%46تخفیف

مکانيابي و اعتبارسنجي ژنهاي کمّي کنترلکننده تحمل به شوري در مرحله گياهچهاي در برنج

مکانيابي و اعتبارسنجي ژنهاي کمّي کنترلکننده تحمل به شوري در مرحله گياهچهاي در برنج

گروه مهندسي بيوتکنولوژي کشاورزي

کارشناسي ارشد رشته مهندسي کشاورزي گرايش بيوتکنولوژي

مکانيابي و اعتبارسنجي ژنهاي کمّي کنترلکننده تحمل به شوري در مرحله گياهچهاي در برنج

چکيده

شوري رشد گياه را در مراحل مختلف از جوانهزني تا رسيدن كامل به درجات مختلف تحت تأثير قرار ميدهد. برنج به شوري نسبتاً حساس ميباشد. تحمل به شوري يك صفت پيچيده ژنتيكي و فيزيولوژيكي و داراي توارث كمي است. به منظور مكانيابي و اعتبارسنجي QTLهاي مرتبط با تحمل به شوري بر روي کروموزومهاي 1 و 10 در مرحله گياهچهاي و تعيين سهم هر مکان ژني در تنوع فنوتيپي، 80 لاين از جمعيت اينبردلاين نوترکيب، حاصل تلاقيIR29 به عنوان والد حساس وPokkali به عنوان والد متحمل، مورد مطالعه قرارگرفتند. پس از بررسي چند شکلي در والدين در نهايت 15 نشانگر چندشکل علاوه بر ناحيه Saltol و ناحيه زير Saltol و نيز روي کروموزوم 10 نظر به اهميت آن در تحمل به شوري، استفاده گرديدند. کروموزوم 1 با طول نقشه كروموزومي 03/55 سانتيمورگان با متوسط فاصله 7/7 سانتيمورگان و کروموزوم 10 با طول نقشه كروموزومي 85/18 سانتيمورگان با متوسط فاصله 65/9 سانتيمورگان نقشهيابي شدند. براي صفات پتاسيم، سديم، نسبت سديم به پتاسيم و امتياز تحمل به شوري روي کروموزم 1 QTLهايي بهدست آمد که براي صفت پتاسيم 2 QTL بزرگاثر، براي صفت سديم يک QTL بزرگاثر، براي نسبت سديم به پتاسيم دو QTL و براي امتياز تحمل به شوري 2 QTL بزرگاثر شناسايي گرديد كه داراي اثرات افزايشي بودند. همچنين نتايج مطالعه 20 رقم برنج ايراني همراه با دو شاهد Pokkali و IR29 تحت تنش شوري با هدايت الکتريکي (0، 6 و 10 دسي زيمنس بر متر) از نظر وضعيت QTLهاي بررسي شده روي کروموزوم 1 از نظر صفات مختلف نشان داد که اختلاف بسيار معنيداري بين ژنوتيپها وجود دارد. تجزيه خوشهاي با ضريب تشابه جاکارد و استفاده از روش UPGMA، ارقام را به 3 گروه حساس، نيمه متحمل و متحمل طبقهبندي کرد. با استفاده از QTL بزرگاثر Saltol براي تحمل به شوري بر روي کروموزوم 1 که در رقم Pokkali نقشهيابي شده، به عنوان مرجع تنوع هاپلوتايپي، ژنوتيپها به 12 گروه هاپلوتيپي مختلف بر اساس QTL ناحيه Saltol طبقهبندي شدند. عليرغم معنيدار بودن نشانگرهاي مولکولي ناحيه Saltol، نتايج بيانگر اين بود که پتانسيل ژرمپلاسم برنجهاي ايراني جهت يافتن ژنهاي جديد تحمل، به غير از ناحيه Saltol، در القاء تحمل به شوري بسيار مهم ميباشند.

کلمات کليدي: برنج، مرحله گياهچهاي، جمعيت اينبرد نوترکيب، مکانيابي QTL، تنوع هاپلوتيپي

دسته: فنی و مهندسی, کشاورزی و منابع طبیعی برچسب: تنوع هاپلوتيپي, جمعيت اينبرد نوترکيب, کلمات کليدي: برنج, مرحله گياهچهاي, مکانيابي QTL

