فهرست
چکیده 1
فصل اول. 3
کلیات تحقیق.. 3
مقدمه. 3
1-1-گیاه شناسی گندم. 5
1-2-تکامل گندم. 6
1-3-طبقه بندی گندم. 6
1-4-اهمیت موضوع. 7
1-4-1- بیماری های قارچی گندم. 7
1-4-2- بیماری های باکتریایی.. 7
1-4-3- بیماری های ویروسی.. 8
1-4-4- بیماری نماتد گندم. 8
1-5-پاسخهای دفاعی گیاه در برابر عوامل بیماری زا 8
1-6-1-انواع مقاومت در برابر با عوامل بیماری زا 10
1-6-1- مقاومت براساس وجود. 10
1-6-1-1- مقاومت ذاتي.. 10
1-6-1-2- مقاومت القایی: 11
1-6-3- مقاومت براساس پاسخ میزبان: 11
1-6-3-1 مصونیت : 11
1-6-3-2- تحمل: 11
1-6-3-3 مقاومت: 11
1-6-4- مقاومت براساس کنترل ژنتیکی: 12
1-6-4-1 الیگوژنتیک : 12
1-6-4-2- پلی ژنتیک: 12
1-6-4-3- سیتوپلاسمیک: 12
1-6-5- مقاومت براساس درجه و محدوده مقاومت: 14
1-6-5-1- مقاومت عمودی: 14
1-6-5-2- مقاومت افقی: 14
1-7-کنترل بیماری.. 15
1-8-ژنهای مرتبط با بیماریزایی(PR پروتینها) 17
1-8-1- تاریخچه. 17
1-8-2- نامگذاری.. 17
1-8-3- بررسی شناخته ترین پروتئین های مرتبط با بیماری زایی.. 18
1-8-3-1- پروتئین های خانواده PR1. 18
1-8-3-2- پروتئینهای خانواده PR2. 19
1-8-3-3- پروتئینهای خانواده PR3. 19
1-8-3-4- پروتئینهای خانواده PR5. 21
1-8-3-5- پروتئینهای خانواده PR6 (بازدارندههای پروتئیناز) 22
1-8-3-6- پروتئین های خانواده PR7. 23
1-8-3-7- پروتئین های خانواده PR8. 23
1-8-3-8- پروتئین های خانواده PR9. 23
1-8-3-9- پروتئین های خانواده PR10. 23
1-8-3-10- پروتئین های خانواده PR12. 24
1-8-3-11- پروتئین های خانواده PR13 )تیونینها) 25
1-8-3-12- پروتئین های خانواده PR14 )LTP) 26
1-8-3-13- پروتئینهای خانواده PR15 و PR16. 26
1-8-3-14- پروتئین های خانواده PR17. 27
1-9-دیگر ژنهای شناخته شده دخیل در مقاومت… 27
1-9-1- NPR1. 27
1-9-2- PAL. 28
1-9-3- Lipase. 29
1-10-بيان ژن. 29
1-10-1-اندازه گیری بیان ژن. 29
1-10-1-1- تعریف و مفهومReal-time PCR. 29
1-10-1-2-ژن رفرنس یا خانه دار. 30
1-10-1-3- مزایای روشReal-time PCR. 30
1-10-1-4- استفاده از رنگآمیزی فلورسنت DNA مانند SYBR Green. 30
1-10-2- روش بررسی کمی بیان ژن یا quantetive real-time PCR.. 31
1-10-3- آنالیز کمی mRNA با استفاده از Real-Time PCR.. 32
1-10-4- متدهای قابل استفاده برای کمیت نسبی با استفاده از یک ژن رفرنس… 32
1-11-فرضیات پژوهش: 33
1-12-اهداف پژوهش….. 33
فصل دوم 35
مروری بر تحقیقات انجام شده 35
2-1- مطالعات ژنتیک مقاومت زنگ قهوه ای.. 36
فصل سوم 42
مواد و روش ها 42
3-1- جمع آوری نمونه و تولید گیاهچه مناسب… 42
3-1-1- تهیه نمونه. 42
3-1-2- تولید گیاهچه جهت تکثیر اسپور. 42
3-1-3- ذخیره و نگهداری اسپور. 43
3-2- مطالعات بیماریزایی.. 44
3-3- آلوده سازی ارقام انتخاب شده برای بررسی بیان ژن. 45
3-4- استخراج RNA.. 45
3-5- بررسی کمی و کیفی RNA استخراج شده 46
3-6- ساخت DNA مکمل (cDNA) 47
3-7- بررسی کیفیت cDNA با استفاده از واکنش زنجیره پلی مراز (PCR) 48
3-7-1- برنامه واکنش PCR: 49
3-7-2- ارزیابی محصول PCR بر روی ژل آگارز: 49
3-8- بررسی بیان ژنها به کمک تکنیک Quantitative real time PCR.. 49
3-9- آنالیز دادهها: 52
فصل چهارم 53
نتایج و بحث.. 53
4-1- ساخت DNA مکمل (cDNA) از RNA کل.. 53
4-2- بهینه سازی شرایط برای Real Time PCR.. 54
