%53تخفیف

بررسی پلی مورفیسم¬های T-786C و G894T در ژن آنزیم نیتریک اکسید سنتتاز اندوتلیالی (eNOS) و بررسی ارتباط آنان با سطح نیتریک اکسید سرمی در افراد سالم غیر خویشاوند استان لرستان

تعداد   119    صفحه در فایل   word

چکیده

 مقدمه: نیتریک اکسید دارای نقش‌هایی حیاتی همچون جلوگیری از تجمع پلاکت‌ها و کاهش اتصال لکوسیت­ها به سلول‌های اندوتلیال عروق، تنظیم عملکرد سلول‌های اندوتلیال و کنترل فشارخون است. این مولکول توسط آنزیم نیتریک اکسید سنتازاندوتلیالی در سلول‌های اندوتلیال سنتز می‌شود.

جایگاه ژن eNOS بر روی کروموزوم شماره 7 (7 q35-q36) قرار داشته و شامل 26 اگزون است. پلی مورفیسم­های ژن eNOS در اقوام و نژادهای گوناگون متفاوت بوده و انتظار می‌رود که وجود این پلی مورفیسم­ها کاهش سطح سرمی NO را به همراه داشته باشد. هدف از انجام این مطالعه بررسی شیوع دو پلی مورفیسم شایع ژن eNOS به نام‌های T-786C و G894 در استان لرستان در افراد سالم غیر خویشاوند بود. ارتباط بین این موتاسیون­ها و سطح سرمی نیتریک اکسید نیز بررسی شد.

روش انجام تحقیق: از دویست فرد غیر خویشاوند که سلامت آنان توسط پزشک متخصص تائید شده بود، با کسب رضایت آگاهانه خون‌گیری در ضد انعقاد EDTA به عمل آمد و بلافاصله استخراج DNA انجام شد. برای تشخیص پلی مورفیسم­ها از روش[1]PCR-RFLP استفاده شد. یک نمونه سرم نیز برای اندازه‌گیری سطح سرمی نیتریک اکسید با روش گریس گرفته می‌شد.

نتایج: شیوع ژنو تیپ‌های GG,GT, و TT در پلی مورفیسم G894T در 192 نمونه، به ترتیب 3/33,7/55 و 9/10 بود که در مقایسه اندازه NO بین این ژنو تیپ‌ها تفاوت معنی‌داری مشاهده نشد. در بررسی شیوع پلی مورفیسم T786C, فراوانی ژنو تیپ TT,TC و CC به ترتیب 1/40, 6/52 و 3/7 بود که سطح سرمی NO در این ژنو تیپ‌ها تفاوت معنی‌داری را با پلیمورفیسم نشان داد

بحث و نتیجه‌گیری:

شیوع پلی مورفیسم­های T-786C و G894T در افراد سالم استان لرستان تقریباً مشابه با شیوع در سایر نقاط جهان است.

لغات کلیدی: نیتریک اکسید، نیتریک اکسید سنتاز اندوتلیالی، پلی مورفیسم G894T، پلی مورفیسم T786C. استان لرستان

[1]Restriction fragment length polymorphism

فهرست مطالب

عنوان                                                                                                                        صفحه

