%34تخفیف

شناسایی  QTLهای مرتبط با مالت دانه جو تحت تنش کمبود آب

تعداد72صفحه در فایل word

به نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی

رساله جهت دریافت درجه دکتری در رشته اصلاح نباتات (گرایش ژنتیک بیومتری)

شناسایی  QTLهای مرتبط با مالت دانه جو تحت تنش کمبود آب

کلید واژهQTL  ،  تنش کم­آبی،  صفات زراعی، صفات مرتبط با مالت، مالت جو

چکیده:

    به منظور شناسایی نواحی ژنومی کنترل کننده صفات کمی (QTLs) مرتبط با مالت در دانه جو، آزمایشی در دو سال زراعی 91 و 92 با استفاده از 81 ژنوتیپ شامل 72 لاين هاپلوئيد مضاعف جو به همراه والدين  Steptoeو Morex و هفت واریته محلی در دو مزرعه تحقیقاتی دانشگاه مهاباد و مرکز تحقیقات کشاورزی میاندوآب در قالب طرح لاتیس ساده با دو تکرار و در دو شرایط عادی و تنش کم­آبی اجرا شد. صفات انرژی جوانه­زنی، ظرفیت جوانه­زنی، درصد جوانه­زنی کل، خواب بذر، درصد پروتئین دانه، مقدار عصاره مالت دانه، درصد پوسته دانه، وزن هکتولیتر دانه، چاقی بذر، ارتفاع بوته، رطوبت دانه، بیوماس، عملکرد عصاره، روز تا سنبله دهی، طول سنبله، تعداد دانه درسنبله، طول پدانکل، وزن هزار دانه، عملکرد دانه و شاخص برداشت دانه مورد اندازه­گیری قرار گرفتند. تجزیهQTL  به روش مکان­یابی فاصله­ای مرکب بر اساس میانگین دومکان در هر یک از شرایط عادی و تنش کم آبی و در دو سال جداگانه انجام گردید. برای بررسی اثرهای اپیستازی افزایشی×  افزایشی و آزمون اثرهای اصلی QTL­های شناسایی شده در یک مدل رگرسیون چند گانه، از روش مکان­یابی فاصله­ای چندگانه استفاده شد. نقشه ژنتيكي جو جمعیت حاصل از تلاقي استپتو×موركس توسط پروژه نقشه يابي ژنوم جو امريكای شمالي (NABGMP) تهيه شده است. اين نقشة نسبتاً اشباع مركب از 327 نشانگر RFLPبا طول 3/1226 و متوسط فاصله بین دو نشانگر مجاور 75/3 سانتي­مورگان بود. طول گروه­های پیوستگی (مطابق با هفت کروموزوم جو) از6/139 تا 205 سانتي­مورگان متغیر بود. نتایج این تحقیق نشان داد که رفتار ژنوتیپ­ها از لحاط صفات مورد بررسی در شرایط مورد آزمایش یکسان نبوده و از یک محیط به محیط دیگر در اثر تنش کم­آبی تغییر کلی و از سالی به سال دیگر تغییر متوسط تا جزئی می­کند. در عین حال، اثر متقابل ژنوتیپ با مکان برای اغلب صفات معنی­دار نبود که این ناشی از یکسان بودن پارامترهای اقلیمی و اکولوژیکی در دو مکان در عرض دوسال مورد آزمایش می­باشد.  