%38تخفیف

دانلود پروژه: ارائه ی یک مدل داده مناسب برای کشف انتقال بیماری های ژنتیکی

تعداد 124 صفحه در فایل word

چکیده

در جامعه امروزی با توجه به پیشرفت علم پزشکی حجم داده­های پزشکی به سرعت در حال افزایش هستند. برای تحلیل سریع­تر و کارآمدتر این داده­ها نیاز به ذخیره الکترونیکی این داده­ها داریم. داده­های مربوط به بیماری­های ژنتیکی نیز از این دسته داده­ها به حساب می­آیند. با توجه به این مسئله می­بایست پایگاه داده­ای مناسب ذخیره و بازیابی این داده ها طراحی نماییم. با توجه به ماهیت داده های ژنتیکی و این مسئله که در مورد انتقال بیماری های ژنتیکی روابط بین افراد و تجزیه تحلیل آن مسئله مهمی به حساب می­آید در این مقاله برای ذخیره و بازیابی این داده­ها از مدل داده­ی گرافی که یکی از زیر مجموعه­های مدل داده­های غیر ساخت یافته (NOSQL)است استفاده می­نماییم. برای این کار ابتدا نیازها و پرس و جوهای مربوط به این مسئله را مشخص می­کنیم و بر اساس آن مدل داده گرافی را طراحی می­نماییم. برای ارزیابی مدل داده طراحی شده یک تیم متشکل از متخصصان ژنتیک نیز این مدل داده را بررسی کرده و نظر مساعد خود را در خصوص کاربرد این مدل داده برای بیماری های ژنتیکی بیان نمودند. هم­چنین از نرم افزار Neo4j استفاده نمودیم که داده­های مربوط به بیماری ژنتیکی تالاسمی را در آن ذخیره کرده و این مدل داده را بر اساس کارایی ذخیره سازی و بازیابی اطلاعات و زمان پرس و جوها مورد بررسی قرار دادیم که با توجه به زمان پرس و جوها و عدم پشتیبانی سایر مدل داده­ها از روابط بین افراد، این مدل داده مدل مناسبی به شمار می­آید.

کلمات کلیدی: ژن،بیماری های ژنتیکی، پایگاه داده های گرافی،neo4j،مدل داده

                                                                  فهرست مطالب

عنوان                                                                                                                                  صفحه

چکیده

فصل اول: مقدمه. 1

1-۱ پیشگفتار. 2

1- ۲ بیان مسئله. 3

1-3 اهمیت وضرورت انجام تحقيق.. 6

1-4 جنبه جديدبودن ونوآوري درتحقيق.. 7

1-5 اهداف مشخص تحقيق.. 8

1-6 مروری برساختارپایان نامه. 8

فصل دوم: مفاهیم. 9

2-1 مقدمه. 10

2-2 مدل داده چیست؟. 10

2-2-1 مدل های داده ساخت یافته. 12

2-2-1-1 مدل داده رابطه ای.. 12

2-2-1-2 مدل داده شی گرا 14

2-2-1-۳ مدل داده شی رابطه ای.. 16

2-2-2 مدل داده ای غیرساخت یافته. 17

2-2-2-1 مدل داده ای کلید/ارزش… 19

2-2-2-2 مدل داده ای سندگرا 21

2-2-2-3 مدل داده ای ستونی.. 23

2-2-2-4 پایگاه داده های گراف… 24

عنوان                                                                                                                                  صفحه

2-3 مدیریت داده ها 29

2-4 داده های پزشکی.. 30

2-5 کاربردهای مدیریت داده های پزشکی.. 34

2-6 بیماری های ژنتیکی.. 36

2-7 انتقال بیماریهای ژنتیکی.. 37

2-8 آزمایشهای ژنتیکی.. 38

فصل سوم: پیشینه تحقیق.. 42

3-1مقدمه. 43

3-2 مدل داده رابطه ای برای بیماریهای همه گیری.. 43

3-3 مدل داده شی رابطه ای برای بیمارستانها 44

3-4مدل داده گرافی برای بیماری های همه گیری.. 47

فصل چهارم: روش پیشنهادی.. 48

4-1مقدمه. 49

4-2 موجودیتها 53

4-3-صفات مربوط به هریک ازموجودیتها 53

4-3-1انسان سالم. 53

4-3-2انسان ناقل.. 54

4-3-3 انسان درمان شده 54

4-3-4 انسان بیمار. 54

4-3-5پزشک… 55

عنوان                                                                                                                                 صفحه