فصل اولمقدمه 1

1-1-ماهیت شیمیایی مولکول اکسید نیتریک.. 2

1-2-وجود NOدر بدن و چگونگی سنتز آن. 3

1-3- ایزو فرم‌های آنزیم نیتریک اکسید سنتاز 5

1-4-تفاوت‌های بین ایزو فرم‌هایNOS. 7

1-5-دلایل وجود آنزیم‌هاگوناگون. 10

1-6-ژن کد کننده eNOS و پلی مورفیسم های آن. 12

1-7-سایر عوامل تنظیم‌کننده تولید نیتریک اکسید. 13

1-8-عواملی که NO به‌وسیله آن‌ها اثرات زیستی خود را اعمال می‌کند. 15

1-9-ویژگی‌هایآنزیم مورد هدف NO.. 18

1-10-محصول sGCو اثرات فیزیولوژیکی آن. 19

1-11-مسیر سیگنالینگ برای NO و GMP حلقوی در سلول‌هایماهیچه‌ای صاف و پلاکت‌ها 21

1-11-1 سیگنالینگ NO در ماهیچه صاف.. 21

1-11-2-سیگنالینگ NO در پلاکت‌ها 23

1-12-واکنش NOبا دیگرگونه‌های واکنش‌پذیر اکسیژن. 26

1-12-1-نیتروزاسیون گروه تیولپروتئین‌ها واهمیت آن. 28

1-12-2-تشکیل پروکسی نیتریت و اهمیت آن. 30

1-13-NOSIII وفعالیت‌های ماکروفاژ 31

1-14- نیتراسیون پروتئین‌ها تحت شرایط فیزیولوژیکی نرمال. 32

1-15-اکسید نیتریک و تنظیم رشد سلولی و تولید پروتئین. 34

1-16-اثر اکسید نیتریک روی بیان ژن. 34

1-17-بیان مسئله 35

1-18-اهداف.. 36

1-19- جامعه‌ی موردمطالعه 36

1-20- رعایت اصول اخلاقی پژوهش… 37

1-21-تجزیه‌وتحلیل آماری: 37

فصل دوم مواد و روش‌ها

2-1-مواد و دستگاه‌ها 39

2-1-1 مواد شیمیائی: 39

2-1-2-محلول‌ها 39

2-1-3-دستگاه‌ها 40

2-2- روش کار 41

2-2-1-نمونه‌گیری. 41

2-2-2-روش استخراج DNA.. 42

2-2-3-جداسازی گلبول‌های سفید با استفاده از فایکول. 42

2-2-4- استخراج DNA با استفاده از کیت.. 43

2-3-بررسی کمی و کیفیDNAاستخراج‌شده 46

2-3-1-روش اسپکتوفتومتر. 46

2-3-2- روش نانودراپ.. 47

2-3-3-روش ژل الکتروفورز 48

2-4-الکتروفورز 48

2-4-1-وسايل و مواد موردنیاز در الكتروفورز 48

2-4-2 آگارز 49

2-4-3-رنگ simply safe. 50

2-4-4-ترکیبات وطرز تهیه TBE(Tris-borate-EDTA) 50

2-4-5- Loading Buffer 51

2-4-6-DNA سایز مارکر (Ladder) 51

2-4-7-طرز تهیه ژل الکتروفورز 52

2-4-8-طريقه بارگذاری كردنRunning Procedure. 53

2-4-9-روش كار دستگاه ژل داك (Gel Doc) 54

2-4-10-شناسایی و بررسی باندها 55

2-5-تکنیک Polymerase Chain Reaction) PCR) 55

2-5-1-حداقل عوامل موردنیاز برای یك واكنش PCR. 56

2-5-1-1- DNA ی الگو. 57

2-5-1-2- پرایمرهای Forward و Reverse 57

2-5-1-3-Taq polymerase 59

2-5-1-4-دزوکسی نوکلئونید تری فسفات‌ها (dNTPs) 60

2-5-1-5- بافرها وMgCl2. 60

2-5-2-پارامترهای مؤثر در PCR. 61

2-5-3- عواملی كه موجب كاهش بازده PCRمی‌شوند. 62

2-5-4-تعیین دمای Annealing پرایمرها جهت PCRژن‌ها 63

2-5-5-انجام PCRSet Up در این مطالعه 63

2-6-پروتکل PCR در این مطالعه 65

2-7-تکنیکRFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) 66

2-7-1-پروتکل انجام RFLPژن‌هایموردمطالعه 68

2-7-2-بررسی پلی مورفیسم در پروموترژن eNOs درموقعیت T786C. 68

2-7-3-بررسی پلی مورفیسم در پروموترژن eNOs درموقعیت G894T. 70

