%53تخفیف

ارزیابی جهش های ژن های KRAS و BRAF دربیماران مبتلا به سرطان کولورکتال

تعداد 32 صفحه در فایل word

چکیده                                                              

ژن‌های KRAS و BRAF به عنوان هدف‌های تغییرات ژنتیکی در سرطان کولون (CRC) می‌باشند، که بیومارکرهای تشخیصی و پیش‌آگهی‌دهنده در بیماران متاستاتیک درمان‎شده با آنتی‎بادی‌های مونوکلونال anti-EGFR (mAbs) مثل Cetuximab و Panitumumab می‌باشند. جهش در KRAS منجر به از بین رفتن فعالیت GTPase می‎شود و به فعال شدن مسیر سیگنالینگ Ras/ Raf  در 35 تا 42 درصد بیماران مبتلا به CRC منجر می‌گردد. فعال‎شدن جهش‌های ژن BRAF تقریبا در 15-4% CRC یافت می‎شود.

از آنجائیکه بررسی این جهش‌ها برای بیماران مبتلا به CRC از اهمیت خاصی بر‎خوردار است و تا‌کنون در ایران این پژوهش صورت نگرفته است، بر آن شدیم که فراوانی این جهش‌ها را در جامعه کوچکی از بیماران ایرانی بررسی کنیم.

‌این مطالعه بر روی50 بلوک پارافینه بیمارانی که دارای تائید ایمنوهیستوشیمی و هیستوپاتولوژی سرطان کولورکتال بودند و در سال 91به آزمایشگاه پیوند تهران مراجعه کرده بودند، انجام شد. پس از استخراج DNA از این بلوک‌های بافتی و بررسی کیفی DNA استخراج شده، با استفاده از روش reverse dot blotting به ارزیابی جهش‌های ژن KRAS و BRAF پرداخته شد.

‌جهش‎های ژن KRAS در 42% بیماران یافت شد، به طوریکه در کدون 12، 30% و در کدون 13، 12% این جهش‎ها مشاهده گردید و همچنین در 10% بیماران مورد مطالعه ژن BRAF دارای جهش بود. در این مطالعه ارتباط جهش‌ها با جایگاه تومور، جنسیت، سن تشخیص، درجه تمایز و متاستاتیک بودن تومورها بررسی شد. به طور کلی بررسی فراوانی جهش‎های این دو ژن مشابه با مطالعات انجام شده در سایر کشور‌ها بوده است و در این مطالعه به ارتباط معناداری میان جهش‎ها و فاکتورهای ذکر شده یافت نشد، با توجه به فراوانی بالای جهش‎ها و سن پائین تشخیص و نقش آنها در مدیریت بیماری بررسی جهش‌های این دو انکوژن در بیماران مبتلا به سرطان کولورکتال پیشنهاد می‌گردد. اگرچه یافته‎های این پژوهش با یافته‌های مطالعات گذشته چندان مغایرتی ندارد، ولی در مطالعات آینده، پژوهش بر روی جمعیت گسترده‎تری از بیماران مبتلا به سرطان کولون پیشنهاد می‌شود.

