%41تخفیف

آزمون انساب در جمعیت گوسفندهای دورگه ایستگاه خلعتپوشان به کمک نشانگرهای ریزماهواره

تعداد108صفحه در فایل word

گروه علوم دامی

کارشناسی ارشد در رشته علوم دامی

گرایش ژنتیک و اصلاح دام

آزمون انساب در جمعیت گوسفندهای دورگه ایستگاه خلعتپوشان به کمک نشانگرهای ریزماهواره

کلید واژه:گوسفند دورگه، تعیین هویت، آزمون انساب، نشانگر ژنتیکی، نشانگر ریزماهواره

چکیده: موفقیت در اصلاح دام منوط به ثبت دقیق شجره و رکوردهای فنوتیپی است، در غیر این صورت استفاده از بهترین روشها برای ارزیابی ژنتیکی و برآورد پارامترها، موفقیتی در پی ندارد. در این تحقیق به منظور بررسی و تایید روابط شجرهای تعداد 32 راس دام توسط 5 جایگاه ریزماهواره ای برگرفته از فهرست مشترک انجمن بین المللی ژنتیک (ISAG)که برای آزمون انساب در گوسفند توصیه شده است، در قالب یک واکنش زنجیرهای پلیمراز چندگانه تعیین ژنوتیپ گردیدند.نژادهای مورد بررسی شامل قزل.بلوچی.مرینوس و بلوچی.مغانی.مرینوس میباشد که شامل4 پدر به همراه 28 فرزند جهت آزمون تعیین انساب میباشد. نتایج حاصل از شاخصهای تنوع درون جمعیت و شاخصهای چند شکلی در جایگاههای مورد مطالعه از جمله تعداد آللهای واقعی و موثر، محتوای اطلاعات چندشکلی و هتروزیگوسیتی حاکی از سطح بالایی از تنوع و چندشکلی در جمعیت و جایگاههای مورد بررسی بود. همچنین مقادیر قدرت تشخیص ترکیبی به دست آمده از مجموع این نشانگرها در آنالیز انساب 9999/0 برآورد گردید که بر کارایی این مجموعه در آنالیز انساب و تشخیص هویت در این جمعیت اشاره داشت. نتایج این پزوهش در32 دام مورد بررسی که دارای روابط والدینی مشخص بودند، ثبت نادرست شجره را در 11 راس نشان داد.

دسته: فنی و مهندسی, کشاورزی و منابع طبیعی برچسب: آزمون انساب, تعیین هویت, کلید واژه:گوسفند دورگه, نشانگر ریزماهواره., نشانگر ژنتیکی

