فهرست مطالب
چکیده 1
فصل اول: مقدمه. 2
1-1 بیان مسئله اساسی تحقیق.. 3
1-2 اهمیت و ضرورت انجام تحقیق.. 6
1-3 اهداف پایان نامه. 8
1-4 ساختار پایان نامه. 9
فصل دوم: مروری بر کارهای پیشین.. 10
2-1 مقدمه. 11
2-2 مروری بر تحقیقات انجام شده در زمینه پردازش تصاویر پزشکی.. 12
2-2-1 بازیابی مبتنی برمحتوای تصاویر رادیوگرافی براساس هیستوگرام جهت الگو. 12
2-2-2 استفاده از روش تشخیص لبه برای محاسبه پارامتر سطح در استاندارد PASI. 13
2-2-3 طراحی سیستم کمک تشخیصی کامپیوتری نوین به منظور شناسایی ندول های ریوی در تصاویر سیتیاسکن 17
2-2-4 یک روش اتوماتیک جهت اندازه گیری زاویه بین مهره های ستون فقرات… 18
2-2-5 تشخیص ناهنجاری های ستون فقرات… 19
2-2-6 تشخیص تودهها در تصاویر ماموگرافی.. 21
2-3 مروری بر تحقیقات انجام شده در زمینه پردازش تصاویر پزشکی میکروسکوپی.. 23
2-3-1 آنالیز تصاویر میکروسکوپی مبتنی بر پردازش تصویر. 23
2-3-2 استخراج اتوماتیک هسته و سیتوپلاسم سلول های سفید خون از تصاویر لام محیطی.. 23
2-4 مروری بر تحقیقات انجام شده در زمینه قارچشناسی.. 26
2-4-1 مقدمه های بر قارچشناسی پزشکی.. 26
2-4-2 مروری بر تحقیقات انجام شده در زمینه استفاده از پردازش تصویر در تعیین خصوصیات مورفولوژی قارچ ها 29
2-4-3 آزمایش مستقیم میکروسکوپی در تعیین مخمر مالاسزیا در شوره سر و تشخیص سریع حالت تهاجمی قارچ 32
2-4-4 شناسایی مورفولوژیک و ژنوتیپیک برخی نمونههای آسپرژیلوس محیطی در ایران براساس توالی ژن بتاتوبولین 34
2-5 خلاصه. 36
فصل سوم: مقدمهای بر پردازش تصویر و مفاهیم آن. 37
3-1 مقدمه. 38
3-2 بازیابی تصویر براساس محتوا 40
3-2-1 بازیابی تصویر براساس رنگ… 41
3-3 پیشپردازش تصویر. 42
3-3-1 تبدیل تصویر رنگی به تصویر سطح خاکستری.. 42
3-3-2 نویز تصویر و انواع آن. 45
3-3-3 فیلترهای تیز کننده تصویر. 46
3-3-4 گرادیان محلی LBP. 48
3-4 کاربرد رنگ در پردازش تصویر. 50
3-4-1 فضای رنگRGB.. 51
3-4-2 فضای رنگ HSL.. 53
3-4-3 فضای رنگ HSV.. 53
3-4-4 هیستوگرام رنگ تصویر. 55
3-5 نحوه محاسبه گرادیانهای لبه تصویر. 57
3-5-1 کانولوشن.. 57
3-5-2 لبه تصویر. 57
3-5-3 اپراتور سوبل.. 59
3-5-4 اپراتور رابرتز. 62
3-6 خلاصه. 65
فصل چهارم: روش پیشنهادی در تشخیص قارچ ناشناخته. 66
4-1 مقدمه. 67
4-2 استخراج خصیصه رنگ تصویر. 69
4-3 ارتقای تصویر. 71
4-3-1 تبدیل تصویر RGB به تصویر سطح خاکستری.. 71
4-3-2 حذف نویز گاوسی.. 72
4-3-3 تیز کردن لبههای تصویر. 72
4-3-4 عملگر گرادیان لبه LBP. 73
4-4 محاسبه گرادیان لبههای تصویر. 75
4-4-1 عملگر گرادیانهای افقی و عمودی سوبل.. 75
4-4-2 عملگر گرادیانهای قطری رابرتز. 76
4-5 خلاصه. 79
فصل پنجم: نرمافزار طراحی شده جهت تخمین گونه قارچ ناشناخته. 80
5-1 مقدمه. 81
5-2 نحوه ساخت پایگاه دادهای از تصاویر. 82
5-3 آشنایی با محیط کاربری نرمافزار و گزینههای مختلف آن. 84
5-3-1 دکمه START. 84
5-3-2 دکمه LOAD.. 84
5-3-3 افزودن گونه قارچی جدید. 84
5-3-4 افزودن تصویر جدید. 84
5-3-5 دکمه SAVE.. 85
5-3-6 حذف گونه قارچی.. 85
5-3-7 حذف تصویر از یک گونه قارچی.. 85
5-4 نحوه استفاده از موتور جستجو جهت تخمین گونه قارچ ناشناخته و واکشی تصاویر مربوطه. 87
5-5 خلاصه. 88
فصل ششم: ارزیابی کارایی روش پیشنهادی.. 89
6-1 مقدمه. 90
6-2 ارزیابی روش پیشنهادی.. 92
6-2-1 معیارهای دقت و فراخوانی.. 92
6-2-2 معیار ANMRR.. 93
6-3 معیارهای فاصله. 95
6-3-1 معیار فاصله Canberra. 95
6-3-2 معیار فاصله Euclidean. 96
