%53تخفیف

ریخت شناسی و سیستماتیک مولکولی ماهیان سرماری جنس Channa Scopoli, 1777(شعاع بالگان: ماهیان سرماری) در ایران

تعداد 74صفحه در فایل word

چکیده

ریخت شناسی و سیستماتیک مولکولی ماهیان سرماری جنس
 Channa Scopoli, 1777  (شعاع بالگان: ماهیان سرماری) در ایران

ماهیان سرماری (Snakehead Fishes) ماهیان آب شیرینی هستند که در شرق و جنوب شرقی آسیا، مرکز و غرب آفریقا پراکنش دارند و شامل دو جنس آسيايي Channa و جنس آفريقايي Parachanna می باشند. جمعیت های مختلف  ماهیان سرماری ایران در جنسScopoli, 1777  Channa  و گونه ی Channa gachua قرار داده شده است. در این پژوهش، به منظور تعيين وضعيت آرايه شناختي جمعيت هاي ماهي سرماري ايران، نمونه هایی از آن از حوضه های آبریز مکران، ماشکید و جازموریان ایران جمع آوری گردید و از نظر ريختي و مولکولي مورد بررسي قرار گرفت. تحلیل داده های ریخت شناسی با روش های آنالیز تحلیل واریانس یکطرفه، تحلیل تابع ممیزه و آنالیز خوشه ای انجام شد. مطالعه ی مولکولی با روش تعیین توالی مستقیم در قسمتی از ژن ميتوکندريايي COI صورت گرفت. جهت آنالیز داده های مولکولی از نرم افزارهای Mega6, Mr Bays, RaxML  استفاده شد.  براساس مطالعات ریخت شناسی جمعیت های ماهیان سرماری ایران در 2 گروه اصلی قرار می گیرند: گروه اول شامل جمعیت رودخانه هلیل (حوضه جازموریان) و گروه دوم شامل جمعیت های حوضه های آبریز مکران و ماشکید. بر اساس مطالعات مولکولی ماهیان سرماری ایران از تبار مربوط به  ماهیان سرماری هند، گونه C. gachua جدا شده اند. بر طبق نتایج جمعیت های ماهیان سرماری ایران از نظر ریختی در گروه گونه ای ماهیان سرماری کوچک Channa gachua و از نظر مولکولی در گروه گونه ای ماهیان سرماری شرقیChanna orientalis قرار می گیرند.

واژه های کلیدی: ماهیان سرماری، جنس Channa، COI، ایران

فهرست مطالب

 

عنوان                                                                                      صفحه

