انتشار فیلوژنتیکی جدایه های اشریشیاکلی واجد ژنهای کد کننده شیگا توکسین و انتیمین در مدفوع بلدرچین های سالم

فهرست مطالب

خلاصه فارسی……………………………………………………………………………………………………………

فصل اول:  مقدمه و هدف

مقدمه و هدف …………………………………………………………………………………………………………….0

فصل دوم: کلیات و مروری بر منابع موجود

1-2- کلیاتی در مورد سویه های تولید کننده شیگاتوکسین ((STEC اشریشیاکلی………………….5

1-1-2- وروتوكسين ها يا توكسين هاي شبيه شيگا  …………………………………………………………..5

2-1-2-  ژنتيك وروتوكسين    ………………………………………………………………………………………7

3-1-2- ساختمان وروتوكسين ها  ………………………………………………………………………………….8

4-1-2- ناهمگونی سویه های تولید کننده شیگاتوکسین   ………………………………………………….10

5-1-2- نامگذاری سویه های تولید کننده شیگاتوکسین  …………………………………………………..11

6-1-2-  اپیدمیولوژی پاتوتیپ تولید کننده شیگاتوکسین…………………………………………………..12

7-1-2- منابع انتشار سویه های تولید کننده شیگاتوکسین ………………………………………………….15 2-2- کلیاتی در مورد بلدرچین  ……………………………………………………………………………………16

