%53تخفیف

شناسایی وکلون کردن اپی¬توپ¬های خطی آنتی¬ژن P14-3-3 انگل اکینوکوکوس گرانولوزوس در وکتور pEGFP-N1 و بررسی بیان آن در سلول¬های CHO

تعداد91صفحه در فایل word

کیست هیداتیک یا کیست کبدی یکی از بیماری­های مشترک بین انسان و دام است که در اثر آلودگی با لارو انگل اکینوکوکوس گرانولوزوس (Echinococcous granulosus) ایجاد می­شود و در اکثر نواحی معتدله جهان مثل کشور ایران که صنعت دامپروری رایج است درحال افزایش می­باشد. با توجه به عدم وجود درمان قطعی برای این بیماری ،قطعا پیش­گیری از شیوع این بیماری امری لازم و حیاتی بوده که از طریق بهترین راه پیش­گیری یعنی واکسیناسیون انجام خواهد شد هر چند واکسن نوترکیب EG95 از سال 1995 توانسته در گوسفندانی که با گونه G1 آلوده شده­اند ایمنی در حد 95 درصد را ایجاد کند اما با توجه به تنوع موجود در سروتیپ­های این انگل(G1-G10) و نقش مهم ایمنی سلولی Th1 در درمان و کنترل آن و با در نظر گرفتن این نکته که این نوع واکسن­ها هم ایمنی سلولی و هم همورال را تحریک می­کنند و ایمنی همورال سبب تضعیف Th1 و کاهش ترشح اینترفرون گاما می­شود کارآمد نبوده و امروزه نسل جدیدی از واکسن­ها تحت عنوان واکسن­های ژنی با توجه به توانایی بالای آنها در تحریک ایمنی سلولی در مبارزه با بیماریهای انگلی بیشتر مطرح می­باشد. لذا در این پروژه به منظور طراحی و ساخت یک DNA واکسن موثر علیه کیست هیداتیک با حداقل ساختار ممکن و حداکثر قدرت تحریک ایمنی از توالی کدکننده اپی­توپ­های خطی آنتی­ژن P14-3-3 که ایمونوژن­تر می­باشد و در اکثر مراحل زندگی انگل و سروتیپ­های متعدد با ساختار حفاظت­شده وجود داشته و واکسن نوترکیب آن نیز پاسخ ایمنی چشمگیری را علیه کیست هیداتیک نشان داده، جهت کلونینگ در وکتور بیانی pEGFP-N1 به جای توالی کدکننده آنتی­ژن موردنظر استفاده شد؛ که بررسی بیان آن در سلول­های یوکاریوتی  CHOحاکی از بیان پروتئین موردنظر به همراه پروتئین سبز فلورسنت در این سلول­ها بوده ونتایج امیدبخشی را جهت استفاده از این سازه­ی نوترکیب برای واکسیناسیون حیوانات مدل در آزمایشگاه و بررسی پاسخ ایمنی در آن­ها نشان می­دهد.

کلمات کلیدی: کیست هیداتیک، P14-3-3، DNA واکسن و کلونینگ

فهرست مطالب

فصل اول: مقدمه

مقدمه. 1

1-1: تعریف.. 2

1-2: مورفولوژی.. 2

1-3: مرحله لاروی یا متاسستود(Hydatid) 3

1-4: اجزای کیست هیداتیک… 3

1-5: چرخه انتقال بیماری.. 4

1-6: اپیدمیولوژی.. 6

1-6-1: اپیدمیولوژی در جهان. 6

1-6-2: اپیدمیولوژی در ایران. 6

1-7: علائم بالینی. 7

1-8: روش­های تشخیصی. 7

1-8-1: تست تشخیصی داخل جلدی کازونی. 8

1-8-2: آزمون ثبوت کمپلمان. 8

1-8-4: هماگلوتیناسیون غیر مستقیم 9

1-8-5: ایمنوالکتروفورز. 9

1-9: درمان. 11

1-9-1: جراحی. 11

1-9-2: روش PAIR.. 11

1-9-3: شیمی درمانی. 11

1-10:آنتی­ژن­های انگل: 12

1-11: آنتی­ژن P14-3-3. 13

1-11-1: پروتئین 3-3-14 در اکینوکوکوس.. 14

1-12: پاسخ ایمنی میزبان علیه انگل. 15

1-12-1: پاسخ ایمنی ذاتی علیه کیست هیداتیک… 15

1-12-2: پاسخ ایمنی اکتسابی علیه کیست هیداتیک… 16

1-13: نقش ایمنوژنتیک… 19

1-14: تنوع ژنتیکی. 19

1-15: کنترل و واکسن. 21

1-16: واکسن­های ژنی. 22

1-16-1: ساختار واکسن­های ژنی. 22

1-17: واکسن­های ژنی علیه بیماری­های انگلی. 24

1-17-1: استراتژی­های توسعه واکسن­های ژنی علیه بیماری­های انگلی. 24

1-18: واکسن­های طراحی و ساخته شده علیه اکینوکوکوس گرانولوزوس.. 28

1-18-1: ایمن­سازی میزبانان حد واسط. 28

1-18-2: ایمن­سازی میزبان نهایی. 30

فصل دوم: مواد و روش ها

2-1: تهیه سلول مستعد 39

2-1-1: تهیه سوسپانسیون 5 میلی­لیتری ازسلولDH5α 39

2-1-3: تهیه سلول. 40

2-1-4: تایید سلول­های مستعد ازنظر عدم آلودگی. 40

2-2: انتقال وکتور به سلول مستعد ترانسفورماسیون. 45

2-2-1: ترانسفورم به روش شوک حرارتی. 45

2-3: تخلیص وکتور به روش لیز قلیایی (سمبروک) 46

     2-4: واکنش زنجیرهای پلیمراز PCR                                                                                  54

