|
عنوان
فهرست جدولها.. ط
فهرست شکلها.. ع
فصل اول (مقدمه و اهداف)
1-1- مقدمه.. 1
1-2- اهداف.. 3
1-3-فرضیات تحقیق.. 4
فصل دوم (کليات و مرور منابع)
2-1- اهمیت بررسی تنوع ژنتیکی.. 6
2-2- اهمیت بررسی تنوع فنوتیپی.. 6
2-3-جو.. 7
2-3-1-اهمیت مطالعه جو.. 7
2-3-2-تاریخچه جو.. 8
2-3-3-مناطق کاشت و سطح زیر کشت جو.. 8
2-3-4-بوم شناسی جو.. 9
2-3- 5-کاربرد جو.. 9
2-3-6-جو مدلی مناسب برای مطالعات فیلوژنتیک.. 10
2-3-7- مشخصات ژنوم جو.. 10
2-3-8-اهداف اصلاحی جو.. 11
2-4-اهمیت گلدهی…. 11
فهرست مطالب
|
عنوان
2-4-1-اهمیت بررسی زمان گلدهی در جو……………………….. 12
2-5-اثر تنش خشکی بر رشد گیاه (رابطه عملکرد و زمان گلدهی در شرایط تنش)……………………………………………………………………………………………………. 13
2-6-اهمیت بررسی اثر متقابل ژنوتیپ در محیط……… 14
2-7-ارتباط زمان گلدهی با سازگاری……………………………. 14
2-8-ارتباط زمان گلدهی با گرما…………………………………… 15
2-9-تعریف مرحله گلدهی………………………………………………………. 15
2-10-مهمترین عوامل موثر بر زمان گلدهی………………… 16
2-10-1-فتوپریود.. 16
2-10-2-بهاره سازی.. 16
2-10-3-زودرسی ژنتیکی…. 17
2-11-کنترل ژنتیکی گلدهی.. 18
2-11-1-تشریح مکانیسم گلدهی در گیاه مدل Arabidopsisthaliana.. 18
2-11-2-فرایند گلدهی در غلات…………………………………………… 21
2-11-3-تشریح مکانیسم گلدهی در جو…………………………….. 21
2-11-4-نقش ژنهای FT–Like در فرایند گلدهی جو……….. 24
2-12-نشانگرهای ژنتیکی……………………………………………………….. 24
2-12-1-نشانگرهای مورفولوژیکی………………………………………. 25
2-12-1-1-مشکلات و معایب نشانگرهای موفولوژیکی….. 2
5
2-12-2- نشانگرهای مولکولی……………………………………………… 26
2-12-2-1-نشانگرهای بیوشیمیایی.. 27
فهرست مطالب
|
عنوان
2-12-2-2-نشانگرهایمبتنی بر DNA.. 28
2-12-2-2-1-نشانگرهای DNAغیر مبتنی برPCR.. 29
2-12-2-2-2-نشانگرهای DNAمبتنی برPCR.. 29
2-12-2-2-3-نشانگرهای مبتنی بر PCRهدفمند و توالی یابی………………………………………………………………………………… 29
2-12-2-2-3-1-نحوه ایجاد نشانگرهای CAPS……………….. 30
2-12-2-2-3-2-مارکرIndel………………………………………………………… 31
2-13-روش های آماری در اصلاح نباتات………………………….. 31
2-13-1-تجزیه واریانس.. 31
2-13-1-1- مفروضات تجزیه واریانس.. 32
2-13- 2- همبستگی صفات.. 33
2-13-3- تجزیه رگرسیون.. 33
2-13-3-1-رگرسیون گام به گام…………………………………………………………………………………….. 34
2-13-4-روش های آماری چند متغیره.. 34
2-13-4-1- تجزیه به مولفه های اصلی.. 34
2-13-4-2- تجزیه خوشه ای…………………………………………………… 35
2-14-مرور منابع.. 36
فصل سوم (مواد و روش ها)
3-1- مواد گیاهی.. 40
3-2-گام اول تجزیه مولکولی: استخراج DNAژنومی..