لاین­های هاپلویید­ مضاعف از تنوع ژنتیکی قابل توجه و تفکیک متجاوز در هر دو جهت مثبت و منفی از نظر کلیه صفات زراعی، فنولوژیکی و فیزیکی-شیمیایی برخوردار بودند که می­توان از این تنوع در برنامه­های گزینش و به نژادی برای بهبود کمیت و کیفیت مالت دانه بهره­برداری کرد. با توجه به نتایج تلفیقی بدست آمده از روش­های آماری مختلف، به نظر می­رسد که می­توان از صفات مهمی که از وراثت­پذیری و بازده ژنتیکی مورد انتظار خوبی برخوردار بوده و پایداری نسبی دارند، مانند درصد پوسته دانه، وزن هکتولیتر، چاقی بذر، خواب بذر، انرژی جوانه­زنی، وزن هزاردانه و درصد پروتئین دانه که با کیفیت و کمیت مالت مرتبط هستند و همچنین اندازه­گیری ساده و اقتصادی آن­ها از نظر زمان و هزینه نسبت به صفات پیچیده و هزینه بر در سطح میکرو ((Micromalting و پوره کردن در سطح میکرو (Micromashing) برای ارزیابی و گزینش ژنوتیپ­های مناسب از نظر مالت جو استفاده کرد. برای 16 صفت مورد مطالعه در شرایط نرمال و سال اول در مجموع 40  QTL(برای هر صفت 1 تا 5 QTL) و 9 اثر اپیستازی افزایشی× افزایشی معنی­دار و در شرایط نرمال و سال دوم در مجموع 47  QTL(برای هر صفت 1 تا 4 QTL) و 11 اثر اپیستازی افزایشی × افزایشی  شناسایی شدند. در شرایط تنش کم­آبی در سال اول در مجموع 38  QTL(هر صفت 1 تا 5 QTL) و تعداد 6 اثر اپیستازی افزایشی× افزایشی بین QTL ­ها شناسایی شدند. همچنین در سال دوم در شرایط تنش کم­آبی در مجموع 40  QTL(برای هر صفت 1 تا 4 QTL) و 8 اثر اپیستازی افزایشی× افزایشی  شناسایی گردیدند. در مجموع دوسال و میانگین دو شرایط آبی (چهار محیط) 165 QTL و 34 اثر اپیستازی افزایشی × افزایشی بینQTL ­ها شناسایی گردید که از میان آن­ها 19 QTL در هر چهار محیط، پایدار بودند. واریانس فنوتیپی کل تبیین شده به وسیله این QTL­ها برای صفات مختلف از7/25 (ارتفاع بوته)، 24/77 (درصد پروتئین دانه) و وزن هکتولیتر (9/79) متغیر بوده و بیشترین مقدار LOD برایQTL  کنترل کننده چاقی بذر) 08/9 (LOD = روی کروموزوم 3H (Qplum3H) به‌دست آمد. افزون بر این، QTL­های پایدار در هر چهار محیط با LOD  بالا برای صفات موثر بر مالت مانند وزن هزار دانه (13/7)، درصد پروتئین دانه (27/8)، میزان عصاره مالت (48/4)، انرژی جوانه­زنی (12/5)، وزن هکتولیتر (11/6)، خواب بذر (48/5) و عملکرد دانه (05/6) مکان­یابی گردیدند. بیشترین QTL­های پایدار مرتبط با کیفیت و کمیت مالت دانه جو روی کروموزوم­های3H ،4H ،  5Hو 7H مکان­یابی شدند. از برخی از QTL­های پایدار شناسایی شده می­توان در برنامه­های گزینش به کمک نشانگر برای بهبود عصاره مالت و نیز برخی صفات مهم زراعی استفاده کرد.