توضیحات

1-1 مقدمه و اهداف. 2

1-2- آشنايي باگياه برنج. 8

1-2-1- تاريخچه کشت برنج. 8

1-2-2- پيشينه برنج درايران. 8

1-2-3- سطح زير کشت برنج در ايران. 8

1-2-4- ژنتيک و گياهشناسي برنج. 9

1-2-5- طبقهبندي زراعي برنج. 10

1-2-6- واريتههاي محلي و پرمحصول. 10

1-2-7- اندامهاي رويشي گياه برنج . 10

1-2-8- اندامهاي زايشي گياه برنج. 11

1-2-9- خواص دانه برنج. 12

1-2-10-مدت رويش گياه. 13

1-2-11- شرايط محيطي مناسب براي رويش برنج. 13

1-2-12- اهميت اقتصادي برنج. 14

1-3- مروري بر شوري. 14

1-3-1- تعريف شوري. 15

1-3-2- مشکلات ناشي از شوري در گياهان. 16

1-3-3- اثرات شوري. 17

الف- اثر شوري بر جوانه زني گياه. 17

ب- اثر شوري بر رشد رويشي. 17

ج- شوري و فتوسنتز. 18

د- اثر شوري بر غلظت قندهاي احيا شونده. 19

1-3-4- چگونگي درک تنش در گياه. 19

1-3-5- مکانيسمهاي تحمل به شوري. 20

الف- کنترل شوري در سطح گياه کامل. 20

ب- کنترل شوري در سطح سلولي. 21

ج- کنترل شوري در سطح مولکولي (مکانيسم ژنتيکي تحمل به شوري) 23

1-3-6- علايم شوري و تأثير آن بر رشد گياه برنج. 24

1-3-7- تحمل به شوري در گياه برنج. 24

1-3-8- اصلاح تحمل به شوري. 27

1-3-9- ضرورت اصلاح تحمل به شوري. 28

1-3-10- تنوع ژنتيکي در تحمل به شوري. 29

1-3-11- ارزيابي تحمل به شوري. 30

1-3-12- رهيافت بيوتکنولوژيکي براي تحمل به شوري. 31

1-4- نشانگرهاي مورد استفاده در تجزيه QTL. 33

1-4-1- نشانگر‌هاي ژنتيكي. 33

1-4-1-1- نشانگر‌هاي مورفولوژيكي. 33

1-4-1-2- نشانگرهاي مولكولي. 34

الف – نشانگر‌هاي بيوشيميايي. 34

ب- نشانگر‌هاي DNA. 35

1-5- نشانگرهاي SSR. 37

1-5-1- مزايا و خصوصيات نشانگرهاي SSR. 38

1-5-2-كاربرد‌هاي ماركر SSR. 39

1-6- نشانگرهاي مبتني بر ژن‌هاي كانديد. 39

نقشههاي پيوستگي ژنتيکي. 40

1-8- تجزيه ژنتيکي صفات کمي. 41

1-9- اصول مکانيابي QTL. 41

1-9-1- جمعيتهاي در حال تفرق . 41

1-9-2 مقايسه انواع مختلف جمعيتهاي نقشهيابي. 43

1-9-3- روشهاي آماري براي مکانيابي QTL. 45

الف- روشهاي مبتني بر صفت. 45

ب- روش هاي مبتني بر نشانگر. 46

1-10- روش تجزيه تک نشانگري. 46

1-11- روش نقشهيابي فاصلهاي. 46

1-12- نقشهيابي فاصلهاي مركب . 47

1-13- نرمافزارهاي مورد استفاده در تجزيه QTL. 51

1-14- انتخاب به کمک نشانگر. 53

1-15- تنوع هاپلوتيپي. 54

فصل دوم

2-1- تهيه نمونههاي گياهي. 56

2-2- ارزيابي فنوتيپي جمعيت اينبرد نوترکيب. 56

2-3- ارزيابي فنوتيپي ارقام ايراني. 58

2-4- استخراج DNAژنومي. 59

2-4-1- تعيين كميت و كيفيت DNA. 60

2-4-1-الف- روش اسپكتروفتومتري. 60

2-4-1-ب- روش الكتروفورز ژل آگاروز. 61

2-5- ريزماهوارهها. 61

2-6- محتويات و برنامه واکنش زنجيره اي پليمراز(PCR). 63

2-7- تهيه ژل پلياکريلآميد. 64

2-8- الکتروفورز و رنگآميزي. 65

2-9- تجزيه آماري داده‌ها. 65

2-9-1- بررسي تنوع ژنتيکي ارقام ايراني. 65

2-9-2- ترسيم نقشه يابي ژنتيکي و مکان يابي QTLها. 67

فصل سوم

3-1- مکانيابي ژنهاي کنترلکننده تحمل به شوري در جمعيت اينبرد نوترکيب برنج. 69

3-1-1- ارزيابي فنوتيپي جمعيت اينبرد نوترکيب. 69

3-1-2- ترسيم نقشه پيوستگي. 73

3-1-3- نتايج تجزيه تک نشانگري. 74

3-1-4- نتايج مکانيابي فاصلهاي مرکب. 75

3-2- بررسي تنوع هاپلوتايپي ناحيه Saltol و ناحيه پايين آن در ارقام برنج ايراني. 79

3-2-1- ارزيابي تنوع فنوتيپي ارقام برنج ايراني. 79

3-2-2- ارزيابي ارقام برنج ايراني با استفاده از شاخصهاي تحمل به شوري. 87

3-2-3- بررسي تنوع هاپلوتايپي ناحيه کروموزومي Saltol ارقام برنج ايراني 91

پيشنهادات. 95

منابع و م‍‍آخذ:. 96

امتیاز 0 از 5 از 0 دیدگاه

قیمت اصلی: 39,000 تومان بود.قیمت فعلی: 21,000 تومان.

تاریخ ایجاد دی 20, 1399
تاریخ بروزرسانی اسفند 13, 1401
فروش 0
دیدگاه 0

شرایط استفاده از محصول

تمام محصولات به ازای پرداخت پروژه تنها قابل استفاده می باشند. این بدین معنی است که برای استفاده از یک یا چند محصول ، لازم به خرید آن محصول است.

مزایای خرید این محصول:

دسترسی به فایل به صورت همیشگی
پشتیبانی رایگان
پشتیبانی 24 ساعته محصول
بازگشت وجه در صورت عدم رضایت مشتری

مشاهده قوانین سایت