توضیحات

فهرست

مقدمه.. 1

فصلاول: بررسی منابع 6

1-1. اهميتثبتدقيقشجره.. 7

1-2.روشهایشناساییدام.. 8

1-2-1. روشهایموقت.. 8

1-2-1-1. پلاکگوش.. 8

1-2-1-2. پلاکگردن.. 9

1-2-1-3. ساقبند.. 9

1-2-1-4. پلاکسینه.. 9

1-2-2. روشهایدائم.. 9

1-2-2-1.خالکوبی.. 9

1-2-2-2. بریدنلبههایگوش.. 10

1-2-2-3.داغزدن.. 10

1-2-2-4. ابزارتعیینهویتالکترونیک (EID).. 11

1-2-2-5. لکه(اسکچ) برداری.. 11

1-3. عواملموثردرثبتنادرستشجره.. 11

1-4. تاريخچهآزمونانساب.. 13

1-4-1. روشهايآناليزوالديني ( آزمونانساب).. 14

1-4-1-1. مستثنيسازي.. 14

1-4-1-2.اختصاصدادنقیاسیوالدین.. 15

1-4-1-3. اختصاصدادنجزئیوالدین.. 17

1-4-1-4. آنالیزوالدینیبااحتمالکامل.. 17

1-4-1-5. بازسازیرابطهوالدینی.. 19

1-4-1-6. بازسازیرابطهخواهرانوبرادرانتنیوناتنی.. 21

1-4-2. موانعتکنیکیوبیولوژیکیآنالیزانساب.. 22

1-4-2-1. آلل‌هایصفر.. 22

1-4-2-2. جهش‌هایوخطاهایتعیینژنوتیپ.. 23

1-4-2-3. ساختارخانوادهدرجمعیت.. 24

1-4-2-4. تعییناطمینانآماریدرانتساب‌هایوالدینی.. 24

1-5. نشانگرهايژنتيكي.. 27

1-5-1.نشانگرهايDNA ‌ 27

1-5-2. رديفهايتكرارشوندهساده.. 28

1-5-3. ريزماهوارهها.. 28

1-5-3-1.تشخيصآللهايريزماهوارهاي.. 29

1-5-3-2. چندشكليريزماهوارهها.. 31

1-5-3-3. مزاياينشانگرريزماهواره.. 32

1-5-3-4. مشكلاتكارباريزماهوارهها.. 33

1-5-3-4-1. انتخابمدلجهشمناسب.. 33

1-5-3-4-2. اشتباهاتآللخواني.. 33

1-5-3-4-3. آللهايصفر.. 34

1-5-3-4-4. اندازهنمونهموردنياز.. 35

1-5-3-5. كاربردهايريزماهوارهها.. 37

1-5-3-5-1. نقشهيابيژنومي.. 37

1-5-3-5-2. تعيينهويت،آزمونانسابوآناليزخويشاوندي.. 37

1-6. مروریبرپژوهشهایصورتگرفتهدرآزمونوالدینی.. 38

1-6-1. پژوهشهایانجامشدهدرگوسفند.. 38

1-6-2. پژوهشهایانجامشدهدرگاو.. 39

1-6-3. پژوهشهایانجامشدهدراسب.. 40

فصلدوم:مواد و روش ها 42

2-1.موقعیتایستگاهتحقیقاتیخلعتپوشانوتعدادنژاد.. 43

2-2. جمعیتموردمطالعه.. 43

2-3. نحوهخونگیری.. 43

2-4.نحوهاستخراجDNA.. 44

2-5.نحوهتستکمیتوکیفیتDNA.. 44

2-6. جایگاههایریزماهوارهایاستفادهشده.. 45

2-7. DNA Pooling. 46

2-8. PCR. 49

2-8-1. چرخههایحرارتیPCR. 50

2-9.نحوهیتهیهژلمتافرآگارز.. 51

2-10. نحوهالکتروفوز.. 52

2-11. تجزیهوتحلیلدادهها.. 54

2-11-1. محاسباتمربوطبهتنوعژنتیکی.. 54

2-11-1-1. تعدادآللهایواقعیوتعدادآللهایموثر.. 54

2-11-1-2. میزانچندشکلی.. 54

2-11-1-3. هتروزیگوسیتییاتنوعژنی:.. 55

2-11-1-4. تعادلهاردی–واینبرگ (HWE).. 55

2-11-1-5.قدرتتشخیص(PE).. 56

2-12.آزمونوالدینی(انساب).. 58

2-12-1. نرمافزارCERVUS. 58

فصلسوم: نتایج و بحث 61

3-1. کمیتوکیفیتDNA.. 62

3-2. عکسژلازژنوتایپجایگاههابهصورتانفرادی.. 63

3-3. پارامترهایجمعیتیحاصلازنشانگرهایمختلف.. 64