واژه‏های کلیدی: KRAS، BRAF، سرطان کولورکتال

فهرست عناوين

صفحه

خلاصه فارسی. ‌أ

فهرست مطالب  …………… ج

فهرست اشکال و جداول ……………………………………………………………………………………………………………………………… ه

علائم واختصارات………………………………………………………………………………………………………………………………………….ی

مقدمه…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..1

فصل اول: کلیات وبررسی منابع………………………………………….. Error! Bookmark not defined.3

1‌.1‌     آناتومی و هیستولوژی کولون. 4

1‌.2‌     انواع سرطان کولورکتال. 6

1‌.3‌     درجه تمایز. 7

1‌.4‌     علائم سرطان کولورکتال. 8

1‌.5‌     غربالگری سرطان کولورکتال. 8

1‌.6‌     تست‎های بعد از تشخیص… 9

1‌.7‌     مراحل سرطان کولون. 9

1‌.8‌     روش‎های درمان سرطان کولورکتال. 12

  1. 8. 1 کولکتومی. 13

  2. 8. 2 جراحی گره‏های لنفاوی.. 13

  3. 8. 3‌ رادیوتراپی. 13

  4. 8. 4 درمان سیستمیک… 13

  5. 8. 5‌ شیمی‎درمانی. 14

  6. 8. 6‌ درمان‎های هدفمند 14

1‌.9‌     عوارض جانبی درمان‎ها 15

1‌.10‌   عوامل ژنتیکی ایجادکننده سرطان کولورکتال. 15

  1. 10. 1‌گیرنده فاکتور رشد اپیدرمی. 16

  2. 10. 2 پروتوانکوژن RAS. 17

  3. 10. 2. 1‌ فعال شدن Ras 21

1‌.10‌.2‌.2‌ جهش در KRAS. 22

1‌.10‌.3‌    پروتوانکوژنRaf. 25

1‌.10‌.3‌.1‌ جهش در ژن BRAF. 26

1‌.11‌   درمان‎های هدفمند 27

فصل دوم:  مواد و روش‏ها 31

2‌.1‌     فهرست وسایل و مواد مورد نیاز. 32

2‌.2‌     نمونه های مورد مطالعه 33

2‌.3‌     اساس استخراج DNA از بلوک‌های پارافینه 33

  1. 3. 1‌ محلول‌های مورد استفاده در استخراج DNA.. 33

2‌.3‌.2‌  استخراج DNA از بلوک‌های بافتی پارافینه. 34

2‌.3‌.3‌  کنترل کیفی و کمی DNA استخراج شده 35

2‌.3‌.3‌.1‌   واکنش زنجیره‎ای پلی مراز ژن β-گلوبین. 35

2‌.4‌     اساس بررسی جهش‎های ژن KRAS و BRAF با روش reverse dot blotting. 36

  1. 4. 1‌ محلول‌های مورد استفاده در روش reverse dot blotting. 37

2‌.4‌.1‌.1‌   بافر Stringnt 37

2‌.4‌.1‌.2‌   بافر5X  Rinse. 37

2‌.4‌.2‌  واکنش زنجیره‌ای پلی مراز جهت انجام روش reverse dot blotting. 37

 2‌.4‌.3‌ مراحل انجام هیبریداسیون. 38

2.5‎     طراحي پرايمر‌هاي اختصاصي برای واکنش زنجیره‌ای پلی مراز. 40

2‌.6‌     اساس روش PCR-RFLP. 41

2.6‌.1‌  انجام روش PCR-RFLP. 42

2‌.6‌.2‌  مشخصات آنزیم‎های محدودالاثر استفاده شده در این تحقیق. 45

2‌.7‌     اساس روش Allele Specific PCR. 45

2‌.7‌.1‌  روش Allele specific PCR.. 46

2‌.8‌     اساس الکتروفورز ژلی. 47

2‌.8‌.1‌  محلول‎های لازم جهت تهیه ژل پلی آکریل‎آمید 48

2‌.8‌.1‌.1‌   محلول آکریل‌آمید 48

2‌.8‌.2‌  تهیه ژل پلی آکریل‎آمید 48

2‌.8‌.3‌  نحوه الکتروفورز کردن. 49

2‌.8‌.4‌  رنگ‌آمیزی ژل. 50

2‌.8‌.4‌.1‌   محلول‎های مورد استفاده جهت رنگ‌آمیزی ژل پلی آکریل‌آمید 50

2‌.9‌     آنالیز آماری داده‌ها 51

فصل سوم: نتایج. 52

3‌.1‌     مطالعه جمعیت. 53

3‌.2‌     نتایج حاصل از کنترل کیفی استخراج DNA. 53

3‌.3‌     نتایج حاصل از آشکارسازی جهش در ژن‎های KRAS و BRAF. 54

3‌.3‌.1‌  نتایج حاصل از روش reverse dot blotting. 54

3‌.3‌.2‌  نتایج حاصل از روش PCR-RFLP ژن KRAS. 55

3.3.3  نتایج حاصل از روش Allele specific PCR جهت آشکارسازی جهش ژن BRAF. 57

3‌.4‌     نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل آماری. 58

3‌.4‌.1‌  هیستولوژی.. 58

3‌.4‌.1‌.1‌   جایگاه تومور. 59

3‌.4‌.1‌.2‌   درجه‎بندی بافت‌شناسی. 59

3‌.4‌.2‌  تومور‎های متاستاتیک… 60

3.4‎.3‌  نتایج بررسی جهش‎های ژن KRAS. 60

3‌.4‌.3‌.1‌   فراوانی جهش‎های کدون 12 پروتوانکوژن KRAS. 62

3‌.4‌.3‌.2‌   فراوانی جهش‎های کدون 13 پروتوانکوژن KRAS. 63

3‌.4‌.3‌.3‌   فراوانی جهش‎های کدون 61 ژن KRAS. 64

3‌.4‌.4‌  نتایج بررسی جهش ژنBRAF. 64

3‌.5‌     آزمون کولموگروف اسمیرنوف.. 65

3‎.6‎     آزمون استقلال جدول توافقي. 66

3‌.6‌.1  بررسی ارتباط جنسیت با نوع جهش در ژن‎های KRAS و BRAF. 66

3‌.6‌.2  بررسی ارتباط جایگاه تومور با نوع جهش در ژن‎های KRAS و BRAF. 71

3‌.6‌.3‌  بررسی ارتباط وجود جهش در ژن‎های KRAS و BRAF با متاستاز. 81

3.6.4‌  بررسی ارتباط جهش در ژن‎های KRAS و BRAF با درجه تمایز تومور. 82

3‌.6‌.5‌  بررسی ارتباط جهش در ژن های KRAS و BRAF با تومورهای موسینی و غیر موسینی. 86

3‌.6‌.5‌.1‌   بررسی ارتباط جهش در کدون 12 ژن KRAS با تومورهای غیرموسینی و موسینی. 86

3‌.6‌.5‌.2‌   بررسی ارتباط جهش در کدون 13 ژن KRAS با تومورهای غیرموسینی و موسینی. 87

3.6‎.5.3‎    بررسی ارتباط جهش در ژن BRAF با تومورهای غیرموسینی و موسینی. 88

3‌.7‌     آزمون همبستگي. 89

3‌.7‌.1‌  بررسی ارتباط جهش در ژن‌های KRAS و BRAF با سن تشخیص بیماران. 90

فصل چهارم: بحث. 93

4‌.1‌     بحث . 94

4‌.2‌     نتیجه گیری. 105

4‌.3‌     پیشنهادات. 105

منابع و مراجع. 107

پيوست‌ها 112

نقد و بررسی‌ها

هنوز بررسی‌ای ثبت نشده است.

اولین کسی باشید که دیدگاهی می نویسد “ارزیابی جهش های ژن های KRAS و BRAF دربیماران مبتلا به سرطان کولورکتال”

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *

قبلا حساب کاربری ایجاد کرده اید؟
گذرواژه خود را فراموش کرده اید؟
Loading...
enemad-logo