2-8-اندازه‌گیری نیتریک اکسید در خون. 73

2-8-1-مواد لازم برای ساخت معرف گریس… 73

2-8-2-طرز تهیه 74

2-8-3- روش تهیه منحني استاندارد 74

فصل سوم یافته‌ها

3-1-نتایج الکتروفورز جهت تائیدDNA استخراج‌شده: 76

3-2- تعیین غلظت نمونه‌هایDNA با روش اسپکتروفتومتری. 76

3-3-نتایج حاصل از PCR: 77

3-3-1- PCR پلی مورفیسم G894T. 77

3-3-2- PCR پلی مورفیسم T786C. 77

3-4-هضمتوسط آنزیم Ban II 79

3-5-هضم توسط آنزیم Msp I 79

3-6- نتایج حاصل از بررسی پلی مورفیسمG894T. 80

3-7-نتایج حاصل از بررسی درصد فراوانی ژنو تیپT786C. 81

3-8-نتایج حاصل از ارتباط سطح نیتریک اکسیددر خون با پلی مورفیسم G894T. 82

3-9-نتایج حاصل از ارتباط سطح نیتریک اکسید در خون با پلی مورفیسم T786C. 83

3-10-نتایج حاصل از بررسی NO در افرادی که دارای هردو موتانت هستند با افراد دارای یک نوع موتانت یا فاقد موتانت   84

فصل چهارم بحث و نتیجه‌گیری

4-1-بحث و نتیجه‌گیری. 88

منابع. 97

فهرست جدول‌ها

جدول 2-1- ترکیبات وحجم مواد مورد نیاز برای ساخت 500لیتر محلول استوک بوریک اسید . 50

جدول (2-2)- ترکیبات به کار رفته در لودینگ بافر. 51

جدول 2-3- بعد از انجام گرادیانت دمایی بهترین دمای انلینگ و سایر مراحل PCR برای پلی مورفیسم G894T به صورت بالاانجام شد. 64

جدول 2-4- برای پلی مورفیسم T786C بعد از انجام گرادیانت دمایی و انتخابمناسب‌ترین دمای انلینگ طبق جدول بالاPCR  انجام شد. 64

جدول 2-5.برای انجام PCR ازMaster Mix آماده  استفاده شد و کل مواد واکنش PCR در پایان به حجم 25 میکرولیتر می رسند. 66

جدول 2-6-پرایمر های طراحی شده برای انجام PCR  برای هردو پلی مورفیسم. 67

جدول 2-7-پروتکل هضم آنزیم MspI 68

جدول 2-8- قطعات حاصل از برش آنزیم MspI در پلی مورفیسم T786C. 70

جدول2-9-پروتکل هضم آنزیم BanII 71

جدول 2-10-قطعات حاصل از هضم آنزیمیBanII روی PCR پلی مورفیسم G894T. 72

جدول  3-1- فراوانی به دست آمده از واریانت های پلی مورفیسم G894T در این مطالعه 80

جدول 3-2- فراوانی  حاصل از بررسی واریانت های T786C در این مطالعه 81

جدول3-3- میانگین NO بر میکرو مول بر لیتر در کل افراد در بین سه ژنو تیپG894T. 82

جدول 3-4- میانگین NOبرحسب میکرو مول بر لیتر در کل افراد در بین سه ژنو تیپT786C. 83

جدول 3-5- میانگین مقدار NO در افراد دارای موتانت از هر دو نوع پلی مورفیسم (کد3), افراد دارای یک نوع موتانت(کد2)  و فاقد موتانت (کد 1) 85

فهرست نمودارها

نمودار3-1-  نمودار فراوانی انواع زنوتیپ های پلی مورفیسم G894T در این مطالعه. 81

نمودار 3-2-نمودار  فراوانی انواع ژنوتیپ های پلی مورفیسم T786C در این مطالعه 82

نمودار 3-3- نمودار میانگین مقدار NO در هریک از ژنوتیپ های پلی مورفیسم G894T. 83

نمودار3-4-نمودار میانگین مقدار NO در هریک ازژنوتیپ های پلی مورفیسم T786C. 84

نمودار 3-5-میانگین مقدار NO در افراد دارای موتانت از هر دو نوع پلی مورفیسم (کد3), افراد دارای یک نوع موتانت(کد2)  و فاقد موتانت (کد 1) 86