42
3-2-1-مراحل استخراج DNAژنومی………………………………………………………………………………………………… 42
فهرست مطالب
|
عنوان
3-2-2-تعیین کمیت و کیفیت DNAژنومی……………………………………………………………………………………………………….. 43
3-3-گام دوم تجزیه مولکولی: واکنش زنجیره ای پلیمراز.. 43
3-3-1- بهینه سازی واکنش .. 43
3-3-1-1-آغازگرهای مورد استفاده.. 44
3-3-1-2-تنظیم غلظت Mgcl2.. 44
3-3-1-3-اجزای واکنش زنجیره ای پلیمراز.. 45
3-3-2-سیکل زمانی و مراحل واکنش زنجیره ای پلیمراز.. 46
3-3-3-الکتروفورز فراورده های واکنش زنجیره ای پلیمراز.. 46
3-4-گام سوم تجزیه مولکولی: اعمال آنزیم های برشی.. 47
3-4-1-بهینه سازی واکنش جهت اعمال آنزیم برشیNdeI.. 47
3-4-1-1-تنظیم غلظت آنزیمNdeI.. 47
3-4-1-2-محصول PCR.. 47
3-4-1-3-اجزای واکنش.. 48
3-4-1-4-شرایط انکوباسیون آنزیمNdeI.. 48
3-4-2- بهینه سازی واکنش جهت اعمال آنزیم برشی SwaI.. 49
3-4-2-1-تنظیم غلظت آنزیم SwaI.. 49
3-4-2-2-محصول PCR.. 49
3-4-2-3-اجزای واکنش.. 49
3-4-2-4-شرایط انکوباسیون آنزیمSwaI.. 50
3-4-3-بهینه سازی واکنش جهت اعمال آنزیم برشیBstNI.. 50
3-4-3-1-تنظیم غلظت آنزیمBstNI.. 50
فهرست مطالب
|
عنوان
3-4-3-2-محصول PCR.. 51
3-4-3-3-شرایط انکوباسیون آنزیمBstNI.. 51
3-5-بررسی تنوع فنوتیپی.. 51
3-5-1- گلخانه.. 52
3-5-1-1-مراحل انجام بهاره سازی.. 52
3-5-1-2-انتقال به گلخانه.. 52
3-5-1-3-آبیاری.. 53
3-5-1-4-طرح آزمایشی.. 53
3-5-1-5-مشخصات هواشناسی گلخانه.. 53
3-5-1-6-صفات مورد اندازه گیری در شرایط گلخانه.. 54
3-5-1-6-1-صفات فنولوژیک.. 54
3-5-1-6-2-صفات مورفولوژیک.. 54
3-5-2-اجرای آزمایش در شرایط آبی و دیم مزرعه.. 55
3-5-2-1- موقعیت جغرافیایی و ویژگی های آب و هوایی محل اجرای آزمایش.. 55
3-5-2-2- کیفیت خاک محل اجرای آزمایش.. 56
3-5-2-3- عملیات آماده سازی زمین و کاشت.. 56
3-5-2-4- کاشت.. 56
3-5-2-5- صفات مورد اندازه گیری.. 57
3-5-2-5-1- صفت فنولوژیک.. 57
فهرست مطالب
عنوانصفحه
فصل چهارم (نتایج و بحث)
4-1-نتایج اسخراج DNAژنومی.. 59
4-2- نتایج واکنش زنجیره ای پلیمراز.. 59
4-3-نتایج واکنش آنزیم های برشی.. 60
4-4- محاسبه ماتریس فاصله و تشابه ژنتیکی شاخص Nei 62
4-5-میزان آلل های چندشکل در 3 گروه زودرس، متوسط و دیررس جمعیت های جو زراعی و وحشی.. 62
4-6-محاسبه شاخص های ژنتیکی در گروه های 4-5-میزان آلل های چندشکل در 3 گروه زودرس، متوسط و دیررس جمعیت های جو زراعی و وحشی با استفاده از GeneAlex.. 63
4-7-تجزیه واریانس مولکولی حاصل از سیستم نشانگرهای اختصاصی.. 64
4-8-تجزیه کلاستر اطلاعات مولکولی بدست آمده از 4 آغازگر اختصاصی 66
4-9-تجزیه همبستگی نشانگرهای اختصاصی با صفت روز تا گلدهی در شرایط گلخانه.. 67
4-10-تجزیه همبستگی نشانگرهای اختصاصی با صفت روز تا گلدهی در شرایط مزرعه.. 68
4-11-نتایج رگرسیون گام به گام صفت روز تا گلدهی با نشانگرهای اختصاصی در شرایط گلخانه ومزرعه.. 69
4-12-تجزیه همبستگی 11 صفت اندازه گیری شده در گلخانه با نشانگرهای اختصاصی.. 70