6-3-3 معیار فاصله Manhattan. 96
6-3-4 معیار فاصله Bray Curtis. 97
6-4 نتایج بدست آمده از توابع فاصله مختلف… 98
6-5 معادله بهینه. 103
6-6 خلاصه. 104
فصل هفتم: نتیجهگیری و کارهای آینده. 105
7-1 مقدمه. 106
7-2 جمعبندی و نتیجهگیری.. 107
7-3 پیشنهادات و کارهای آینده 108
پیوست1: اطلس قارچشناسی.. 109
پیوست2: آشنایی با میکروسکوپ نوری الکتریکی آزمایشگاهی.. 125
فهرست منابع.. 128
واژهنامه. 132
فهرست جدولها
جدول 2-1 درجه PASI [9] 16
جدول 6-1 تعداد نتایج درست حاصل از محاسبه فاصله Canberra بین بردارهای ویژگی تصاویر پس از اعمال فیلتر لاپلاسین.. 99
جدول 6-2 تعداد نتایج درست حاصل از محاسبه فاصله Canberra بین بردارهای ویژگی تصاویر پس از اعمال عملگر lbp 99
جدول 6-3 تعداد نتایج درست حاصل از محاسبه فاصله Euclidean بین بردارهای ویژگی تصاویر پس از اعمال فیلتر لاپلاسین.. 99
جدول 6-4 تعداد نتایج درست حاصل از محاسبه فاصله Euclidean بین بردارهای ویژگی تصاویر پس از اعمال عملگر lbp 100
جدول 6-5 تعداد نتایج درست حاصل از محاسبه فاصله Manhattan بین بردارهای ویژگی تصاویر پس از اعمال فیلتر لاپلاسین.. 100
جدول 6-6 تعداد نتایج درست حاصل از محاسبه فاصله Manhattan بین بردارهای ویژگی تصاویر پس از اعمال عملگر lbp. 100
جدول 6-7 تعداد نتایج درست حاصل از محاسبه فاصله Bray Curtis بین بردارهای ویژگی تصاویر پس از اعمال فیلتر لاپلاسین.. 100
جدول 6-8 تعداد نتایج درست حاصل از محاسبه فاصله Bray Curtis بین بردارهای ویژگی تصاویر پس از اعمال عملگر lbp. 101
فهرست نمودارها
نمودار6-2 مقایسه نتایج بدست آمده حاصل از اعمال معیارهای فاصله مختلف برای یافتن فاصله بردارهای C، SS،ST، RS وRT میانگین با بردارهای C، SS،ST، RS وRT تصویر پرس و جو. 101
نمودار 6-1 مقایسه نتایج بدست آمده حاصل از اعمال معیارهای فاصله مختلف برای یافتن فاصله بردارهای اجتماع میانگین با بردار اجتماع تصویر پرس و جو. 102
فهرست شکلها
شکل 2-1 نمودار فضای رنگی CIELAB [9] 14
شکل 3-1 تصویر باینری.. 42
شکل 3-2 تصویر سطح خاکستری.. 43
شکل 3-3 تصویر RGB.. 44
شکل 3-4 تبدیل تصویر رنگی به تصویر سطح خاکستری.. 44
شکل 3-5 تاثیر انواع نویز بر تصویر. 46
شکل 3-6 تاثیر انواع فیلتر بر تصویر. 47
شکل 3-7 مثالی از اعمال فیلتر 3*3 lbp 48
شکل 3-8 تصویر حاصل از اعمال عملگر لبه یابی lbp. 49
شکل 3-9 فضای رنگ RGB [27] 51
شکل 3-10 ترکیب های مختلف رنگی در فضای رنگی RGB.. 52
شکل 3-11 فضای رنگ HSL.. 53
شکل 3-12 فضای رنگ HSV [20]. 54
شکل 3-13 نمودار هیستوگرام تصویر. 56
شکل 3-14 نمونه ای از لبه های تصویر. 58
شکل 3-15 نمونه ای از لبه یابی تصویر با استفاده از فیلتر سوبل.. 62
شکل 3-16 نمونه ای از لبه یابی تصویر با فیلتر رابرتز. 64
شکل 4-1 فلوچارت محاسبه بردار CV از هیستوگرام رنگ تصویر. 70
شکل 4-2 فلوچارت روش پیشنهادی -مرحله دوم/1. 73
شکل 4-3 فلوچارت روش پیشنهادی-مرحله سوم/1 74
شکل 4-4 فلوچارت روش پیشنهادی مرحله دوم/2. 77
شکل 4-5 فلوچارت روش پیشنهادی مرحله سوم/2. 78
شکل 5-1 رابط کاربر طراحی شده برای ساخت پایگاه داده تصاویر. 83
شکل 5-2 رابط کاربر طراحی شده برای تخمین گونه قارچ ناشناخته. 87
شکل 6-1نحوه محاسبه فاصله دو نقطه با کمک تابع فاصله منهتن.. 97
فهرست علائم اختصاری
CBIR |
content based image retrieval |
RGB |
Red, Green, Blue |
LBP |
Local Binary Pattern |
HSL |
Hue, Saturation, Lightness |
HSV |
Hue, Saturation ,Value |
ANMRR |
Average Normalized Modified Retrieval Rank |