فهرست مطالب

عنوان

صفحه

مقدمه ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………

1

1- بررسی منابع…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..

4

1-1- اهمیت مالت دانه جو ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………….

5

1-2- کاربرد ژنومیک آماری در اصلاح نباتات……………………………………………………………………………………………………………………………….

7

1-3- تجزیه  QTL و مکان­یابی ژن­های کنترل کننده کمی …………………………………………………………………………………………………………….

8

1-4- کاربرد گزینش به کمک نشانگر……………………………………………………………………………………………………………………..

10

1-5- کارایی مکان­یابیQTL…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………

11

1-6- صفات و شاخص­های موثر در کیفیت و کمیت مالت دانه جو ……………………………………………………………………………………………………

11

1-7- تاثیر تنش کم­ آبی بر کمیت و کیفیت مالت دانه جو ………………………………………………………………………………………………………………..

18

1-8 QTL-های صفات مرتبط با کمیت و کیفیت مالت دانه جو…………………………………………………………………………………………………

21

1-9-اهداف پژوهش…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..

32

2- مواد و روش ها ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………

33

2-1- مواد گیاهی………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….

34

2-2- محل اجرای آزمایش، عملیات زراعی و نحوه اعمال تنش…………………………………………………………………………………………………………

35

2-3- صفات مورد ارزیابی………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………

40

2-4- نقشة ژنتيكي……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….

42

     2-5- تجزیه­های آماری…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..

44

3- نتایج و بحث ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….

47

3-1 تجزیه واریانس صفات…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….

48

3-2- آماره­های تنوع فنوتیپی و ژنتیکی صفات برای لاین­های دابل هاپلوئید مضاعف در دو شرایط نرمال وتنش کم­آبی دو سال  1391و1392………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..

52

3-3- همبستگی صفات در شرایط نرمال وتنش کمبود آب…………………………………………………………………………………………………………………

59

3-4- رگرسیون چندگانه ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………

64

3-5-تجزیه خوشه­ای بر اساس ژنوتیپ­ها ………………………………………………………………………………………………………………………………………….

66

3-5-1-تجزیه خوشه­ای لاین­های هاپلوئید مضاعف جو در شرایط نرمال رطوبتی در میانگین دو مکان و دو سال …………………………………

66

3-5-2-تجزیه خوشه­ای لاین­های هاپلوئید مضاعف جو در شرایط تنش کم آبی در میانگین دو مکان و دو سال ……………………………………….

71

3-6- تجزیه بای پلات GGE………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..

75

3-7- تجزیه QTL…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………

82

3-7-1- تجزیه QTL در شرایط نرمال و میانگین دو مکان در دو  سال ………………………………………………………………………………………………..

82

3-7-2- تجزیه QTL در شرایط تنش کمبود آب در دو  سال برای میانگین دو مکان………………………………………………………………………………..

97

3-7-3- QTL های پایدار در شرایط مختلف محیطی……………………………………………………………………………………………………………………………

113

3-8-  نتیجه گیری………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..

124

3-9- پیشنهادات……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………

126

4- منابع………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..

128

فهرست جداول

عنوان جدول

صفحه

جدول2-1- تجزيه فيزيکوشيميائي خاک محل آزمايش در شهرستان­های مهاباد و میاندوآب…………………………………………………………………………………………

37

جدول 2-2-پارامترهای هواشناسی  در سال زراعی 91-1390 در شهرستان مهاباد………………………………………………………………………………………………………..

38

جدول 2-3-پارامترهای هواشناسی  در سال زراعی 91-1390 در شهرستان میاندوآب………………………………………………………………………………………………..

39

جدول  2-4  توزيع نشانگرها در گروه­هاي پیوستگی نقشه ژنتيكي جمعيت هاپلوئيدهاي مضاعف جو حاصل از تلاقي استپتو × موركس………………………..

43

3-1- تجزيه مركب لاین­های هاپلوئید مضاعف جو در دو سال و دو مكان در شرايط نرمال و تنش رطوبتي در  سال­های 91 و 92 برای صفات زراعی و فیزیکوشیمیایی…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………

50

جدول3-2- پارامترهای آماری وتنوع صفات مورد مطالعه بین 72 لاین هاپلوئید مورد مطالعه به همراه دو والد  ( STEPTOE × MOREX)تحت شرايط نرمال رطوبتي در میانگین دو مكان در سال 91………………………………………………………………………………………………………………………………………………………

55

جدول3-3- پارامترهای آماری وتنوع صفات مورد مطالعه بین 72 لاین هاپلوئید مورد مطالعه به همراه دو والد  ( STEPTOE × MOREX)تحت شرايط تنش در میانگین دو مكان در سال 91…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..

56

جدول3-4- پارامترهای آماری وتنوع صفات مورد مطالعه بین 72 لاین هاپلوئید مورد مطالعه به همراه دو والد ( STEPTOE × MOREX)تحت شرايط  نرمال در میانگین دو مكان در سال 92…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..