4-13-نتایج بررسی صفات مورد اندازه گیری در شرایط گلخانه ای 72
4-13-1-تجزیه واریانس صفات مورفولوژیک و فنولوژیک.. 72
4-14-تجزیه به مولفه ای اصلی برای صفات مورفولوژیک – فنولوژیک 74
4-15-تجزیه کلاستر صفت روز تا گلدهی.. 77
فهرست مطالب
|
عنوان
4-16- بررسی همبستگی بین.. 78
4-17-تجزیه علیت صفات مورد اندازه گیری در شرایط گلخانه 80
4-18-نتیجه گیری کلی.. 82
4-19-پیشنهادات.. 85
بخش ضمیمه (نحوه تهیه محلول وبافرهای مورد استفاده درشرایط آزمایشگاهی )
1- محلول های مورد استفاده جهت استخراج DNAژنومی.. 86
1 -1- بافر CTAB.. 86
1 -2- بافر TE.. 87
1-3- محلولAcetatmix. 87
1 -4- محلول ایزوآمیل الکل کلروفرم (24:1).. 87
2-محلول های مورد نیاز برای تعیین کیفیت DNAژنومی استخراج شده.. 87
2-1-بافر TAE10X.. 87
2-2-اتیدیوم بروماید.. 87
2-3-رنگ بارگذاری.. 87
2-4-مراحل تهیه آگارز 8/0 و 5/1 درصد جهت تعیین کیفیت و تفکیک قطعات تکثیر شده.. 89
2-5-مراحل تعیین کیفیت DNAژنومی استخراج شده.. 90
منابع.. 91
فهرست جدولها
|
عنوان
جدول 3-1- نمونه های مورد استفاده در این تحقیق.. 40
جدول 3-2 آغازگرهای اختصاصی استفاده شده در این تحقیق 44
جدول 3-3- اجزا واکنش PCR.. 45
جدول 3-4– شرایط دمایی و زمانی مورد استفاده جهت انجام واکنش PCR 46
جدول 3-5-آنزیم های برشی مورد استفاده در این تحقیق 47
جدول 3-6- اجزای واکنش جهت اعمال آنزیمNdeI 48
جدول 3-7- اجزای واکنش جهت اعمال آنزیمSwaI 50
جدول 3-8- اجزای واکنش جهت اعمال آنزیمBstNI 51
جدول 3-9- خصوصیات فیزیکی و شیمیایی خاک محل اجرای آزمایش مزرعه 56
جدول 4-1- مقادیر فاصله ژنتیکی و همسانی ژنتیکی(بالای قطر) محاسبه شده از طریق شاخص تصحیح شده Nei بین 3 گروه زودرس- میانه و دیررس جمعیت جوهای زراعی و وحشی
…. 62
جدول 4-2- میزان آلل های چند شکل در بین گروه های زودرس – میانه- دیررس جمعیت های جو زراعی و وحشی.. 63
جدول 4-3- شاخص های ژنتیکی در گروهای زودرس- میانه و دیررس جمعیت جوهای زراعی و وحشی با استفاده از نرم افزار GenAlEx 6.41. 64
جدول 4-4- تجزیه واریانس مولکولی حاصل از سیستم نشانگرهای اختصاصی 65
جدول 4-5- تجزیه همبستگی نشانگرهای اختصاصی با صفت روز تا گلدهی در شرایط گلخانه.. 67
فهرست جدولها
|
عنوان
جدول 4-6- تجزیه همبستگی نشانگرهای اختصاصی با صفت روز تا گلدهی در شرایط مزرعه.. 68
جدول 4-7- خلاصه نتایج رگرسیون گام به گام روز تا گلدهی با نشانگرهای اختصاصی.. 69
جدول 4-8- تجزیه واریانس صفت روز تا گلدهی با نشانگرهای اختصاصیدر شرایط گلخانه.. 71
جدول 4-9– تجزیه واریانس ساده صفات مورفولوژی.. 73
جدول 4-10-تجزیه واریانس ساده صفات عملکرد و اجزای عملکرد 73
جدول 4-11- تجزیه به مولفه های اصلی برای صفات اندازه گیری شده در گلخانه.. 76
جدول 4-12-ضرایب همبستگی صفات اندازه گیری شده در جمعیت مورد مطالعه.. 79
جدول 4-13- تجزیه علیت صفات مورد اندازه گیری در شرایط گلخانه 81
جدول 1- اجزای تشکیل دهنده بافر استخراجCTAB.. 86
جدول 2- مواد لازم جهت تهیه رنگ بارگذاری.. 89
فهرست شکلها
|