4-3-6بیماری.. 55

۴-۳-۷علائم. 57

4-3-8 روشهای درمان. 58

4-3-9 دارو. 58

4-4مقادیرذخیره شده برروی یالها 59

4-5تعیین قابلیتهای مدل داده 60

4-5-1ایجادکردن. 60

4-5-2افزودن. 61

4-5-3به روزرسانی.. 61

4-5-4حذف کردن. 61

4-5-5پرس وجو. 62

4-5-5-1پرس وجوهای وابسته به یک گره 62

4-5-5-2پرس وجوهای مربوط به دوگره 66

4-5-5-3پرس وجوهای بیش از دوگره 68

4-6طراحی مدل داده 70

۴-۶-۱ طراحیER. 70

۴-۶-۲ طراحی مدل گرافی.. 72

فصل پنجم: ارزیابی.. 75

5-1 مقدمه. 76

5-2 روش اول: گروه متمرکز. 77

۵-۲-۱ آشنایی باگروه متمرکز. 77

عنوان                                                                                                                                 صفحه

۵-۲-۲ مزایای گروه متمرکز. 77

۵-۲-۳روش شناسی گروه متمرکز. 77

۵-۲-۴ ارزیابی به وسیله ی گروه متمرکز. 79

5-3 روش دوم: پیاده سازی عملی پایگاه داده 79

5-3-1 نرم افزارنئوفرجی.. 80

5-3-2 داده های موردنیاز. 80

5-3-3 ذخیره داده هادرپایگاه داده نئوفرجی.. 81

5-4 نتایج.. 83

فصل ششم:جمع بندی و کارهای آتی.. 90

6-1 جمع بندی وکارهای آتی.. 91

منابع. 97

                                         فهرست جدول ها

عنوان                                                                                                         صفحه

جدول (3-1) : پایگاه داده ی سنتی رابطه ای.. 45

جدول (3-2) : پایگاه دادهEAV.. 45

جدول(3-3) : یک شمای کلیازEAV.. 46

جدول (5-1 ): زمان مربوط به پرس وجوهای مختلف… 85

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

فهرست نمودارها

عنوان                                                                                                                            صفحه

نمودار(۵-۱) پرس و جوهای یک گره………………………………………………………………………………….86

نمودار(۵-۲) پرس و جوهای دو گره…………………………………………………………………………………..87

نمودار(۵-۳) پرس و جوهای سه گره………………………………………………………………………………….87

نمودار(۵-۴) پرس و جوهای تمام گره ها……………………………………………………………………………88

نمودار(۵-۵) مقایسه کمترین-بیشترین و میانگین زمان پرس و جوها……………………………………….89

 

 

 

 

 

 

 

 

 

فهرست شکل ها

عنوان                                                                                                     صفحه

شکل(2-1 ) نمونه ای اولیه از پایگاه داده گراف…………………………………………………….. …………..27

شکل(3-1)پیاده سازی بیماری همه گیری با پایگاه داده رابطه ای……………………………………………44

شکل(3-2)یک پیاده سازی ساده از EAV/CR…………………………………………………………………….46

شکل (3-3) پیاده سازی بیماری همه گیری با پایگاه داده گرافی………………………………. ………….47

شکل (4-1) نمودارER…………………………………………………………………………………………. ……….71

شکل (4-2) پایگاه داده گراف طراحی شده برای بیماری های ژنتیکی……………………………………74

شکل(5-1) نمایش تمام گره ها روابط در پایگاه داده گرافی………………………………………………….82

قبلا حساب کاربری ایجاد کرده اید؟
گذرواژه خود را فراموش کرده اید؟
Loading...
enemad-logo