فصل اول: مقدمه

1-1- تنوع ماهیان.. 2

1-2 – روش هاي اصلي در مطالعات تاكسونوميكي.. 3

1-2-1- اندازه گيريهاي مورفومتريك (ريخت سنجي) 3

1-2-2- ويژگي هاي شمارشي.. 3

1-2-3- ویژگی های تشریحی.. 4

1-2-4- ویژگی های ژئومتریک مورفومتریک (ریخت سنجی هندسی) 4

1-2-5- مطالعات کاریوتایپی.. 4

1-2-6- طرح های رنگی.. 5

1-2-7- مطالعات مولكولي.. 5

1-3- مطالعات تنوع ژنتيكي در ماهيان.. 5

1-4- تكنيك هاي مولكولي.. 6

1-4-1- تكنيك هاي پروتئيني (آلوآنزيمي) 6

1-4-2- تكنيك هاي DNA… 6

1-4-2-1 تكنيك RFLP.. 7

1-4-2-2- تکنيک PCR… 7

1-5- ژنوم ميتوکندري.. 7

1-6- معرفي تاكسون مورد مطالعه. 8

1-6-1- راسته ی Anabantiformes. 9

1-6-2- خانواده (Channidae)، ماهیان سرماری.. 9

1-6-3- گونه ی جنس Channa Scopoli, 1777 در ایران: 10

1-6-4- سیستماتیک: 10

1-6-5- ویژگی های کلیدی: 10

1-6-6- ریخت شناسی: 10

1-6-7- دو شکلی جنسی: 10

1-6-8- رنگ…. 11

1-6-9- پراکنش…. 11

فصل دوم: نگاهی به مطالعات گذشته و هدف از انجام این پژوهش

2-1- نگاهی به مطالعات گذشته. 13

2-2- اهداف مورد نظر در این پژوهش…. 15

2-2-1- اهداف… 15

فصل سوم: مواد و روش ها

3-1- نمونه برداری.. 17

3-1-1- حوضه مکران (Makran basin) 18

3-1-2- حوضه ماشکید (Mashkid basin) 19

3-1-3- حوضه جازموریان.. 21

3-2- مطالعات ریخت شناسی.. 23

3-3- مطالعات مولکولی.. 25

3-3-1- استخراج DNA  از باله ماهی.. 25

3-3-1-1- استخراج به روش فنل-کلروفورم. 26

3-3-1-2- استخراج به روش نمکی.. 27

3-3-2- انتخاب پرايمر (primer) 28

3-3-3- انجام واكنش PCR… 28

3-3-4- دستگاه ترموسايکلر (Thermocycler) 29

3-3-5- الكتروفورز محصول PCR… 29

3-3-6- عكس برداري.. 30

3-3-7- خالص سازي و تعیین توالی محصول PCR… 30

3-4- روش هاي آماري.. 30

3-5- مواد مورد نياز 31

3-6- دستگاهها و وسایل مورد نیاز 32

فصل چهارم: نتایج

4-1- نتایج توصیفی مورفولوژیکی.. 34

4-1-1- ویژگی های ریخت سنجی نسبی بر مبنای حوضه های جمع آوری.. 34

4-1-2- ویژگی های شمارشی بر مبنای حوضه های جمع آوری.. 36

4-2- مقايسه بين جمعيتي نمونه هاي جمع آوري شده 38

4-2-1- تحليل واريانس يک طرفه ANOVA جمعيت هاي مختلف ماهی

سرماری برمبناي حوضه های جمع آوری جمعيت‌هاي مختلف

ماهی سرماری بر مبنای حوضه های جمع آوری نمونه ها 38

4-2-2- تجزيه و تحليل داده هاي جنس  Channa بر مبنای حوضه های

جمع آوری به روش تابع ممیزه (DFA) 40

4-2-3- آناليز خوشه اي (Cluster Analysis) جمعیت های مختلف ماهی

سرماری بر مبنای حوضه های جمع آوری.. 42

فصل پنجم: بحث و نتیجه‌گیری

5-1- بحث در نتایج.. 52

5-2- نتیجه گیری نهایی.. 58

5-3- پیشنهادات… 58

منابع

منابع فارسی 59

منابع انگلیسی.. 60

چکیده و صفحه عنوان به انگلیسی

 

فهرست جداول

 

عنوان                                                                                      صفحه

 

جدول 3-1- اطلاعات مربوط به ایستگاه های نمونه برداری.. 22

جدول3-3- مواد و مقدار مواد مورد استفاده برای PCR در این پژوهش…. 28

جدول3-4- برنامه چرخه حرارتي PCR جهت بررسي تنوع ژنتيکي جنس Channa. 29

جدول 4-1- محل و تعداد نمونه های جمع آوری شده در این پژوهش…. 34

جدول 4-2- ویژگی های ریخت سنجی نسبی جمعیت های مختلف

ماهي سرماري حوضه های  مختلف… 35

جدول 4-3- ویژگی های شمارشی بررسی شده در ماهی سرماری.. 36

جدول4-4- ویژگی های شمارشی جمعیت های مختلف ماهی سرماری بر مبنای

حوضه های جمع آوری.. 37

جدول 4-5-آزمون واريانس يک طرفه (One-way ANOVA) صفات ریخت سنجی نسبی.. 38

جدول 4-6- آزمون واريانس يک طرفه (One-way ANOVA) ويژگي هاي شمارشي

جمعيت‌هاي مختلف ماهی سرماری بر مبنای حوضه های جمع آوری

نمونه ها 40

جدول 4-7- محل و تعداد نمونه هاي تعیین توالی شده در اين پژوهش…. 43

جدول 4-8- لیست ترادف هاي ژن COI نمونه های گرفته شده از بانک جهانی ژن

سایت (NCBI) 44

جدول 4-9- فاصله ژنی (میزان واگرایی تکاملی) حاصل از مقایسه ژن COI ماهيان

سرماري مورد مطالعه (درصد) 50

 

 

فهرست اشکال

 

عنوان                                                                                      صفحه

 

شکل 1-1- ژن های موجود در DNA ی میتوکندری.. 8

شکل 1-2- شمای کلی از ماهی سرماری کوچک C. gachua. 11

شکل 3-1- حوضه های آبریز 19گانه ایران. 18

شکل3-2- حوضه آبریز مکران.. 19

شکل3-3- حوضه آبریز ماشکید. 20

شکل3-4- حوضه جازموریان.. 21

شکل3-5- نقشه نقاط نمونه برداری جمعیت های ماهی سرماری در جنوب شرق ایران

با استفاده از نرم افزار MapInfo Professional version 7. 23

شکل-3-6- شماي کلي از يک ماهی سرماری کوچک (Channa gachua) که در آن

برخی ويژگي‌هاي اندازه گيري شده مشخص شده است… 25

شکل 4-1- نمودار تحليل تابع مميزه (ِDFA) کل صفات ريخت سنجي نسبي

جمعیت های مختلف ماهی سرماری  بر مبنای حوضه های جمع آوری.. 41

شکل4-2- نمودار تحليل تابع مميزه (ِDFA) صفات شمارشی جمعیت های مختلف

ماهی سرماری بر مبنای حوضه های جمع آوری.. 42

شکل 4-3- آنالیز خوشه ای صفات ریخت سنجی نسبی ماهی سرماری بر مبنای

حوضه های جمع آوری.. 43

شکل 4-5- درخت فیلوژنتیکی حاصل از مقایسه COI جمعیت های مختلف ماهیان

سرماری با روش(ML) Maximum likelihood در نرم افزار Mega 6. 46

شکل 4-6- درخت فیلوژنتیکی حاصل از مقایسه COI جمعیت های مختلف ماهیان

سرماری با روش Neighbor joining (NJ)  در نرم افزار Mega 6. 47

شکل 4-7- درخت فیلوژنتیکی (دارنگاره) حاصل از مقایسه COI جمیت های مختلف

ماهیان سرماری با روش بیژین در نرم افزار Mr Bays. 48

شکل4-8- درخت فیلوژنتیکی حاصل از مقایسه COI جمعیت های مختلف ماهیان

سرماری با روش درست‌نمایی بیشینه در نرم افزار RaxML. 49

 

 

 

قبلا حساب کاربری ایجاد کرده اید؟
گذرواژه خود را فراموش کرده اید؟
Loading...
enemad-logo