1-2-2- تاریخچه  ……………………………………………………………………………………………………..17

2-2-2-  شروع پرورش در جهان   ……………………………………………………………………………….17

3-2-2- شروع پرورش در ایران  ………………………………………………………………………………….18

4-2-2- جانور شناسی  ……………………………………………………………………………………………….19

5-2-2- نژادهای بلدرچین  ………………………………………………………………………………………….19

6-2-2- ویژگیهای عمومی بلدرچین  …………………………………………………………………………….21

7-2-2- جنبه های اقتصادی………………………………………………………………………………………….24

8-2-2- نکاتی در مورد شروع صنعتی پرورش  ……………………………………………………………….25

9-2-2- وسایل مورد نیاز برای نگهداری جوجه های بلدرچین   …………………………………………28

10-2-2- تغذیه بلدرچین  …………………………………………………………………………………………..30

11-2-2-  فراوری و بسته بندی گوشت و تخم بلدرچین ها   ……………………………………………..32

3-2- کلیاتی در مورد بیماری های بلدرچین   ………………………………………………………………….34

1-3-2- کلی باسیلوز در بلدرچین و طیور  ……………………………………………………………………..35

2-3-2- اشکال دیگر کلی باسیلوز در طیور  …………………………………………………………………..41

3-3-2- بیماری نیوکاسل  …………………………………………………………………………………………..42

4-3-2 -آنفلوانزا ……………………………………………………………………………………………………….45

5-3-2- برونشیت بلدرچین ………………………………………………………………………………………….46

6-3-2- بیماری آسپرژیلوز ………………………………………………………………………………………….50

فصل سوم: مواد  و روش کار

1-3- مواد و وسایل مورد استفاده  …………………………………………………………………………………54

2-3- روش‌کار  ………………………………………………………………………………………………………..55

1-2-3- جمع آوری و تقسیم بندی نمونه‌ها  ……………………………………………………………………55

2-2-3- كشت نمونه‌ها و جدا سازی اشریشياکلی  ……………………………………………………………55

3-2-3- تأیید نمونه‌هاي اشریشیاکلی   …………………………………………………………………………..56

4-2-3- ذخیره نمونه‌ها  ………………………………………………………………………………………………56

5-2-3- آزمایش PCR  …………………………………………………………………………………………….57

1-5-2-3- استخراج DNA  ………………………………………………………………………………………57

2-5-2-3- آزمایش PCR جهت شناسایی ژنهای کد کننده شیگا توکسین و انتیمین   ……………57

3-5-2-3-  آزمایش PCR جهت تعیین گروه و تحت گروه فیلوژنی  …………………………………59

4-5-2-3-  شناسایی و آنالیز محصولات PCR  ……………………………………………………………..61

1-4-5-2-3- مراحل انجام الکتروفورز  …………………………………………………………………………61

3-3- تعيين حساسيت آنتي‌بيوتيكي  ………………………………………………………………………………64

فصل چهارم: نتایج

1-4- تعیین درصد جدایه های اشریشیاکلی در گروه های فیلوژنی   …………………………………….67

2-4- انتشار جدایه ها از مدفوع بلدرچین در تحت گروههای فیلوژنی  …………………………………68

3-4- نتیجه آزمایش PCR جهت شناسایی ژن های eae ، stx1 وstx2  ……………………………70

4-4- انتشار فیلوژنی جدایه های اشریشیاکلی مثبت از نظر stx1 ،eae و stx2   ……………………71

5-4- تعیین حساسیت آنتی بیوتیکی جدایه ها  …………………………………………………………………73

فصل پنجم : بحث و نتیجه گیری

نتیجه گیری …………………………………………………………………………………………………………….. 76

پیشنهادات  …………………………………………………………………………………………………………………..

منابع …………………………………………………………………………………………………………………….83

خلاصه انگلیسی  …………………………………………………………………………………………………..90

فهرست جداول

جدول 1-3- پرایمرها و سویه‌های استاندارد در مولتی پلکس PCR ژن های stx1، stx2  و eae  ……………………………………………………………………………………………………………………..58

جدول 2-3- پرایمرها و سویه‌های استاندارد به کار رفته در PCR فیلوژنی ………………………….60

جدول 3-3- گروه های مختلف فیلوژنی ………………………………………………………………………61

جدول 4-3- آنتی بیوتیک های استفاده شده و منطقه ممانعت از رشد آن‌ها………………………….65

جدول 1-4- تعداد و درصد سویه های اشریشیاکلی در گروه های فیلوژنی از مدفوع بلدرچین سالم ……………………………………………………………………………………………………………………..67

جدول 2-4- تعداد و درصد سویه های اشریشیاکلی در  تحت گروه های فیلوژنی از مدفوع بلدرچین سالم ………………………………………………………………………………………………………….69

جدول 3-4- انتشار ژن های  eae ,stx1, stx2 در جدایه مثبت براساس گروه و تحت گروه فيلو‍‍‍ژني  …………………………………………………………………………………………………………………72

جدول 4-4-تعداد و درصد جدایه‌های حساس، نیمه حساس و مقاوم  نسبت به9 آنتی‌بیوتیک …………………………………………………………………………………………………………………………….74

فهرست نمودارها و تصاویر

الف – فهرست نمودارها

نمودار 1-4- تعداد و درصد سویه های اشریشیاکلی در گروه های فیلوژنی از مدفوع بلدرچین سالم……………………………………………………………………………………………………………………….68

نمودار 2-4- تعداد و درصد سویه های اشریشیاکلی در  تحت گروه های فیلوژنی از مدفوع بلدرچین سالم ………………………………………………………………………………………………………….69

نمودار 3-4- انتشار ژن های  eae ,stx1, stx2 در جدایه مثبت براساس گروه و تحت گروه فيلو‍‍‍ژني ………………………………………………………………………………………………………………….72

نمودار 4-4- درصد جدایه‌های حساس نسبت به9 آنتی‌بیوتیک………………………………………….74

نمودار 5-4- درصد جدایه‌های مقاوم  نسبت به9 آنتی‌بیوتیک  …………………………………………75

ب- فهرست تصاویر

تصویر1-4-  نتیجه آزمایش PCR جهت تعیین تحت گروههای فیلوژنی …………………………..70

تصویر2-4- نتیجه آزمایش PCR نمونه های مثبت از نظر ژن های stx1 ،stx2 وeae  ……………………………………………………………………………………………………………………………..73