2-5:هضم محصول PCR و پلاسمید  pEGFP-N1با آنزیم محدودکننده XhoI 53

2-5-1:هضم آنزیمی محصول PCR.. 53

2-5-2: هضم آنزیمی پلاسمید pEGFP-N1. 54

2-6: حذف فسفات انتهای /5 وکتور هضم شده توسط آنزیم آلکالین فسفاتاز (AP). 55

2-7: واکنش اتصال یا لیگاسیون. 56

2-8: ترانسفورماسیون سازه نوترکیب به سلول مستعد 57

2-9: تایید کلنی­های نوترکیب.. 58

2-9-1: PCR مستقیم یا Colony PCR.. 58

2-9-2:PCR  با پرایمرهای GFP. 59

2-9-3: هضم آنزیمی وکتور نوترکیب.. 59

2-9-4: توالی­یابی. 59

2-10-1: کشت سلول CHO.. 61

2-10-2: ترانسفورم وکتور به سلول CHO.. 62

فصل سوم : نتایج

نتایج. 63

3-1: پیش­بینی توالی کدکننده اپی­توپ­های خطی آنتی­ژن P14-3-3. 64

3-2: PCR.. 64

3-3: تخلیص وکتور pEGFP-N1. 65

3-4: هضم آنزیمی وکتورpEGFP-N1 با XhoI 66

3-5: تخلیص وکتور نوترکیب.. 66

3-6: هضم آنزیمی وکتور نوترکیب.. 67

3-7: PCR با استفاده از پرایمرهای GFP. 68

3-8: توالی­یابی. 68

3-9: بیان پروتئین نوترکیب.. 69

فصل چهارم : بحث و نتیجه گیری

بحث و نتیجه گیری.. 71

نتیجه گیری.. 75

پیشنهادها 76

فصل پنجم : منابع

منابع. 77

منابع. 78

فهرست اشکال

شکل 1- 1: تصویر میکروسکوپ الکترونی از ناحیه سر اکینوکوکوس گرانولوزوس.. 3

شکل 1- 2: انگل بالغ اکینوکوکوس گرانولوزوس.. 3

شکل 1- 3: اجزای کیست هیداتیک… 4

شکل 1- 4: چرخه انتقال بیماری بین میزبان واسط و نهایی. 5

شکل 1- 5: اپیدمیولوژی جهانی کیست هیداتیک… 6

شکل 1- 6: فرایندهای پاسخ ایمنی اکتسابی علیه کیست هیداتید 18

شکل 1- 7: ارتباط سایتوکاین­های میزبان و تکامل انگل. 19

شکل 1- 8: پلاسمید pEGFP-N1. 31

شکل3- 1: : توالی پپتیدی و DNA پیش­بینی شده  کدکننده آنتی­ژن P14-3-3  اکینوکوکوس گرانولوزوس.. 64

شکل3- 2: – محصول PCR.. 65

شکل3- 3: : تخلیص وکتور. 65

شکل3- 4: : هضم آنزیمی وکتور                                                                                           66

شکل3- 5:مقایسه اختلاف سایز وکتور طبیعی و نوترکیب.. 67

شکل3- 6: :هضم آنزیمی وکتور نوترکیب.. 67

شکل3- 7:محصول  PCR با پرایمرهای عمومی GFP . 68

شکل3- 8:  توالی قطعه. 69

شکل3- 9: تصویر پروتئین نوترکیب با پروتئین سبز فلورسنت با میکروسکوپ فلورسنت20X.. 70

فهرست  جداول

جدول1- 1: آنتی­ژن­های اکینوکوکوس گرانولوزوس.. 12

جدول1- 2: خلاصه­ای از بهینه­سازی واکسن­های ژنی علیه انگل­ها 26

جدول2- 1: دستگاه ها و وسایل استفاده شده در تحقیق                                                                       34

جدول2- 2: مواد مورد استفاده در تهیه محلول­ها و بافرها 35

جدول2- 3: مواد مورد استفاده برای واکنش  PCR, Ligation, Digestion, AP. 37

جدول2- 4: مواد لازم برای تهیه 1 لیتر محیط LB مایع. 41

جدول2- 5 مواد لازم برای تهیه 1 لیتر محیط  LB آگار 1.5 درصد 42

جدول2- 6: مواد لازم برای تهیه 1 لیتر محیط SOB.. 43

جدول2- 7: مواد لازم برای تهیه 5 میلی­لیتر محلول Stock 1 مولار MgSO4 و MgCl2. 44

جدول2- 8: مواد لازم برای تهیه­ی 50 میلی­لیتر بافر TB.. 44

جدول2- 9: مواد لازم جهت تهیه 50 میلی­لیتر محلول شماره یک I 49

جدول2- 10: ترکیبات لازم جهت تهیه 50 میلی­لیتر محلول شماره دو II 50

جدول2- 11: ترکیبات لازم جهت تهیه 50 میلی­لیتر محلول شماره سه (III) 51

جدول2- 12: توالی پرایمرهای طراحی شده همراه با دمای اتصال. 52

جدول2- 13: محلول­های لازم جهت تهیه 40 میکرولیتر واکنشPCR.. 52

جدول2- 14: مواد لازم جهت هضم آنزیمی محصول PCR.. 54

جدول2- 15: مواد لازم جهت هضم آنزیمی وکتور. 55

جدول2- 16: مواد لازم برای 20 میکرولیتر واکنش آلکالین فسفاتاز (AP) 56

جدول2- 17: ترکیبات لازم برای 30 میکرولیتر واکنش اتصال. 57

قبلا حساب کاربری ایجاد کرده اید؟
گذرواژه خود را فراموش کرده اید؟
Loading...
enemad-logo