%34تخفیف

ارزیابی تنوع ژنتیکی توده های بومی شلغم ایرانی با استفاده از صفات مورفولوژیکی و نشانگرهای مولکولی RAPD

تعداد81 صفحه در فایل word

کارشناسی ارشد رشته علوم باغبانی (M.Sc)

(گرایش فیزیولوژی و اصلاح سبزی­ها)

ارزیابی تنوع ژنتیکی توده های بومی شلغم ایرانی با استفاده از صفات مورفولوژیکی و نشانگرهای مولکولی RAPD

چکیده

شلغم (Brassica rapa L.)  یکی از سبزی های مهم ریشه ای است که بومی شرق افغانستان و غرب پاکستان و مناطق مدیترانه ای و سایر مناطق آسیایی است. در این تحقیق 19 توده شلغم بومی ایران و رقم انگلیسی Top Milan، به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی، توسط صفات مورفولوژیکی و نشانگر های مولکولی RAPD مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج نشان داد که توده های چناران (6/186 گرم) قطر بزرگ و کوچک ریشه غده ای به ترتیب (57/52 و 35/70 میلی متر)، اصفهان (16 برگ) و طبس (1672 گل) به ترتیب بیشترین وزن و اندازه ریشه غده ای، تعداد برگ و تعداد گل را تولید کردند. نتایج تجزیه همبستگی ساده صفات، همبستگی معنی دار و مثبتی را بین برخی از صفات مهم از جمله اندازه برگ، اندازه و وزن ریشه غده ای نشان داد. در تجزیه عامل صفات مورفولوژیک، نُه عامل اصلی و مستقل در مجموع 35/87 درصد واریانس کل را توجیه نمودند و تجزیه خوشه ای، توده ها را در هفت گروه قرار داد. توده های جمع آوری شده به کمک نشانگر مولکولی RAPD ارزیابی شدند در این تحقیق 54 آغازگر مورد استفاده قرار گرفت که در 15 آغازگر تنوع مشاهده گردید و باندها در محدوده ی 200 تا 2800 جفت باز (bp) مشاهده گردید. بیشترین شباهت در توده های سبزوار و هرات- مروست (83/0) و کمترین تشابه بین توده های ملک آباد مشهد و علی آباد یزد (32/0) بود. درصد چند شکلی توده ها بین 60 الی 100درصد و بطور میانگین 80 درصد بود. بر این اساس تجزیه خوشه ای 19 توده شلغم مورد مطالعه را به 9 گروه تقسیم نمود. ضریب کوفنتیکی بین ماتریس تشابه و دندروگرام در حد 90/0r= بدست آمد که نشان دهنده همبستگی مناسب دندروگرام با ماتریس تشابه بود، درحالیکه همبستگی بین داده های مورفولوژیکی و داده های حاصل از نشانگرهای RAPD پایین بود (12/0r=). دندروگرام و گروه های بدست آمده نشان دادند که نشانگرهای بکار رفته در این تحقیق به خوبی توانسته است توده های شلغم را از یکدیگر تفکیک نمایند.

کلید واژه ها: شلغم، تنوع ژنتیکی، صفات مورفولوژیکی، نشانگر RAPD، تجزیه خوشه ای، تجزیه عامل