57

جدول 3-5- پارامترهای آماری وتنوع صفات مورد مطالعه بین 72 لاین هاپلوئید مورد مطالعه به همراه دو والد TEPTOE × MOREX)تحت شرايط تنش خشکی در میانگین دو مكان در سال 92………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………

58

جدول 3-6–همبستگي بين صفات مورد مطالعه در لاین­های هاپلوئید مضاعف جو تحت شرايط نرمال رطوبتی در متوسط دو مكان و دو  سال…………………..

62

جدول 3-7 همبستگي بين صفات مورد مطالعه در لاین­های هاپلوئید مضاعف جو تحت شرايط تنش کم­آبی در متوسط دو مكان و دو سال………………………

63

جدول 3-8- نتایج رگرسیوم گام  به گام صفات در لاین­های هاپلوئید مضاعف جو تحت شرايط نرمال آبی در متوسط دو مكان و دو سال…………………………

65

جدول 3-9 -نتایج رگرسیوم گام  به گام صفات در لاین­های هاپلوئید مضاعف جو تحت شرايط تنش کم­آبی در متوسط دو مكان و دو سال…………………….

65

جدول 3-10- تجزيه واريانس  بين و درون كلاستر­هاي مورد بررسي در شرايط نرمال آبیاری  لاین­های هاپلوئید مضاعف جو……………………………………….

69

جدول 3-11-  درصد انحراف از میانگین کل كلاستر هاي مورد بررسي  در شرايط نرمال آبیاری  لاین­های هاپلوئید مضاعف جو……………………………………

70

جدول 3-12-  تجزيه واريانس  بين و درون كلاستر­هاي مورد بررسي در شرايط تنش­کم آبی  لاین­های هاپلوئید مضاعف جو………………………………………….

73

جدول 3-13-  درصد انحراف از میانگین کل كلاستر هاي مورد بررسي  در شرایط تنش­کم آبی لاین­های هاپلوئید مضاعف جو………………………………………

74

جدول3-14 همبستگی بین شرایط مختلف محیطی در صفات موثر مالت سازی……………………………………………………………………………………………………………

81

جدول3-15- QTL هاي شناسايي شده براي صفات مورد مطالعه  در جمعیت لاین های هاپلوئید مضاعف جو حاصل از تلاقي دو والد  ( STEPTOE × MOREX) بر اساس میانگین دو مكان نرمال در سال 91……………………………………………………………………………………………………………………………………….

90

جدول3- 16-QTL هاي شناسايي شده براي صفات مورد مطالعه  در جمعیت لاین های هاپلوئید مضاعف جو حاصل از تلاقي دو والد  ( STEPTOE × MOREX) بر اساس میانگین دو مكان در شرایط نرمال 92………………………………………………………………………………………………………………………………

93

جدول3- 17- QTL هاي شناسايي شده براي صفات مورد مطالعه  در جمعیت لاین های هاپلوئید مضاعف جو حاصل از تلاقي دو والد  ( STEPTOE × MOREX) بر اساس میانگین دو مكان در شرایط تنش کم آبی 91………………………………………………………………………………………………………………………..

106

جدول3-18-  QTLهاي شناسايي شده براي صفات مورد مطالعه  در جمعیت لاین­های هاپلوئید مضاعف جو حاصل از تلاقي دو والد  ( STEPTOE × MOREX) بر اساس میانگین دو مكان در شرایط تنش کم آبی سال 92……………………………………………………………………………………………………………………..

109

جدول3- 19-QTL هاي شناسايي شده براي صفات مورد مطالعه حاصل از تلاقي دو والد  ( STEPTOE × MOREX)تحت شرايط نرمال و تنش در دو سال (چهار محیط)…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….

120

جدول3- 20 — QTLهاي شناسايي شده پایدار براي صفات مورد مطالعه  در جمعیت لاین­های هاپلوئید مضاعف جو حاصل از تلاقي دو والد ( STEPTOE × MOREX) در چهار محیط……………………………………………………………………………………………………………………………………………………….

122

فهرست اشکال

عنوان شکل

صفحه

شکل 1-1- ارتباط بین غلظت عصاره مالت تولیدی و غلظت عصاره مالت پیش بینی شده از طریق فرمول کاربردی بیشاپ در جو (بتازویچ وهمکاران، 2007)……………………………………………………………………………………………………………………………………………………..

