیاز بافر TE. 40

جدول( 3-7) پرایمرهای استفاده شد. 43

جدول (4-1) فراوانی اکتینومیست های جدا شده بر حسب مکان، نوع و تعداد نمونه های خاک و  PH خاک    49

جدول (4-2) مشخصات ظاهری کلنی های جدا شده از خاک شهر ایلام 50

جدول (4-3)  مشخصات ظاهری کلنی های جدا شده از خاک چشمه کبود 50

جدول (4-4)  مشخصات ظاهری کلنی های جدا شده از خاک بدره 50

جدول (4-5)  مشخصات ظاهری کلنی های جدا شده از خاک  زرین آباد 51

جدول (4-6)  مشخصات ظاهری کلنیهای جدا شده از خاک  شباب.. 51

جدول (4-7) مشخصات ظاهری کلنی های جدا شده از خاک  چشمه شیرین. 51

جدول (4-8)   مشخصات ظاهری کلنی های جدا شده از خاک  زنجیره 52

جدول (4-9)  مشخصات ظاهری کلنی های جدا شده از خاک میش خاص… 52

جدول (4-10) مشخصات ظاهری کلنی های جدا شده از خاک  سرابله 52

جدول (4-11) مشخصات ظاهری کلنی های جدا شده از خاک  حرانمر. 52

جدول (4-12) مشخصات ظاهری کلنی های جدا شده از خاک  پاکل. 53

جدول (4-13)  مشخصات ظاهری کلنی های جدا شده از خاک  ایوان. 53

جدول (4-14) مشخصات ظاهری کلنی های جدا شده از خاک  تنگه رازیانه 53

جدول (4-15) مشخصات ظاهری کلنی های جدا شده از خاک  زیفل. 53

جدول (4-16) مشخصات بیوشیمیایی ایزوله های فعال دارای خاصیت ضد میکروبی. 57

جدول (4-17) مشخصات بیوشیمیایی ایزولههای جدا شده از نمونههای بیمارستانی. 58

 

 

فهرست شكل‌ها

عنوان                                                                                       صفحه

شکل(4-1) نتیجه تستCross streak. 55

شکل(4-2)هاله عدم رشد در مرحله غربالگری ثانویه 56

شکل(4-3)هاله عدم رشد در مرحله غربالگری ثانویه 56

شکل(4-4) الگوی الکتروفورز محصول PCR ژن SrDNA16  59

قبلا حساب کاربری ایجاد کرده اید؟
گذرواژه خود را فراموش کرده اید؟
Loading...
enemad-logo