فهرست مطالب

چکیده 1

فصل اول: مقدمه و کلیات 2

1ـ1ـ مقدمه 3

1ـ2ـ گياه‌شناسي 4

1ـ2ـ1ـ رقم های شلغم 5

1ـ3ـ شرايط محيطي مطلوب كاشت و پرورش شلغم 5

1ـ4ـ ارزش غذايي و موارد كاربرد شلغم 6

1ـ5ـ تنوع ژنتيكي 8

1ـ6ـ نشانگرهاي ژنتيكي 8

1ـ7ـ انواع نشانگرهاي ژنتيك 9

1ـ7ـ1ـ نشانگرهاي مورفولوژيك 9

1ـ7ـ2ـ نشانگرهاي مولكولي 9

1ـ7ـ2ـ1ـ نشانگرهاي بيوشيميايي 10

1ـ7ـ2ـ2ـ نشانگرهاي DNA 10

1ـ7ـ2ـ2ـ1ـ نشانگرهاي DNA غيرمبتني بر PCR 11

1ـ7ـ2ـ2ـ2ـ نشانگرهاي DNA مبتني بر PCR 12

1ـ8ـ واكنش زنجيره‌اي پليمراز (PCR) 12

1ـ9ـ نشانگرهاي RAPD 13

1ـ9ـ1ـ محاسن و معايب نشانگرهاي RAPD 13

1ـ9ـ2ـ كاربرد نشانگرهاي RAPD 14

فصل دوم: ادبيات و مروري بر منابع 16

فصل سوم: ارزیابی تنوع ژنتیکی توده های شلغم با استفاده از صفات مورفولوژیکی 19

3ـ1ـ مقدمه 20

3ـ2ـ مواد و روش‌ها 20

3ـ2ـ1ـ مواد گياهي 20

3ـ2ـ2ـ ارزيابي صفات 23

3ـ2ـ3ـ تجزيه داده‌ها 26

3-3- نتایج و بحث 27

3-3-1-  تجزیه واریانس 27

3-3-2- ضرایب همبستگی صفات 33

3-3-3- تجزیه خوشه­ای 37

3-3-4- تجزیه به عامل­ها 40

فصل چهارم: بررسی تنوع ژنتیکی توده های شلغم با استفاده از نشانگرهای مولکولی RAPD 43

4ـ1ـ مقدمه 44

4ـ2ـ مواد و روش‌ها 45

4ـ2ـ1ـ مواد گياهي 45

4ـ2ـ2ـ استخراج DNA 45

4ـ2ـ3ـ تعيين كميت و كيفيت DNA 48

4ـ2ـ4ـ انجام آزمايش‌هاي RAPD 48

4ـ2ـ4ـ1ـ آغازگرها 48

4ـ2ـ4ـ2ـ دزوكسي نوكلئوتيد تري فسفات‌ها (dNTPs) 49

4ـ2ـ4ـ3ـ كلريد منيزيم MgCl2 49

4ـ2ـ4ـ4ـ DNA الگو 50

4ـ2ـ4ـ5ـ بافر PCR 50

4ـ2ـ4ـ6ـ آنزيم Taq DNA Polymerase 50

4ـ2ـ4ـ7ـ تنظيم شرايط براي PCR 50

4ـ2ـ4ـ8ـ الكتروفورز محصولات تكثير شده PCR 51

4ـ2ـ5ـ محاسبات آماري 52

4-3- نتایج و بحث 52

4-3-1-نتایج بدست آمده از نمودار دندروگرام ضریب تشابه جاکارد 54

فصل پنجم: بحث و نتیجه گیری کلی 58

5-1- بحث و نتیجه گیری کلی 59

5-2-پیشنهادات 61

منابع 62

پیوست­ها 67

فهرست جداول

جدول 1-1- ارزش غذایی و مواد موجود در قسمت خوراکی شلغم تازه 7

جدول3-1- مناطق پراکنش و جمع آوری توده های شلغم بومی ایران 24

جدول3-2-صفات مورفولوژیکی کمی اندازه گیری شده 25

جدول3-3- صفات مورفولوژیکی کیفی اندازه گیری شده 26

جدول3-4-تجزیه واریانس میانگین مربعات صفات مورفولوژیکی 28

جدول3-5-مقایسه میانگین صفات کمی (آزمون دانکن) 27

جدول3-6-ضرایب همبستگی ساده بین صفات مورفولوژیکی 36

جدول3-7-تجزیه به عامل ها 40

جدول3-8-ضرایب عامل صفات مختلف مورفولوژیکی 42

جدول4-1-مواد لازم برای تهیه محلول پایه PCR 49

جدول4-2-شرایط PCR 51

جدول4-3-فهرست آغازگرهای تصادفی 52

جدول4-4-ضرایب ماتریکس تشابه حاصل از داده های RAPD 56

فهرست شکل ها

شکل3-1-محل جمع آوری توده های بومی شلغم ایرانی 21

شکل3-2-تصاویر توده های شلغم مورد مطالعه 22

شکل3-3-دندروگرام تجزیه خوشه ای بر اساس صفات مورفولوژیکی 39

شکل4-1-الگوی باندی حاصل از تکثیر DNA 53

شکل4-2-دندروگرام داده های حاصل از نشانگر RAPD 57

قبلا حساب کاربری ایجاد کرده اید؟
گذرواژه خود را فراموش کرده اید؟
Loading...
enemad-logo