16

شکل 3-1- دندروگرام تجزیه خوشه­ای لاین­های هاپلوئید مضاعف جو در شرایط نرمال رطوبتی در میانگین دو مکان و دو سال………………

68

شکل 3-2- دندروگرام تجزیه خوشه­ای لاین­های هاپلوئید مضاعف جو در شرایط تنش کم­آبی در میانگین دو مکان و دو سال……………………..

72

شکل 3-3- نمودار بای پلات لاین­های هاپلوئید مضاعف برای عملکرد دانه  …………………………………………………………………………………………

79

شکل 3-4- نمودار بای پلات لاین­های هاپلوئید مضاعف برای غلظت عصاره مالت………………………………………………………………………………..

79

شکل 3-5- نمودار بای پلات لاین­های هاپلوئید مضاعف برای  درصد پروتئین دانه …………………………………………………………………………….

79

شکل 3-6- نمودار بای پلات لاین­های هاپلوئید مضاعف برای چاقی بذر……………………………………………………………………………………………..

79

شکل 3-7- نمودار بای پلات لاین­های هاپلوئید مضاعف برای خواب بذر………………………………………………………………………………………………

80

شکل 3-8- نمودار بای پلات لاین­های هاپلوئید مضاعف برای وزن هزار  دانه………………………………………………………………………………………..

80

شکل 3-9- نمودار بای پلات لاین­های هاپلوئید مضاعف برای انرژی جوانه زنی …………………………………………………………………………………..

80

شکل 3-10- نمودار بای پلات لاین­های هاپلوئید مضاعف برای وزن هکتولیتر……………………………………………………………………………………….

80

شکل 3-11- نقشه پيوستگي و QTL­هاي مکان یابی شده صفات مورد مطالعه  در جمعیت لاين های هاپلوئید مضاعف جو حاصل از تلاقي   STEPTOE × MOREX بر اساس میانگین دو مكان درشرایط نرمال در سال91 ………………………………………………………………………………..

92

شکل 3-12- نقشه پيوستگي و QTL­هاي مکان یابی شده صفات مورد مطالعه  در جمعیت لاين های هاپلوئید مضاعف جو حاصل از تلاقي  STEPTOE × MOREX بر اساس میانگین دو مكان رشرایط نرمال در سال 92…………………………………………………………………………………….

95

شکل 3- 13- نقشه پيوستگي و QTL­هاي پایدار مکان یابی شده صفات مورد مطالعه  در جمعیت لاين های هاپلوئید مضاعف جو حاصل از تلاقي  STEPTOE × MOREX بر اساس میانگین دو مكان در شرایط نرمال در سال91 و 92………………………………………………………………..

96

شکل 3-14-  نقشه پيوستگي و QTL­هاي مکان یابی شده صفات مورد مطالعه در جمعیت لاين­های هاپلوئید مضاعف جو حاصل از تلاقي  STEPTOE × MOREX بر اساس میانگین دو مكان درشرایط تنش کم آبی سال91……………………………………………………………..

108

شکل 3-15- نقشه پيوستگي و QTL­هاي مکان یابی شده صفات مورد مطالعه در جمعیت لاين­های هاپلوئید مضاعف جو حاصل از تلاقي  STEPTOE × MOREX بر اساس میانگین دو مكان درشرایط تنش کم آبی در سال92…………………………………………………………………………

111

شکل 3-16- نقشه پيوستگي و QTL­هاي پایدار مکان یابی شده صفات مورد مطالعه در جمعیت لاين های هاپلوئید مضاعف جو حاصل از تلاقي  STEPTOE × MOREX بر اساس میانگین دو مكان در شرایط تنش کم آبی و میانگین دو سال91 و 92………………………………………………

112

شکل 3-17- نقشه پيوستگي و QTL­هاي پایدار مکان یابی شده صفات مورد مطالعه در جمعیت لاين های هاپلوئید مضاعف جو حاصل از    محیط…………………………………………………………………………………………………………………………………………..

123

قبلا حساب کاربری ایجاد کرده اید؟
گذرواژه خود را فراموش کرده اید؟
Loading...
enemad-logo