3-3-1. چندشکلیمشاهدهشدهدرجایگاههایمختلف.. 64

3-3-1-1.جایگاهILSTS004. 65

3-3-1-2.جایگاهCSSM004. 65

3-3-1-3.جایگاهCSSM032. 66

3-3-1-4.جایگاهOARFCB5. 67

3-3-1-5.جایگاهBMC1009. 68

3-3-2. میانگینآللیجایگاهها.. 68

3-3-3.تعادلهاردی–واینبرگ.. 69

3-3-4. محتویاطلاعاتچندشکلی.. 70

3-3-5. هتروزیگوسیتی.. 71

3-3-6. قدرتتشخیص (PE).. 72

3-4. آنالیزوالدینی.. 73

3-5. نتیجهگیریکلی.. 75

3-6. پیشنهادات.. 75

منابع: 77

ضمائم : 82

پیوستالف: نژادهایمورداستفادهدرتحقیق.. 83

پیوستب.. 83

فهرست جداول

جدول2-1. مشخصاتجایگاههاوپرایمرهایاستفادهشدهدرتکثیراینجایگاهها 46

جدول2-2. میزانآگارزموردنیازبرایباندهایمتفاوت.. 51

جدول2-3. اجزایتشکیلدهندهآگارز. 52

جدول3-1. آزمونتعادلهاردی- واینبرگبانرمافزارCERVUS. 69

جدول3-2. آزمونتعادلهاردی- واینبرگبانرمافزار GENALEX. 70

جدول3-3. مقادیرمیانگیناحتمالمشمولیتحاصلاز 5 جایگاهدرآنالیزهایمتفاوت.. 73

جدول3-4. دادههایحاصلازآزمونوالدینی.. 74

فهرست شکل ها

شکل1-1.پلاکگوشمنبع(حسنیبافرانیوهمکاران، 1386). 8

شکل1-2.داغسرد( حسنیوبافرانی، 1386). 10

شکل1-3.نمونههایازگمشدنشمارهدام)حسنیوبافرانیوهمکاران، 1386). 12

شکل2-1.کاغذوبافرمربوطبهاستخراجDNA( برگرفتهازآزمایشگاهدراسترالیا). 44

شکل2-2.عکسژلمربوطبهDNA Pooling( برگرفتهازآزمایشگاهدراسترالیا). 47

شکل2-3.جایگاههایمونومورف( برگرفتهازآزمایشگاهدراسترالیا). 48

شکل2-4.نتایجمولتیپلکسPCR( برگرفتهازآزمایشگاهدراسترالیا). 48

شکل2-5.ماشینPCR( برگرفتهازآزمایشگاهدراسترالیا). 50

شکل2-6.الکتروفورزمویین( برگرفتهازآزمایشگاهدراسترالیا). 53

شکل2-7.عکسبدستآمدهازمحصولالکتروفورز( برگرفتهازآزمایشگاهدراسترالیا). 53

شکل2-8.محیطنرمافزارCERVUS(یافتهایتحقیق). 59

شکل3-1.الکتروفورزDNAیاستخراجشده. 62

شکل3-2.نتایجبدستآمدهازژنوتایپینگ…. 63

شکل3-3.آللهایبهارثرسیدهدرافراد. 63

شکل3-4.آللهایبهارثرسیدهدرافراد. 64

شکل3-5.آللوفراوانیآللیدرجایگاهILSTS004. 65

شکل3-6.آللوفراوانیآللیدرجایگاهCSSM004. 66

شکل3-7.آللوفراوانیآللیدرجایگاهCSSM032. 67

شکل3-8.آللوفراوانیآللیدرجایگاهOARFCB5. 67

شکل3-9.آللوفراوانیآللیدرجایگاهBMC1009. 68

شکل3-10.مقادیرهتروزیگوسیتیمشاهدهشدهوموردانتظاروچندشکلیدر 5 جایگاهریزماهوارهای.. 72

امتیاز 0 از 5 از 0 دیدگاه

قیمت اصلی 39,000 تومان بود.قیمت فعلی 23,000 تومان است.

تاریخ ایجاد دی 13, 1399
تاریخ بروزرسانی اسفند 13, 1401
فروش 0
دیدگاه 0

شرایط استفاده از محصول

تمام محصولات به ازای پرداخت پروژه تنها قابل استفاده می باشند. این بدین معنی است که برای استفاده از یک یا چند محصول ، لازم به خرید آن محصول است.

مزایای خرید این محصول:

دسترسی به فایل به صورت همیشگی
پشتیبانی رایگان
پشتیبانی 24 ساعته محصول
بازگشت وجه در صورت عدم رضایت مشتری

مشاهده قوانین سایت