فهرست شکل‌ها

شکل 1-1 بیوسنتز نیتریک اکسید. 4

شکل (1-2) چگونه متابولیسم NO  متناسب با متابولیسم نیتروژن در بدن است.. 5

شکل (1-3) ساختار ایزو فرم‌های مختلف NOs و چگونگی فعال شدن آنها 8

شکل (1-4) کارکرد های فیزیولوزیکی هر یک از ایزوفرم ها 10

شکل (1-5) چگونه استروژن باعث افزایش ترشح NO می‌شود. 12

شکل (1-6) 14

شکل (1-7): نقشNO مشتق شده از اندوتلیوم در تنظیم فشارخون و فعال‌سازیپلاکت‌ها 17

شکل (1-8): ساختاراولیه‌ی پروتئین گوانیلات سیکلاز محلول و فعال شدن آن به شکل GMP حلقوی توسط NO.آنزیم یک هترودیمر با یک جزء همی است که برای اتصال NO و فعال شدن آنزیم ضروری است. 17

شکل (1-9): تنظیم غلظت GMP حلقوی توسط گوانیلیل سیکلاز محلول وفسفودی استراز (PDE)V. 19

شکل (1-10): مکانیسمی که NO توسط آن انقباضاتسلول‌هایعضله‌ی صاف را کاهش می‌دهد.GMP. 22

شکل (1-11): مکانیسم مهار فعال شدن پلاکت‌هاتوسط NO. 25

شکل (1-12): برهمکنش‌های اکسید نیتریک با دیگر تنظیم‌کننده‌های عروقی که از اندوتلیوم یا پلاکت‌ها ترشح می‌شوند. انواعپیام‌رسان‌های اصلی داخل سلولی نشان داده‌شده‌اند. 27

شکل 3-1- تصویر ژل الکتروفورز جهت تائیدDNAاستخراج‌شده. 76

شکل 3-2-نتیجه الکتروفورز چند نمونه PCR شده از پلی مورفیسم G894T  که  در باند 250 قرار گرفته اند. 77

شکل 3-3-نتیجه الکتروفورز حاصل از PCR چند نمونه برای پلی مورفیسم T786C ومشاهده شده باند 180 روی ژل الکتروفورز 78

شکل 3-4-بعد از هضم آنزیمی محصولات PCR پلی مورفیسم G894T توسط آنزیم Ban II قطعات 163 و85 در حالتی که فاقد موتانت است مشاهده شد و در حالتی که دارای موتانت بود فاقد برش بود یعنی همان 250 مشاهده شد. ودر صورتی که  هتروزیگوت بود برش های 163 و85و250 هر سه مشاهده شد. 79

شکل 3-5- پس از هضم آنزیمی  محصولات PCR  پلی مورفیسم T786C توسط آنزیم MspI  در صورت داشتن موتانت هضم شده وباندهای 90و40 و50 ایجاد می‌شود ودر صورت داشتن آلل وحشی 140و40 ایجاد شده و در صورت هتروزیگوت بودن باند های 140،50 و90 ایجاد می‌شود. 80

نقد و بررسی‌ها

هنوز بررسی‌ای ثبت نشده است.

اولین کسی باشید که دیدگاهی می نویسد “بررسی پلی مورفیسم¬های T-786C و G894T در ژن آنزیم نیتریک اکسید سنتتاز اندوتلیالی (eNOS) و بررسی ارتباط آنان با سطح نیتریک اکسید سرمی در افراد سالم غیر خویشاوند استان لرستان”

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *

قبلا حساب کاربری ایجاد کرده اید؟
گذرواژه خود را فراموش کرده اید؟
Loading...
enemad-logo