4-3- بررسی بیان ژنهای دفاعی در ارقام آجیلوپس تاوشی و تجن پس از آلودگی با قارچ P. triticina. 56
4-3-1- بررسی الگوی بیان ژن PR1-1 در ارقام آجیلوپس تاوشی و تجن در تعامل با قارچ P. triticina. 56
4-3-2- بررسی بیان ژن PR2 در ارقام آجیلوپس تاوشی و تجن در تعامل با قارچ P. triticina. 58
4-3-3- بررسی بیان ژن PR3 در ارقام آجیلوپس تاوشی و تجن در تعامل با قارچ P. triticina. 59
4-3-4- بررسی الگوی بیان ژن PR5 در ارقام آجیلوپس تاوشی و تجن در تعامل با قارچ P. triticina. 60
4-3-5- بررسی بیان ژن LTP در ارقام آجیلوپس تاوشی و تجن در تعامل با قارچ P. triticina. 62
4-4- بحث… 64
4-4-1- غربالگری ارقام تجاری و لاینهای تقریبا ایزوژنیک در شرایط همسان با عامل زنگ قهوهای.. 66
4-4-2- بیان PR پروتئینها در گندم پس از تلقیح با قارچ P. triticina. 67
4-4-2-1- ژن PR1-1 در مقاومت به قارچ P. triticina در گندم نقش دارد. 68
4-4-2-2- ژن -1,3-glucanase) PR2 ( در مقاومت رقم آجیلوپس تاوشی به قارچ P. triticina دخالت دارد 68
4-4-2-3- نقش مثبت ژن PR3 (Chitinase) در مقاومت رقم آجیلوپس تاوشی به قارچ P. triticina. 69
4-4-2-4- نقش مثبت ژن PR5 (Thaumatin-like proteins) در مقاومت رقم آجیلوپس تاوشی به قارچ P. triticina 69
4-4-2-5- افزایش نرخ بیان ژن LTP (Lipid transfer protein) در رقم مقاوم آجیلوپس تاوشی در برابر قارچ P. triticina. 70
فصل پنجم. 73
نتیجه گیری. 73
پیشنهادات.. 74
منابع. 75
Abstract 89
فهرست جدول ها |
جدول 1-1 لیست خانوادههای شناخته شده PR پروتئینها (وان لون و همکاران، 2006) ………………………………….17 |
جدول 3-1- غلظت و مقادیر حجمی ترکیبات مورد نیاز جهت ساخت DNA مکمل (cDNA) از نمونه های RNA استخراجی…………………………………………………………………………………………………………………………………………………..47 |
جدول 3-2- غلظت و مقادیر حجمی ترکیبات مورد نیاز جهت ساخت DNA مکمل (cDNA) از نمونه های RNA استخراجی…………………………………………………………………………………………………………………………………………………..48 |
جدول 3-3- ترکیب و غلظت مواد مورد استفاده برای انجام واکنش PCR…………………………………………………………48 |
جدول 3-4- ترکیب و غلظت مواد مورد استفاده در واکنش q-PCR……………………………………………………………….49 |
جدول 3-5- نحوه رقیقسازی جهت رسم منحنی استاندارد……………………………………………………………………………..50 |
جدول 3-6- شرایط دمایی و زمانی مراحل مختلف واکنش q-PCR………………………………………………………………..51 |
جدول 3-7- لیست ژن ها و توالی آغازگرهای مورد استفاده در این تحقیق………………………………………………………..51جدول 4-1 بررسی درجه خلوص و غلظتRNA استخراجی با استفاده از دستگاه اسپکتروفتومتر………………………..54 |
فهرست نمودار ها |
نمودار4-1- نرخ بیان ژن PR1-1 در ارقام آجیلوپس تاوشی و تجن پس از آلودگی با قارچ P. tritici…………….57 |
نمودار 4-2- نرخ بیان ژن PR2 در ارقام آجیلوپس تاوشی و تجن پس از آلودگی با قارچ P. triticina…………59 |
نمودار 4-3- نرخ بیان ژن PR3 در ارقام آجیلوپس تاوشی و تجن پس از آلودگی با قارچ P. triticina…………60 |
نمودار 4-4- نرخ بیان ژن PR5 در ارقام آجیلوپس تاوشی و تجن پس از آلودگی با قارچ P. triticina…………62 |
نمودار 4-5- نرخ بیان ژن LTP در ارقام آجیلوپس تاوشی و تجن پس از آلودگی با قارچ P. triticina…………63 |
نقد و بررسی‌ها
هنوز بررسی‌ای ثبت نشده است.